More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3731 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3731  protease DO  100 
 
 
476 aa  952    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.233243  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  61 
 
 
458 aa  541  9.999999999999999e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  53.23 
 
 
465 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  52.5 
 
 
457 aa  413  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  51.03 
 
 
460 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  49.45 
 
 
450 aa  393  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  49.55 
 
 
453 aa  392  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  49.45 
 
 
450 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  49.45 
 
 
450 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  48.91 
 
 
450 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  47.83 
 
 
449 aa  390  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  48.05 
 
 
451 aa  385  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  47.84 
 
 
450 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  50.11 
 
 
450 aa  388  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  47.84 
 
 
450 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  47.62 
 
 
450 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  48.31 
 
 
458 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  47.84 
 
 
450 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  47.92 
 
 
450 aa  381  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  47.16 
 
 
451 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  48.05 
 
 
449 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  47.7 
 
 
450 aa  374  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  48.25 
 
 
446 aa  369  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  47.31 
 
 
473 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2479  protease Do  49.08 
 
 
450 aa  364  2e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  46.49 
 
 
455 aa  362  8e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  46.36 
 
 
455 aa  362  1e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  47.5 
 
 
455 aa  362  1e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  47.25 
 
 
456 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03424  protease do  45 
 
 
478 aa  356  5e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  47.6 
 
 
469 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  47.06 
 
 
456 aa  353  5e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  42.06 
 
 
459 aa  352  1e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3800  protease Do  45.22 
 
 
456 aa  343  5e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00053297  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0267  protease Do  46.38 
 
 
477 aa  342  5.999999999999999e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.326354  normal  0.464292 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3669  serine endoprotease  44.32 
 
 
455 aa  341  2e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0364754  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3642  protease Do  44.85 
 
 
456 aa  340  4e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.393796  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4352  protease Do  45.02 
 
 
456 aa  338  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208163  decreased coverage  0.00128029 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  42.92 
 
 
455 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3530  serine endoprotease  43.79 
 
 
455 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00269541  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03094  serine endoprotease, periplasmic  43.79 
 
 
455 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0472  protease Do  43.79 
 
 
455 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00978488  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3542  serine endoprotease  43.79 
 
 
455 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03045  hypothetical protein  43.79 
 
 
455 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.471822  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1196  protease Do  43.2 
 
 
451 aa  337  2.9999999999999997e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0472  serine endoprotease  43.79 
 
 
455 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0649674  normal  0.0819783 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3646  serine endoprotease  42.92 
 
 
455 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  44.39 
 
 
463 aa  337  2.9999999999999997e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3423  serine endoprotease  43.79 
 
 
455 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3717  serine endoprotease  43.79 
 
 
455 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000159943  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  42.92 
 
 
455 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  44.39 
 
 
457 aa  337  3.9999999999999995e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  42.92 
 
 
455 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  44.13 
 
 
456 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  44.39 
 
 
457 aa  337  3.9999999999999995e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0769  endopeptidase  43.2 
 
 
451 aa  336  5e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4551  serine endoprotease  43.57 
 
 
455 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00837947  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0789  serine endoprotease  42.95 
 
 
476 aa  333  4e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.290182 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  42.79 
 
 
451 aa  333  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0250  heat shock protein  44.78 
 
 
481 aa  333  5e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0220  protease Do  44.55 
 
 
481 aa  333  5e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.850727  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  43.23 
 
 
462 aa  329  8e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0029  serine protease  44.2 
 
 
460 aa  328  1.0000000000000001e-88  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0248  serine endoprotease  42.02 
 
 
478 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0232  serine endoprotease  42.02 
 
 
475 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0586414  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0246  serine endoprotease  42.02 
 
 
475 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.561258  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0229  serine endoprotease  42.02 
 
 
475 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0230  serine endoprotease  42.02 
 
 
478 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  41.65 
 
 
474 aa  326  7e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  41.43 
 
 
474 aa  325  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0289  protease Do  43.91 
 
 
456 aa  325  1e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0319386  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  41.43 
 
 
474 aa  325  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  41.43 
 
 
474 aa  324  2e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  41.43 
 
 
474 aa  324  2e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3323  serine endoprotease  42.36 
 
 
481 aa  324  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00403874  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2934  trypsin-like serine protease  50.15 
 
 
374 aa  324  2e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1181  serine endoprotease  43.08 
 
 
487 aa  324  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  41.43 
 
 
474 aa  324  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3452  serine endoprotease  42.36 
 
 
481 aa  324  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342049  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  41.43 
 
 
474 aa  324  2e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  41.43 
 
 
474 aa  324  3e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  42.35 
 
 
496 aa  324  3e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3096  serine endoprotease  43.05 
 
 
485 aa  322  8e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.916772  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0987  serine endoprotease  42.15 
 
 
481 aa  322  9.000000000000001e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0018316  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00159  hypothetical protein  40.98 
 
 
474 aa  318  1e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0024  peptidase  53.01 
 
 
381 aa  318  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.02023  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1042  serine endoprotease  43.15 
 
 
482 aa  317  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.88791  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1284  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  43.35 
 
 
466 aa  316  7e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1285  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  43.35 
 
 
466 aa  313  3.9999999999999997e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  41.03 
 
 
479 aa  311  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2805  serine endoprotease  43.99 
 
 
476 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3032  Serine protease do-like precursor  52.53 
 
 
365 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.722688 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  50.77 
 
 
385 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  43.19 
 
 
476 aa  299  7e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.78 
 
 
396 aa  298  1e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.59 
 
 
412 aa  296  4e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.99 
 
 
398 aa  296  7e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1651  protease Do  40.05 
 
 
492 aa  296  8e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  37.76 
 
 
476 aa  294  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  39.96 
 
 
468 aa  294  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>