More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0250 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0250  heat shock protein  100 
 
 		 481 aa  959    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03424  protease do  77.83 
 
 		 478 aa  722    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0220  protease Do  98.54 
 
 		 481 aa  944    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.850727  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0267  protease Do  72.9 
 
 		 477 aa  667    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.326354  normal  0.464292 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  46.24 
 
 		 465 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  46.94 
 
 		 460 aa  352  1e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  48.3 
 
 		 458 aa  340  5e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  43.33 
 
 		 449 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  46.79 
 
 		 473 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  43.35 
 
 		 474 aa  330  4e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  43.35 
 
 		 474 aa  330  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  43.35 
 
 		 474 aa  330  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  43.35 
 
 		 474 aa  329  6e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  43.35 
 
 		 474 aa  329  6e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  43.35 
 
 		 474 aa  329  6e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  43.35 
 
 		 474 aa  329  6e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  43.44 
 
 		 474 aa  329  7e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  43.47 
 
 		 451 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  45.73 
 
 		 456 aa  327  3e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  44.85 
 
 		 446 aa  326  6e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  45.16 
 
 		 457 aa  325  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  45.16 
 
 		 463 aa  325  1e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  45.16 
 
 		 457 aa  325  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  43.12 
 
 		 450 aa  324  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00159  hypothetical protein  42.92 
 
 		 474 aa  324  3e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  43.79 
 
 		 496 aa  323  4e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  45.5 
 
 		 458 aa  323  5e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  42.56 
 
 		 450 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  44.81 
 
 		 455 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  42.86 
 
 		 453 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  42.56 
 
 		 450 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  42.56 
 
 		 450 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3731  protease DO  44.44 
 
 		 476 aa  320  1.9999999999999998e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.233243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  43.41 
 
 		 455 aa  318  9e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  41.88 
 
 		 450 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  41.88 
 
 		 450 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  41.88 
 
 		 450 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  43.41 
 
 		 455 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3646  serine endoprotease  43.41 
 
 		 455 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  43.41 
 
 		 455 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  46.17 
 
 		 455 aa  318  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  42.43 
 
 		 449 aa  317  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0230  serine endoprotease  43.01 
 
 		 478 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0232  serine endoprotease  43.01 
 
 		 475 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0586414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0248  serine endoprotease  43.01 
 
 		 478 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0229  serine endoprotease  43.01 
 
 		 475 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0789  serine endoprotease  42.35 
 
 		 476 aa  317  3e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.290182 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0246  serine endoprotease  43.01 
 
 		 475 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.561258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  44.29 
 
 		 451 aa  317  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  44.14 
 
 		 455 aa  317  4e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3530  serine endoprotease  43.18 
 
 		 455 aa  316  5e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00269541  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  41.88 
 
 		 450 aa  316  6e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03094  serine endoprotease, periplasmic  43.18 
 
 		 455 aa  316  7e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0472  protease Do  43.18 
 
 		 455 aa  316  7e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00978488  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03045  hypothetical protein  43.18 
 
 		 455 aa  316  7e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.471822  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3542  serine endoprotease  43.18 
 
 		 455 aa  316  7e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3717  serine endoprotease  43.18 
 
 		 455 aa  316  7e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000159943  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0472  serine endoprotease  43.18 
 
 		 455 aa  316  7e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0649674  normal  0.0819783 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3423  serine endoprotease  43.18 
 
 		 455 aa  316  7e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4551  serine endoprotease  43.18 
 
 		 455 aa  315  8e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00837947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  41.65 
 
 		 450 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  43.96 
 
 		 457 aa  315  9.999999999999999e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  42 
 
 		 451 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  41.96 
 
 		 450 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  41.55 
 
 		 450 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3669  serine endoprotease  42.53 
 
 		 455 aa  311  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0364754  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  42.15 
 
 		 456 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  44.32 
 
 		 456 aa  310  5e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  43.6 
 
 		 462 aa  309  5.9999999999999995e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3096  serine endoprotease  42.28 
 
 		 485 aa  307  3e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.916772  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3323  serine endoprotease  41.68 
 
 		 481 aa  306  7e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00403874  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3452  serine endoprotease  41.68 
 
 		 481 aa  306  7e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342049  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2479  protease Do  49.05 
 
 		 450 aa  306  7e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0987  serine endoprotease  41.68 
 
 		 481 aa  305  8.000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0018316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3800  protease Do  43.24 
 
 		 456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00053297  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4352  protease Do  44.42 
 
 		 456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208163  decreased coverage  0.00128029 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  43.82 
 
 		 469 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0029  serine protease  41.59 
 
 		 460 aa  305  2.0000000000000002e-81  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1181  serine endoprotease  41.11 
 
 		 487 aa  301  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3642  protease Do  43.05 
 
 		 456 aa  300  4e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.393796  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  42.12 
 
 		 459 aa  296  4e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0289  protease Do  44 
 
 		 456 aa  296  7e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0319386  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  42.31 
 
 		 464 aa  296  7e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2934  trypsin-like serine protease  49.52 
 
 		 374 aa  291  1e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2805  serine endoprotease  40.61 
 
 		 476 aa  292  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  43.18 
 
 		 463 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1042  serine endoprotease  39.66 
 
 		 482 aa  286  5.999999999999999e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.88791  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1196  protease Do  41.08 
 
 		 451 aa  284  3.0000000000000004e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0769  endopeptidase  41.08 
 
 		 451 aa  283  5.000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0024  peptidase  49.38 
 
 		 381 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.02023  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3032  Serine protease do-like precursor  49.52 
 
 		 365 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.722688 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  39.05 
 
 		 476 aa  277  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  43.11 
 
 		 496 aa  278  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  42.28 
 
 		 463 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  38.86 
 
 		 471 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  46.67 
 
 		 385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1284  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  39.64 
 
 		 466 aa  274  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  39.53 
 
 		 468 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1285  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  39.64 
 
 		 466 aa  273  4.0000000000000004e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  42.17 
 
 		 476 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>