More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2934 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2934  trypsin-like serine protease  100 
 
 
374 aa  733    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3032  Serine protease do-like precursor  70.54 
 
 
365 aa  475  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.722688 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  53.95 
 
 
458 aa  359  5e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  56 
 
 
460 aa  354  1e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  52.02 
 
 
465 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  53.82 
 
 
457 aa  351  1e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  50.95 
 
 
473 aa  344  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  56.57 
 
 
469 aa  343  2e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  51.92 
 
 
458 aa  331  1e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0024  peptidase  56.7 
 
 
381 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.02023  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2479  protease Do  54.08 
 
 
450 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3731  protease DO  47.48 
 
 
476 aa  311  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.233243  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  45.89 
 
 
451 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  45.63 
 
 
455 aa  309  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  47.18 
 
 
456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3646  serine endoprotease  45.63 
 
 
455 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  45.63 
 
 
455 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  45.63 
 
 
455 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  49.57 
 
 
450 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  48.51 
 
 
449 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  50 
 
 
450 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  50 
 
 
450 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0248  serine endoprotease  44.6 
 
 
478 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0246  serine endoprotease  44.6 
 
 
475 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.561258  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0230  serine endoprotease  44.6 
 
 
478 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0229  serine endoprotease  44.6 
 
 
475 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0232  serine endoprotease  44.6 
 
 
475 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0586414  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3669  serine endoprotease  45.07 
 
 
455 aa  303  3.0000000000000004e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0364754  normal  0.327931 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  44.82 
 
 
474 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  44.82 
 
 
474 aa  301  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  44.82 
 
 
474 aa  301  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  44.82 
 
 
474 aa  301  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  44.82 
 
 
474 aa  301  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  44.82 
 
 
474 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  49.42 
 
 
450 aa  301  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3530  serine endoprotease  49.2 
 
 
455 aa  301  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00269541  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  49.43 
 
 
451 aa  301  2e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  44.82 
 
 
474 aa  301  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  48.74 
 
 
451 aa  300  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03094  serine endoprotease, periplasmic  48.88 
 
 
455 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0472  protease Do  48.88 
 
 
455 aa  300  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00978488  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3423  serine endoprotease  48.88 
 
 
455 aa  300  3e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0472  serine endoprotease  48.88 
 
 
455 aa  300  3e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0649674  normal  0.0819783 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4551  serine endoprotease  48.88 
 
 
455 aa  300  3e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00837947  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3542  serine endoprotease  48.88 
 
 
455 aa  300  3e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3717  serine endoprotease  48.88 
 
 
455 aa  300  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000159943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03045  hypothetical protein  48.88 
 
 
455 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.471822  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  47.9 
 
 
450 aa  299  4e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  47.9 
 
 
450 aa  299  4e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  47.9 
 
 
450 aa  299  5e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  46.99 
 
 
462 aa  299  6e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  46.09 
 
 
456 aa  299  7e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  44.32 
 
 
496 aa  298  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  47.43 
 
 
459 aa  297  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  44.54 
 
 
474 aa  297  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  47.62 
 
 
450 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  43.12 
 
 
463 aa  296  3e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  46.11 
 
 
457 aa  297  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  46.11 
 
 
457 aa  297  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  42.23 
 
 
455 aa  296  4e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00159  hypothetical protein  44.26 
 
 
474 aa  295  6e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  48.03 
 
 
453 aa  295  8e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  46.63 
 
 
455 aa  295  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0289  protease Do  47.55 
 
 
456 aa  295  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0319386  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  49.26 
 
 
450 aa  295  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0789  serine endoprotease  44.03 
 
 
476 aa  294  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.290182 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  47.14 
 
 
446 aa  294  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1181  serine endoprotease  42.19 
 
 
487 aa  293  3e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  48.66 
 
 
450 aa  293  5e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03424  protease do  48.48 
 
 
478 aa  292  6e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0029  serine protease  44.79 
 
 
460 aa  292  6e-78  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3800  protease Do  46.96 
 
 
456 aa  292  6e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00053297  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0220  protease Do  49.52 
 
 
481 aa  292  8e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.850727  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0250  heat shock protein  49.52 
 
 
481 aa  291  1e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  45.2 
 
 
456 aa  291  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3642  protease Do  46.7 
 
 
456 aa  291  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.393796  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  47.35 
 
 
450 aa  290  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3096  serine endoprotease  42.15 
 
 
485 aa  289  4e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.916772  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0267  protease Do  49.09 
 
 
477 aa  288  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.326354  normal  0.464292 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  43.23 
 
 
455 aa  287  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1196  protease Do  45.51 
 
 
451 aa  287  2.9999999999999996e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  48.65 
 
 
449 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4352  protease Do  45.89 
 
 
456 aa  286  5e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208163  decreased coverage  0.00128029 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0769  endopeptidase  45.51 
 
 
451 aa  286  5e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3323  serine endoprotease  44.89 
 
 
481 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00403874  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0987  serine endoprotease  44.89 
 
 
481 aa  278  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0018316  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3452  serine endoprotease  44.89 
 
 
481 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342049  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1284  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  43.72 
 
 
466 aa  275  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1042  serine endoprotease  42.9 
 
 
482 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.88791  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1285  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  43.44 
 
 
466 aa  273  4.0000000000000004e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2805  serine endoprotease  42.54 
 
 
476 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  45.65 
 
 
383 aa  268  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  48.1 
 
 
398 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  45.65 
 
 
396 aa  266  5e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  44.29 
 
 
383 aa  265  7e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  49.17 
 
 
403 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.58 
 
 
398 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  40.8 
 
 
471 aa  261  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  47.77 
 
 
404 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.91 
 
 
396 aa  260  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>