More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3271 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  94.22 
 
 		 450 aa  849    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  94.22 
 
 		 450 aa  849    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  97.56 
 
 		 450 aa  873    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  94.22 
 
 		 450 aa  849    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  82.89 
 
 		 450 aa  729    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  94 
 
 		 450 aa  847    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  84.44 
 
 		 450 aa  770    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  92.24 
 
 		 451 aa  832    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  79.78 
 
 		 449 aa  717    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  81.99 
 
 		 453 aa  719    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  79.82 
 
 		 451 aa  716    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  100 
 
 		 450 aa  888    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  99.78 
 
 		 450 aa  887    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  83.33 
 
 		 449 aa  739    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  82.89 
 
 		 450 aa  736    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  100 
 
 		 450 aa  888    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  62.1 
 
 		 455 aa  540  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  60.75 
 
 		 456 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  59.6 
 
 		 459 aa  536  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  59.43 
 
 		 455 aa  535  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  59.21 
 
 		 455 aa  532  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  61.02 
 
 		 446 aa  527  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  58.95 
 
 		 463 aa  521  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  59.6 
 
 		 456 aa  519  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  58.95 
 
 		 457 aa  521  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  58.95 
 
 		 457 aa  521  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  60.38 
 
 		 456 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0289  protease Do  59.43 
 
 		 456 aa  509  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0319386  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3800  protease Do  58.55 
 
 		 456 aa  504  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00053297  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3642  protease Do  60.05 
 
 		 456 aa  500  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.393796  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4352  protease Do  59.39 
 
 		 456 aa  496  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208163  decreased coverage  0.00128029 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3669  serine endoprotease  55.65 
 
 		 455 aa  486  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0364754  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  53.49 
 
 		 455 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3646  serine endoprotease  53.49 
 
 		 455 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  53.49 
 
 		 455 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  53.49 
 
 		 455 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03094  serine endoprotease, periplasmic  54.59 
 
 		 455 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0472  protease Do  54.59 
 
 		 455 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00978488  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03045  hypothetical protein  54.59 
 
 		 455 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.471822  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3530  serine endoprotease  54.8 
 
 		 455 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00269541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4551  serine endoprotease  54.37 
 
 		 455 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00837947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3717  serine endoprotease  54.59 
 
 		 455 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000159943  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0472  serine endoprotease  54.59 
 
 		 455 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0649674  normal  0.0819783 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3423  serine endoprotease  54.59 
 
 		 455 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3542  serine endoprotease  54.59 
 
 		 455 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  53.28 
 
 		 451 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0029  serine protease  53.81 
 
 		 460 aa  467  9.999999999999999e-131  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  54.86 
 
 		 462 aa  467  9.999999999999999e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0789  serine endoprotease  52.51 
 
 		 476 aa  461  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.290182 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  55.23 
 
 		 474 aa  456  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  55.23 
 
 		 474 aa  456  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  55.23 
 
 		 474 aa  456  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  55.23 
 
 		 474 aa  456  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  55.23 
 
 		 474 aa  455  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  55.23 
 
 		 474 aa  456  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  55.23 
 
 		 474 aa  455  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  55.23 
 
 		 474 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00159  hypothetical protein  54.77 
 
 		 474 aa  449  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  54.71 
 
 		 496 aa  451  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0246  serine endoprotease  54.05 
 
 		 475 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.561258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0229  serine endoprotease  54.05 
 
 		 475 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0230  serine endoprotease  54.05 
 
 		 478 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0248  serine endoprotease  54.05 
 
 		 478 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0232  serine endoprotease  54.05 
 
 		 475 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0586414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1181  serine endoprotease  52.23 
 
 		 487 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3096  serine endoprotease  52.35 
 
 		 485 aa  437  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.916772  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3452  serine endoprotease  52.07 
 
 		 481 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342049  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3323  serine endoprotease  52.07 
 
 		 481 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00403874  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0987  serine endoprotease  51.87 
 
 		 481 aa  430  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0018316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2805  serine endoprotease  54.2 
 
 		 476 aa  425  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1042  serine endoprotease  51.79 
 
 		 482 aa  413  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.88791  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  52.55 
 
 		 457 aa  400  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  47.51 
 
 		 460 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  49.03 
 
 		 458 aa  392  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  47.19 
 
 		 465 aa  389  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2479  protease Do  48.34 
 
 		 450 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3731  protease DO  48.68 
 
 		 476 aa  379  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.233243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  46.24 
 
 		 458 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  48.27 
 
 		 469 aa  371  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  44.85 
 
 		 473 aa  363  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03424  protease do  45.48 
 
 		 478 aa  348  8e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0267  protease Do  46.44 
 
 		 477 aa  343  2e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.326354  normal  0.464292 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1285  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  44.34 
 
 		 466 aa  325  1e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0220  protease Do  42.56 
 
 		 481 aa  322  7e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.850727  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1284  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  43.65 
 
 		 466 aa  321  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0250  heat shock protein  42.56 
 
 		 481 aa  322  9.999999999999999e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1196  protease Do  40.17 
 
 		 451 aa  322  9.999999999999999e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0769  endopeptidase  40.17 
 
 		 451 aa  321  1.9999999999999998e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  43.31 
 
 		 478 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2934  trypsin-like serine protease  50 
 
 		 374 aa  302  7.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  40.41 
 
 		 476 aa  302  8.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  39.59 
 
 		 476 aa  299  5e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  38.85 
 
 		 472 aa  298  1e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  42.43 
 
 		 476 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  39.25 
 
 		 513 aa  297  3e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.14 
 
 		 412 aa  296  4e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  39.82 
 
 		 479 aa  294  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.4 
 
 		 398 aa  294  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1242  protease DO  38.22 
 
 		 472 aa  293  3e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000225025  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  38.22 
 
 		 472 aa  293  5e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>