More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3233 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  83.08 
 
 		 403 aa  664    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  82.79 
 
 		 404 aa  662    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  93.22 
 
 		 398 aa  724    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  82.29 
 
 		 404 aa  659    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 398 aa  792    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  71.53 
 
 		 402 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  71.82 
 
 		 401 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  71.82 
 
 		 401 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  71.82 
 
 		 401 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  71.53 
 
 		 402 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  71.82 
 
 		 401 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  71.53 
 
 		 402 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  71.53 
 
 		 402 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  71.82 
 
 		 401 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  71.39 
 
 		 402 aa  579  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  71.57 
 
 		 401 aa  579  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  72.26 
 
 		 407 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  71.29 
 
 		 402 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  70.4 
 
 		 403 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  71.14 
 
 		 407 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  70.26 
 
 		 388 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  71.13 
 
 		 387 aa  551  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  70 
 
 		 388 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  62.6 
 
 		 392 aa  480  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  62.03 
 
 		 390 aa  475  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  62.5 
 
 		 380 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  60.05 
 
 		 396 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  60.93 
 
 		 379 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  61.34 
 
 		 383 aa  455  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  58.99 
 
 		 396 aa  457  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  61.6 
 
 		 383 aa  454  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  60.36 
 
 		 383 aa  446  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  61.18 
 
 		 379 aa  442  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  60.36 
 
 		 388 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  57.87 
 
 		 386 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1183  HtrA2 peptidase  60.2 
 
 		 386 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  61.22 
 
 		 398 aa  437  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  60.15 
 
 		 385 aa  429  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  58.57 
 
 		 384 aa  429  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  62.08 
 
 		 380 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.96 
 
 		 385 aa  403  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  56.11 
 
 		 389 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  51.94 
 
 		 386 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  59.69 
 
 		 389 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  51.68 
 
 		 402 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  51.68 
 
 		 386 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  52.34 
 
 		 386 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1605  2-alkenal reductase  53.67 
 
 		 385 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436797 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  57.1 
 
 		 412 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  55.68 
 
 		 385 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  52.52 
 
 		 386 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  52.79 
 
 		 386 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12950  Htr-like protease  54.41 
 
 		 383 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.12 
 
 		 408 aa  364  2e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  56.4 
 
 		 417 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1505  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.38 
 
 		 387 aa  328  7e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.98947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  47.51 
 
 		 372 aa  326  5e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2688  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  56.73 
 
 		 391 aa  324  2e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  52.68 
 
 		 513 aa  324  2e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  51.55 
 
 		 465 aa  311  1e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  49.28 
 
 		 443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  47.19 
 
 		 457 aa  309  5.9999999999999995e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  50.74 
 
 		 471 aa  304  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.77 
 
 		 442 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  47.6 
 
 		 442 aa  303  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  53.48 
 
 		 460 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  49.55 
 
 		 464 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  47.55 
 
 		 472 aa  300  2e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  49.4 
 
 		 463 aa  296  6e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3156  peptidase S1C, Do  46.41 
 
 		 464 aa  296  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  0.845897 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  48.64 
 
 		 496 aa  295  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  46.4 
 
 		 450 aa  294  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  46.4 
 
 		 450 aa  294  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  46.4 
 
 		 450 aa  294  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  47.18 
 
 		 450 aa  293  3e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  46.11 
 
 		 451 aa  293  4e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  48.01 
 
 		 463 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  46.4 
 
 		 450 aa  292  5e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  46.4 
 
 		 450 aa  292  6e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  46.4 
 
 		 450 aa  292  6e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  48.17 
 
 		 511 aa  291  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  46.99 
 
 		 458 aa  290  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  46.11 
 
 		 450 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  45.4 
 
 		 449 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2404  2-alkenal reductase  44.71 
 
 		 350 aa  289  7e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.993946  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  48.64 
 
 		 502 aa  288  1e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  48.93 
 
 		 476 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  47.21 
 
 		 474 aa  288  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  46.4 
 
 		 453 aa  288  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  47.21 
 
 		 474 aa  288  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  48.77 
 
 		 467 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  47.47 
 
 		 463 aa  287  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  47.47 
 
 		 457 aa  287  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  47.47 
 
 		 457 aa  287  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  50 
 
 		 450 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  48.05 
 
 		 468 aa  286  4e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  45.27 
 
 		 498 aa  286  5e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  45.81 
 
 		 476 aa  286  5e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  46.22 
 
 		 505 aa  286  5e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  48.02 
 
 		 464 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>