More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1673 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  75.69 
 
 
504 aa  779    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  100 
 
 
505 aa  1003    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  66.27 
 
 
506 aa  669    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  65.61 
 
 
502 aa  662    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  64.54 
 
 
502 aa  648    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  69.2 
 
 
498 aa  712    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  64.81 
 
 
499 aa  624  1e-177  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  44.05 
 
 
479 aa  361  2e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  43.89 
 
 
471 aa  340  5e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  44.72 
 
 
476 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  41.67 
 
 
472 aa  333  4e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  39.19 
 
 
497 aa  330  3e-89  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  42.95 
 
 
457 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  40.81 
 
 
511 aa  328  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  42.76 
 
 
476 aa  327  3e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  39.48 
 
 
511 aa  326  7e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  42.57 
 
 
464 aa  323  6e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  39.48 
 
 
474 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  40.45 
 
 
469 aa  319  7.999999999999999e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  39.55 
 
 
473 aa  318  1e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  42.5 
 
 
458 aa  317  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  41.65 
 
 
478 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  42.7 
 
 
480 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  40.64 
 
 
465 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  40.3 
 
 
473 aa  313  4.999999999999999e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  41.7 
 
 
476 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  40.72 
 
 
476 aa  312  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  41.06 
 
 
513 aa  311  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  43.33 
 
 
461 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  41.74 
 
 
485 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  40.44 
 
 
479 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  41.3 
 
 
502 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  41.3 
 
 
502 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  41.3 
 
 
502 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  41.3 
 
 
502 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  41.3 
 
 
502 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  41.3 
 
 
485 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  41.3 
 
 
461 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  43.08 
 
 
466 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  40.49 
 
 
474 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  39.6 
 
 
474 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  40.71 
 
 
477 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  39.83 
 
 
482 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  37.67 
 
 
481 aa  301  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  38.5 
 
 
467 aa  300  3e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  41.05 
 
 
472 aa  300  3e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  41.94 
 
 
485 aa  300  3e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  40.22 
 
 
490 aa  300  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  41.38 
 
 
459 aa  299  8e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  39.74 
 
 
492 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  39.38 
 
 
474 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  39.74 
 
 
477 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  39.65 
 
 
479 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  40.89 
 
 
476 aa  298  2e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  39.74 
 
 
477 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  42.13 
 
 
471 aa  298  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  39.74 
 
 
477 aa  298  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  39.74 
 
 
477 aa  298  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  40.09 
 
 
481 aa  297  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  39.87 
 
 
461 aa  296  7e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  39.51 
 
 
482 aa  296  8e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  40.09 
 
 
473 aa  296  8e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  39.25 
 
 
498 aa  296  8e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  39.25 
 
 
498 aa  296  8e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  39.25 
 
 
498 aa  296  8e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  42.89 
 
 
462 aa  296  9e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  40.09 
 
 
472 aa  295  1e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  39.23 
 
 
499 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  41.96 
 
 
464 aa  295  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  40.18 
 
 
503 aa  293  4e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  39.69 
 
 
464 aa  293  4e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  42.07 
 
 
475 aa  293  4e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  39.6 
 
 
481 aa  293  5e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2479  protease Do  44.13 
 
 
450 aa  293  7e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  38.46 
 
 
500 aa  292  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  42.86 
 
 
451 aa  292  8e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  39.42 
 
 
487 aa  292  9e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  38.73 
 
 
498 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  42.62 
 
 
524 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  38.76 
 
 
499 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  41.94 
 
 
509 aa  291  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  40.4 
 
 
473 aa  291  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  39.69 
 
 
505 aa  290  3e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  41.25 
 
 
467 aa  290  3e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  40.77 
 
 
450 aa  290  4e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  40.22 
 
 
473 aa  290  4e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  39.64 
 
 
488 aa  289  6e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  38.01 
 
 
502 aa  290  6e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  41.3 
 
 
478 aa  289  7e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  41.19 
 
 
460 aa  289  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  40.73 
 
 
450 aa  288  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  40.22 
 
 
471 aa  288  2e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  42.31 
 
 
507 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  39.33 
 
 
485 aa  288  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  40.77 
 
 
450 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  39.65 
 
 
503 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  39.92 
 
 
493 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  40.37 
 
 
453 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  40.77 
 
 
450 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  40.77 
 
 
450 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>