More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0244 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  100 
 
 		 458 aa  909    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  96.07 
 
 		 457 aa  870    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  63.93 
 
 		 466 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  62.23 
 
 		 464 aa  553  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  61.57 
 
 		 464 aa  528  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  54.23 
 
 		 461 aa  475  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  53.8 
 
 		 476 aa  456  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  55.31 
 
 		 462 aa  451  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  54.08 
 
 		 472 aa  445  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  51.95 
 
 		 476 aa  410  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  49.88 
 
 		 475 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  51.28 
 
 		 471 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  50.23 
 
 		 476 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  50.46 
 
 		 476 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  48.79 
 
 		 476 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  50.8 
 
 		 472 aa  397  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  47.83 
 
 		 481 aa  388  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  48.88 
 
 		 485 aa  388  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  44.79 
 
 		 485 aa  383  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  46.46 
 
 		 478 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  48.16 
 
 		 482 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  50 
 
 		 474 aa  378  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  47.16 
 
 		 489 aa  368  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  44.73 
 
 		 464 aa  364  1e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  45.7 
 
 		 480 aa  365  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  44.4 
 
 		 481 aa  362  6e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  44.73 
 
 		 484 aa  359  5e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  45.95 
 
 		 524 aa  359  7e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  45.05 
 
 		 493 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  45.05 
 
 		 506 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  46.14 
 
 		 473 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  42.44 
 
 		 473 aa  355  5.999999999999999e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  42.89 
 
 		 469 aa  352  8.999999999999999e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2069  protease Do  45.95 
 
 		 523 aa  349  6e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719287  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  42.92 
 
 		 479 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  44.99 
 
 		 483 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  42.8 
 
 		 477 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  44.78 
 
 		 483 aa  347  4e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  44.74 
 
 		 477 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  44.15 
 
 		 492 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  43.72 
 
 		 493 aa  345  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1771  peptidase S1C, Do  45.73 
 
 		 524 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0217208  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  43.15 
 
 		 473 aa  343  5e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  43.99 
 
 		 475 aa  343  5e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  42.41 
 
 		 477 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  42.41 
 
 		 477 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  43.39 
 
 		 500 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  42.91 
 
 		 520 aa  339  5e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  44.69 
 
 		 467 aa  339  7e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  44.09 
 
 		 502 aa  338  9e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  41.94 
 
 		 477 aa  338  9e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  44.98 
 
 		 525 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  44.78 
 
 		 474 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  43.85 
 
 		 501 aa  338  9.999999999999999e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  42.44 
 
 		 487 aa  338  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  43.33 
 
 		 474 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  43.31 
 
 		 474 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  45.39 
 
 		 502 aa  337  2.9999999999999997e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  43.16 
 
 		 482 aa  336  5e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  44.16 
 
 		 516 aa  336  7e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  44.18 
 
 		 514 aa  335  7.999999999999999e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  42.02 
 
 		 478 aa  335  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  41.98 
 
 		 473 aa  334  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  44.18 
 
 		 501 aa  334  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  43.11 
 
 		 491 aa  333  3e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  44.06 
 
 		 511 aa  334  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  44.16 
 
 		 508 aa  331  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  41.82 
 
 		 504 aa  332  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0037  protease Do  41.58 
 
 		 489 aa  332  1e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  43.02 
 
 		 483 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  45.3 
 
 		 471 aa  330  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  41.54 
 
 		 524 aa  330  4e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  43.79 
 
 		 497 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  41.54 
 
 		 524 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  42.02 
 
 		 479 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  44.83 
 
 		 511 aa  326  6e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  42.46 
 
 		 522 aa  326  6e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  42.83 
 
 		 523 aa  325  1e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  41.42 
 
 		 479 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  42.2 
 
 		 481 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  43.36 
 
 		 473 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  42.32 
 
 		 502 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  44.61 
 
 		 511 aa  324  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  42.32 
 
 		 502 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  42.32 
 
 		 502 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  42.49 
 
 		 473 aa  324  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  42.32 
 
 		 502 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  41.3 
 
 		 499 aa  324  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  42.32 
 
 		 502 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  42.32 
 
 		 485 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  41.16 
 
 		 471 aa  323  3e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  41.54 
 
 		 492 aa  323  3e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  42.32 
 
 		 461 aa  323  5e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1396  serine protease, DO/DeqQ family  42.89 
 
 		 479 aa  322  8e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.333333  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  44.07 
 
 		 464 aa  322  8e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1117  protease Do  42.89 
 
 		 491 aa  322  9.000000000000001e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0590546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  49.27 
 
 		 588 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  39.47 
 
 		 502 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  50 
 
 		 578 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  41.23 
 
 		 485 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>