More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3140 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  83.44 
 
 		 483 aa  803    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  100 
 
 		 483 aa  941    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  83.64 
 
 		 483 aa  804    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  46.47 
 
 		 523 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  45.78 
 
 		 526 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  45.43 
 
 		 500 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  45.12 
 
 		 520 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  45.96 
 
 		 520 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  46.29 
 
 		 501 aa  365  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  47.07 
 
 		 491 aa  364  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  47.26 
 
 		 506 aa  364  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  47.26 
 
 		 493 aa  363  3e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  46.41 
 
 		 514 aa  363  4e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  44.01 
 
 		 464 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  45.47 
 
 		 523 aa  361  1e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  46.3 
 
 		 528 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  46.93 
 
 		 493 aa  360  3e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  44.02 
 
 		 528 aa  359  6e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  45.53 
 
 		 513 aa  358  9.999999999999999e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  45.53 
 
 		 513 aa  358  9.999999999999999e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  44.75 
 
 		 487 aa  357  3.9999999999999996e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  43.8 
 
 		 523 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  44.47 
 
 		 527 aa  353  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  45.47 
 
 		 511 aa  353  5e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  43.82 
 
 		 524 aa  352  1e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  45.11 
 
 		 500 aa  350  4e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  44.15 
 
 		 466 aa  350  4e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  46.76 
 
 		 525 aa  348  9e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  44.23 
 
 		 516 aa  348  1e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  43.08 
 
 		 529 aa  348  1e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  46.97 
 
 		 501 aa  347  3e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  43.82 
 
 		 457 aa  346  7e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  43.82 
 
 		 508 aa  342  7e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  43.96 
 
 		 491 aa  340  4e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  41.77 
 
 		 476 aa  340  5e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  44.73 
 
 		 501 aa  338  9e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  48.68 
 
 		 464 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  45.17 
 
 		 516 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  43.8 
 
 		 504 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  44.35 
 
 		 501 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  45.68 
 
 		 535 aa  338  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  43.03 
 
 		 502 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  43.76 
 
 		 462 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  41.37 
 
 		 517 aa  335  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  45.15 
 
 		 511 aa  333  4e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  45.15 
 
 		 511 aa  333  4e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  44.21 
 
 		 518 aa  333  5e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  44.25 
 
 		 496 aa  332  6e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  47.41 
 
 		 509 aa  331  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  44.54 
 
 		 501 aa  331  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  40.97 
 
 		 527 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  46.24 
 
 		 498 aa  330  4e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  43.57 
 
 		 485 aa  330  5.0000000000000004e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  43.47 
 
 		 458 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  42.45 
 
 		 498 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  43.29 
 
 		 459 aa  328  2.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  43.15 
 
 		 524 aa  327  3e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  43.14 
 
 		 537 aa  326  4.0000000000000003e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  43.45 
 
 		 503 aa  326  5e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  43.45 
 
 		 503 aa  326  5e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  44.5 
 
 		 508 aa  325  9e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  44.08 
 
 		 461 aa  325  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  40.5 
 
 		 527 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  42.25 
 
 		 471 aa  324  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  39.04 
 
 		 520 aa  322  8e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  39.33 
 
 		 505 aa  322  9.999999999999999e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  41 
 
 		 522 aa  320  5e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  38.54 
 
 		 524 aa  319  6e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  41.58 
 
 		 506 aa  319  6e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  43.27 
 
 		 485 aa  319  7e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  45.89 
 
 		 497 aa  319  7.999999999999999e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  46.84 
 
 		 501 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  42.36 
 
 		 496 aa  318  2e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  42.28 
 
 		 478 aa  317  3e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  39.65 
 
 		 497 aa  317  4e-85  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  42.25 
 
 		 489 aa  316  6e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  38.34 
 
 		 524 aa  316  6e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  42.95 
 
 		 515 aa  315  8e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  48.23 
 
 		 496 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  43.57 
 
 		 496 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  39.79 
 
 		 578 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  38.45 
 
 		 484 aa  313  5.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  42.42 
 
 		 475 aa  311  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  38.18 
 
 		 492 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  46.13 
 
 		 588 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  43.87 
 
 		 525 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  40.89 
 
 		 476 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  38.38 
 
 		 477 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  41.5 
 
 		 499 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  40.2 
 
 		 479 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  37.98 
 
 		 477 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  42.66 
 
 		 502 aa  307  3e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  39.87 
 
 		 473 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  43.49 
 
 		 487 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  44.74 
 
 		 497 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  43.37 
 
 		 479 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  42.74 
 
 		 524 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  39.39 
 
 		 482 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  42.86 
 
 		 499 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  42.95 
 
 		 472 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>