More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1841 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  82.08 
 
 		 527 aa  828    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  75.19 
 
 		 516 aa  746    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  80.68 
 
 		 528 aa  806    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  100 
 
 		 528 aa  1042    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  82.64 
 
 		 526 aa  843    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  77.08 
 
 		 523 aa  797    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  77.88 
 
 		 523 aa  779    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  56.02 
 
 		 520 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  59.74 
 
 		 525 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  54.27 
 
 		 537 aa  479  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  51.97 
 
 		 529 aa  480  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  52.29 
 
 		 504 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  52.5 
 
 		 502 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  54.21 
 
 		 524 aa  464  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  55.24 
 
 		 501 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  54.98 
 
 		 508 aa  442  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  52.71 
 
 		 520 aa  441  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  54.78 
 
 		 503 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  54.78 
 
 		 503 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  52.81 
 
 		 496 aa  434  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  52.81 
 
 		 496 aa  434  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  52.36 
 
 		 513 aa  426  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  52.36 
 
 		 513 aa  426  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  52.93 
 
 		 496 aa  428  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  44.06 
 
 		 517 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  49.02 
 
 		 491 aa  403  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  46.78 
 
 		 527 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  49.04 
 
 		 491 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  45.28 
 
 		 527 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  47.66 
 
 		 505 aa  391  1e-107  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  45.28 
 
 		 483 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  45.08 
 
 		 483 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  48.8 
 
 		 509 aa  360  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  44.21 
 
 		 483 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  45.67 
 
 		 487 aa  356  6.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  43.43 
 
 		 506 aa  348  2e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  44.16 
 
 		 501 aa  339  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  43.6 
 
 		 500 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  43.31 
 
 		 535 aa  338  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  42.24 
 
 		 493 aa  336  7e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  42.24 
 
 		 506 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  41.94 
 
 		 508 aa  333  5e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  41.63 
 
 		 588 aa  333  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  41.13 
 
 		 514 aa  332  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  41.24 
 
 		 528 aa  325  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  40.21 
 
 		 493 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  40.79 
 
 		 578 aa  324  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  42.55 
 
 		 501 aa  322  9.000000000000001e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  42.64 
 
 		 497 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  42.68 
 
 		 496 aa  318  2e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  41.7 
 
 		 515 aa  316  6e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  42.07 
 
 		 511 aa  316  7e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  40.8 
 
 		 508 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  41.79 
 
 		 457 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  47.87 
 
 		 524 aa  312  9e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  41.5 
 
 		 462 aa  311  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  40 
 
 		 471 aa  311  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  40.69 
 
 		 498 aa  311  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  38.61 
 
 		 522 aa  308  2.0000000000000002e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  45.36 
 
 		 498 aa  306  9.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  40.25 
 
 		 520 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  40.76 
 
 		 523 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  39.39 
 
 		 518 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3889  protease Do  42.29 
 
 		 524 aa  304  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42007  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  42.21 
 
 		 459 aa  304  3.0000000000000004e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  42.62 
 
 		 485 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  41.53 
 
 		 501 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  39.16 
 
 		 500 aa  302  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  41.58 
 
 		 458 aa  301  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  41.7 
 
 		 511 aa  301  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  41.7 
 
 		 511 aa  301  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  41.65 
 
 		 477 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  39.24 
 
 		 499 aa  301  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  42.37 
 
 		 501 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  39.91 
 
 		 464 aa  300  3e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  42.49 
 
 		 498 aa  301  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  41.85 
 
 		 497 aa  301  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  39.56 
 
 		 524 aa  300  5e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  43.75 
 
 		 464 aa  299  6e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  41.39 
 
 		 482 aa  299  7e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  39.47 
 
 		 499 aa  299  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  41.21 
 
 		 492 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  41.48 
 
 		 476 aa  298  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  40 
 
 		 524 aa  296  5e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  39.96 
 
 		 466 aa  296  5e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  41.43 
 
 		 474 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  41.53 
 
 		 516 aa  295  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  38.34 
 
 		 476 aa  295  1e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  41 
 
 		 477 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  41.21 
 
 		 479 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  41 
 
 		 474 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  40 
 
 		 481 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  40.13 
 
 		 501 aa  293  5e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  41.39 
 
 		 464 aa  291  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  38.79 
 
 		 478 aa  291  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  40.43 
 
 		 472 aa  290  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  40.52 
 
 		 464 aa  289  1e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  39.87 
 
 		 502 aa  289  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  39.87 
 
 		 502 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  39.87 
 
 		 502 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>