More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2022 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  100 
 
 
459 aa  899    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  48.92 
 
 
487 aa  389  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  45.34 
 
 
496 aa  370  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  47.18 
 
 
508 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  45.74 
 
 
497 aa  369  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  48.97 
 
 
471 aa  368  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  45.76 
 
 
498 aa  363  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  47.51 
 
 
501 aa  363  4e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  45.17 
 
 
493 aa  360  3e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  45.62 
 
 
506 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  45.62 
 
 
493 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  45.91 
 
 
497 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  47.86 
 
 
500 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  47.06 
 
 
511 aa  354  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  47.74 
 
 
501 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  45.29 
 
 
528 aa  350  3e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  44.35 
 
 
535 aa  350  3e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  44.57 
 
 
499 aa  350  4e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  46.65 
 
 
501 aa  349  5e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  41.8 
 
 
588 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  44.2 
 
 
523 aa  347  2e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  45.77 
 
 
498 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  45.83 
 
 
514 aa  347  4e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  41.96 
 
 
578 aa  346  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  45.37 
 
 
499 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  45.76 
 
 
498 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  42.63 
 
 
522 aa  343  4e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  45.21 
 
 
516 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  44.52 
 
 
520 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  42.44 
 
 
524 aa  338  1.9999999999999998e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  42.44 
 
 
524 aa  335  9e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  44.99 
 
 
511 aa  332  9e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  45.37 
 
 
511 aa  332  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2014  protease Do  46.49 
 
 
502 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  40.8 
 
 
464 aa  325  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  43.29 
 
 
483 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  40.13 
 
 
466 aa  324  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  44.6 
 
 
515 aa  321  9.999999999999999e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  42.23 
 
 
476 aa  320  3e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0922  protease Do family protein  40.73 
 
 
496 aa  318  1e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.726985  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  45.31 
 
 
491 aa  318  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  41.67 
 
 
527 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  42.09 
 
 
483 aa  316  6e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  44.09 
 
 
481 aa  315  7e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  41.87 
 
 
483 aa  315  8e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  42.08 
 
 
462 aa  311  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  42.32 
 
 
473 aa  311  2e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  39.36 
 
 
457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  40.76 
 
 
513 aa  306  5.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  40.76 
 
 
513 aa  306  5.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  40.17 
 
 
489 aa  306  5.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  38.28 
 
 
473 aa  306  7e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  40.42 
 
 
464 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  41.99 
 
 
528 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  40.77 
 
 
526 aa  302  9e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  38.13 
 
 
497 aa  302  1e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  40.55 
 
 
523 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  41.59 
 
 
523 aa  301  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  44.57 
 
 
516 aa  299  6e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  39.96 
 
 
518 aa  298  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  39.69 
 
 
528 aa  296  7e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  40.04 
 
 
520 aa  296  7e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  37.17 
 
 
485 aa  295  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  39.23 
 
 
458 aa  293  6e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  43.68 
 
 
501 aa  292  8e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  40.14 
 
 
479 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  40.73 
 
 
473 aa  291  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  39.21 
 
 
461 aa  291  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1651  protease Do  40.95 
 
 
492 aa  291  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  40.94 
 
 
477 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  38.63 
 
 
474 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  39 
 
 
464 aa  288  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  40.36 
 
 
492 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  38.8 
 
 
473 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  38.2 
 
 
474 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  38.93 
 
 
520 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  40.66 
 
 
471 aa  286  5e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  41.7 
 
 
477 aa  286  5e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  39.87 
 
 
469 aa  286  5.999999999999999e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  42.49 
 
 
509 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  38.08 
 
 
472 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  39.95 
 
 
464 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  40.27 
 
 
477 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0037  protease Do  42.14 
 
 
489 aa  283  5.000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  40.78 
 
 
477 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  40.78 
 
 
477 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  41.36 
 
 
479 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  39.95 
 
 
485 aa  281  2e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  40 
 
 
529 aa  280  4e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  34.95 
 
 
484 aa  280  4e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  37.45 
 
 
476 aa  280  4e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1052  serine protease  36.34 
 
 
471 aa  280  5e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.72618  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  39.78 
 
 
517 aa  279  7e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  36.13 
 
 
476 aa  279  8e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  41.03 
 
 
492 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  39.2 
 
 
474 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  39.72 
 
 
473 aa  278  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  41.03 
 
 
492 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  38.15 
 
 
474 aa  277  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  38.15 
 
 
474 aa  277  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>