More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3978 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  100 
 
 		 483 aa  956    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  99.79 
 
 		 483 aa  955    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  83.44 
 
 		 483 aa  785    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  48.24 
 
 		 523 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  48.38 
 
 		 526 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  44.71 
 
 		 523 aa  369  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  45.19 
 
 		 528 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  47.1 
 
 		 520 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  43.96 
 
 		 527 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  44.88 
 
 		 528 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  45.43 
 
 		 500 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  43.6 
 
 		 516 aa  359  7e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  45.95 
 
 		 506 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  45.95 
 
 		 493 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  43.47 
 
 		 487 aa  357  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  48.1 
 
 		 525 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  45.75 
 
 		 500 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  45.96 
 
 		 501 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  46.06 
 
 		 514 aa  355  8.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  46.21 
 
 		 493 aa  353  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  43.4 
 
 		 464 aa  353  5e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  44.26 
 
 		 457 aa  351  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  43.89 
 
 		 491 aa  348  1e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  44.88 
 
 		 501 aa  348  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  44.56 
 
 		 520 aa  348  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  43.9 
 
 		 502 aa  347  4e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  42.11 
 
 		 529 aa  345  1e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  44.35 
 
 		 511 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  41.91 
 
 		 476 aa  342  1e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  44.13 
 
 		 504 aa  340  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  44.01 
 
 		 508 aa  341  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  44.63 
 
 		 513 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  44.63 
 
 		 513 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  48.7 
 
 		 464 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  44.78 
 
 		 458 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  44.49 
 
 		 516 aa  336  7e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  42.54 
 
 		 523 aa  335  7e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  44.34 
 
 		 462 aa  334  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  43.17 
 
 		 524 aa  334  2e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  41.32 
 
 		 524 aa  333  3e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  45.27 
 
 		 461 aa  333  4e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  42 
 
 		 527 aa  333  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  42.44 
 
 		 518 aa  332  6e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  42.18 
 
 		 501 aa  332  7.000000000000001e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  41.08 
 
 		 517 aa  331  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  45.18 
 
 		 491 aa  330  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  44.35 
 
 		 511 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  44.35 
 
 		 511 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  40.32 
 
 		 505 aa  328  9e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  41.92 
 
 		 527 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  44.74 
 
 		 501 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  42.76 
 
 		 489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  45.05 
 
 		 501 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  42.14 
 
 		 476 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  40.85 
 
 		 466 aa  327  3e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  44.62 
 
 		 503 aa  325  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  44.62 
 
 		 503 aa  325  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  43.36 
 
 		 496 aa  325  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  42.89 
 
 		 478 aa  325  1e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  41.7 
 
 		 506 aa  324  2e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  41.88 
 
 		 471 aa  323  3e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  42.6 
 
 		 485 aa  323  6e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  44.24 
 
 		 535 aa  322  7e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  45.81 
 
 		 509 aa  322  7e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  40.69 
 
 		 522 aa  320  3e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  43.98 
 
 		 485 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  39.52 
 
 		 492 aa  319  9e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  39.01 
 
 		 524 aa  318  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  43.47 
 
 		 537 aa  318  1e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  39.09 
 
 		 588 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  40.97 
 
 		 492 aa  317  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  39.31 
 
 		 477 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  42.66 
 
 		 475 aa  317  3e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  38.87 
 
 		 520 aa  316  7e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  39.11 
 
 		 477 aa  316  7e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  41.87 
 
 		 459 aa  315  8e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  38.81 
 
 		 524 aa  315  9.999999999999999e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  45.21 
 
 		 498 aa  315  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  38.01 
 
 		 508 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  45.74 
 
 		 497 aa  313  5.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  42.8 
 
 		 525 aa  312  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  48.64 
 
 		 496 aa  312  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  40.45 
 
 		 479 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  39.16 
 
 		 479 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  47.54 
 
 		 496 aa  311  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  41.65 
 
 		 496 aa  310  4e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  41.49 
 
 		 515 aa  310  5e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  38.46 
 
 		 578 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  44.32 
 
 		 498 aa  309  8e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  41.29 
 
 		 474 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  40.18 
 
 		 497 aa  307  2.0000000000000002e-82  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  41.11 
 
 		 475 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  42.25 
 
 		 502 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  40.97 
 
 		 473 aa  307  3e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  40.86 
 
 		 474 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  37.76 
 
 		 484 aa  306  4.0000000000000004e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  45.43 
 
 		 501 aa  306  6e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  42.71 
 
 		 524 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  42.79 
 
 		 479 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  42.76 
 
 		 485 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>