More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1746 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1746  protease Do  100 
 
 		 471 aa  929    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  58.09 
 
 		 520 aa  531  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  57.2 
 
 		 524 aa  531  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  57 
 
 		 524 aa  527  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  56.91 
 
 		 588 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  57.17 
 
 		 578 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2014  protease Do  58.39 
 
 		 502 aa  492  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  53.63 
 
 		 528 aa  475  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  53.91 
 
 		 511 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  54 
 
 		 501 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0922  protease Do family protein  51.58 
 
 		 496 aa  466  9.999999999999999e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.726985  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  53.13 
 
 		 498 aa  462  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  53.45 
 
 		 500 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  52.5 
 
 		 522 aa  459  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  53.09 
 
 		 497 aa  455  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  53.29 
 
 		 501 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  52.26 
 
 		 496 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  53.78 
 
 		 497 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  54.03 
 
 		 511 aa  450  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  54.03 
 
 		 511 aa  451  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  53.08 
 
 		 498 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  50.93 
 
 		 523 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  51.16 
 
 		 516 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  53.22 
 
 		 498 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  52.98 
 
 		 499 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  52.54 
 
 		 508 aa  434  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  50.76 
 
 		 487 aa  420  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  49.79 
 
 		 501 aa  413  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  50 
 
 		 493 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  50 
 
 		 506 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  49.68 
 
 		 493 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  48.4 
 
 		 535 aa  389  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  49.89 
 
 		 499 aa  392  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  47.92 
 
 		 514 aa  383  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  48.34 
 
 		 515 aa  378  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  48.97 
 
 		 459 aa  368  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  43.1 
 
 		 497 aa  352  1e-95  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  43.27 
 
 		 513 aa  351  1e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  43.27 
 
 		 513 aa  351  1e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  43.42 
 
 		 491 aa  346  4e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  45.57 
 
 		 476 aa  340  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  42.89 
 
 		 508 aa  339  7e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  41.72 
 
 		 527 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  41.33 
 
 		 520 aa  338  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  42.4 
 
 		 527 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  45.27 
 
 		 517 aa  336  5e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  44.01 
 
 		 464 aa  334  3e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  44.64 
 
 		 457 aa  333  3e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  42.16 
 
 		 529 aa  332  7.000000000000001e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  45.43 
 
 		 491 aa  330  5.0000000000000004e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  41.98 
 
 		 524 aa  329  8e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  42.38 
 
 		 504 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  42.16 
 
 		 502 aa  325  9e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  41 
 
 		 500 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  42.47 
 
 		 518 aa  324  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  42.09 
 
 		 483 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  41.88 
 
 		 483 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  43.13 
 
 		 525 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  45.37 
 
 		 466 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  44.84 
 
 		 509 aa  320  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  41.21 
 
 		 523 aa  319  6e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  42.89 
 
 		 527 aa  319  6e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  45.3 
 
 		 458 aa  319  7e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  42.19 
 
 		 501 aa  319  7.999999999999999e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  44.13 
 
 		 464 aa  318  9e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  39.07 
 
 		 485 aa  318  9e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  42.69 
 
 		 501 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  41.28 
 
 		 483 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  46.29 
 
 		 496 aa  317  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  44.11 
 
 		 481 aa  317  3e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  39.23 
 
 		 520 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  41 
 
 		 523 aa  315  8e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  46.04 
 
 		 496 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  41.89 
 
 		 489 aa  315  9.999999999999999e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  41.89 
 
 		 496 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  41.44 
 
 		 503 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  41.44 
 
 		 503 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  41.09 
 
 		 516 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  40.64 
 
 		 506 aa  313  3.9999999999999997e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  41.87 
 
 		 474 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  42.31 
 
 		 475 aa  312  7.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  41.7 
 
 		 479 aa  312  9e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  39.58 
 
 		 528 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  41.65 
 
 		 474 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  41.92 
 
 		 492 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  41.47 
 
 		 477 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  42.7 
 
 		 481 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  41.7 
 
 		 477 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  42.15 
 
 		 474 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  41.67 
 
 		 505 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  43.11 
 
 		 476 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  41.3 
 
 		 501 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  40.86 
 
 		 526 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  42.36 
 
 		 461 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  40.76 
 
 		 482 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3331  peptidase S1C, Do  41.58 
 
 		 510 aa  303  6.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107916  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  42.28 
 
 		 473 aa  302  8.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  44.7 
 
 		 462 aa  301  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  40.27 
 
 		 473 aa  301  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  41.81 
 
 		 478 aa  302  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>