More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0763 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  91.42 
 
 
500 aa  890    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  100 
 
 
501 aa  984    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  46.48 
 
 
513 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  46.48 
 
 
513 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  44.96 
 
 
520 aa  376  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  44.18 
 
 
491 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  47.58 
 
 
502 aa  376  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  46.83 
 
 
514 aa  374  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  47.38 
 
 
504 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  42.88 
 
 
527 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  42.26 
 
 
527 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  40.78 
 
 
517 aa  362  9e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  45.62 
 
 
483 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  45.96 
 
 
483 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  45.96 
 
 
483 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  47.19 
 
 
508 aa  356  5e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  41.76 
 
 
487 aa  356  5.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  43.18 
 
 
527 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  42.02 
 
 
520 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  44.62 
 
 
523 aa  350  3e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  47.05 
 
 
501 aa  348  9e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  42.77 
 
 
491 aa  347  4e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  44.66 
 
 
509 aa  345  8.999999999999999e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  47.37 
 
 
496 aa  344  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  46.42 
 
 
503 aa  343  4e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  46.42 
 
 
503 aa  343  4e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  43.76 
 
 
508 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  45.89 
 
 
496 aa  342  7e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  44.27 
 
 
516 aa  342  8e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  45.89 
 
 
496 aa  342  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  44.37 
 
 
528 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  44.3 
 
 
493 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  44.3 
 
 
506 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  42.64 
 
 
501 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  44.49 
 
 
493 aa  340  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  41.97 
 
 
535 aa  339  7e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  43.6 
 
 
525 aa  339  9e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  41.26 
 
 
505 aa  338  9.999999999999999e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  45.11 
 
 
485 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  45.84 
 
 
498 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  42.6 
 
 
524 aa  337  3.9999999999999995e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  42.98 
 
 
523 aa  336  7e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  40.78 
 
 
529 aa  335  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  42 
 
 
526 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  43.93 
 
 
508 aa  333  5e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  43.63 
 
 
511 aa  332  8e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  40.93 
 
 
496 aa  330  2e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  42.41 
 
 
524 aa  331  2e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  45.18 
 
 
497 aa  331  2e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  42.53 
 
 
498 aa  330  4e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  40.53 
 
 
537 aa  329  6e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  45.64 
 
 
497 aa  329  7e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  42.37 
 
 
528 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  41.97 
 
 
500 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  46.02 
 
 
501 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  43.14 
 
 
476 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  40.31 
 
 
523 aa  326  5e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  43.42 
 
 
501 aa  326  5e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  38.82 
 
 
522 aa  326  7e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  43.11 
 
 
513 aa  325  8.000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  43.01 
 
 
518 aa  325  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  43.68 
 
 
482 aa  323  7e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  42.98 
 
 
511 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  43.79 
 
 
516 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  42.76 
 
 
511 aa  320  3e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  42.63 
 
 
492 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  43.45 
 
 
501 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  43.21 
 
 
479 aa  319  7e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  42.73 
 
 
499 aa  319  7e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  38.48 
 
 
524 aa  319  9e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  42.41 
 
 
477 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  38.48 
 
 
524 aa  318  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  46.82 
 
 
498 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  42.69 
 
 
471 aa  318  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  40.4 
 
 
502 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  40.4 
 
 
502 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  42.63 
 
 
477 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  40.88 
 
 
515 aa  318  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  41.04 
 
 
520 aa  318  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  40.4 
 
 
502 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  41.9 
 
 
485 aa  317  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  40.19 
 
 
497 aa  317  4e-85  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  46.56 
 
 
499 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  44.03 
 
 
474 aa  316  7e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  43.83 
 
 
474 aa  316  7e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  42.55 
 
 
473 aa  316  7e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  43.52 
 
 
474 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  42.52 
 
 
475 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  39.25 
 
 
506 aa  315  9.999999999999999e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  42.11 
 
 
493 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0922  protease Do family protein  37.97 
 
 
496 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.726985  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  41.06 
 
 
528 aa  312  6.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  39.36 
 
 
476 aa  312  7.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  38.92 
 
 
588 aa  312  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3243  protease Do  41.44 
 
 
488 aa  312  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0128556 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  44.12 
 
 
478 aa  311  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  43.24 
 
 
479 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  43.14 
 
 
481 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  38.68 
 
 
578 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  40.62 
 
 
464 aa  311  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>