More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2013 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  100 
 
 		 524 aa  1028    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  47.94 
 
 		 508 aa  396  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  44.65 
 
 		 500 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  47.15 
 
 		 513 aa  360  3e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  47.15 
 
 		 513 aa  360  3e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  48.5 
 
 		 508 aa  355  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  44.61 
 
 		 501 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  43.1 
 
 		 520 aa  352  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  47.55 
 
 		 501 aa  349  6e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  42.89 
 
 		 491 aa  346  5e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  46.72 
 
 		 504 aa  344  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  43.87 
 
 		 483 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  46.48 
 
 		 503 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  46.48 
 
 		 503 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  43.68 
 
 		 483 aa  343  4e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  47.84 
 
 		 496 aa  342  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  46.44 
 
 		 496 aa  340  4e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  44.32 
 
 		 487 aa  336  5.999999999999999e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  45.49 
 
 		 502 aa  335  9e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  42.83 
 
 		 517 aa  335  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  42.64 
 
 		 529 aa  335  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  46.12 
 
 		 496 aa  335  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  44.92 
 
 		 526 aa  334  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  48.14 
 
 		 509 aa  333  3e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  41.76 
 
 		 527 aa  332  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  42.83 
 
 		 483 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  45.31 
 
 		 525 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  49.62 
 
 		 524 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  44.79 
 
 		 520 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  42.27 
 
 		 528 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  43.13 
 
 		 516 aa  327  3e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  41.29 
 
 		 527 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  42.31 
 
 		 523 aa  323  4e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  42.42 
 
 		 466 aa  323  7e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  46.31 
 
 		 485 aa  322  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  42.01 
 
 		 464 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  44.14 
 
 		 523 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  41.79 
 
 		 476 aa  318  1e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  41.49 
 
 		 527 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  42.88 
 
 		 537 aa  318  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  44.23 
 
 		 528 aa  316  7e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  43.07 
 
 		 514 aa  315  9e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  44.32 
 
 		 458 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  44.12 
 
 		 516 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  43.85 
 
 		 457 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  42.39 
 
 		 479 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  43.95 
 
 		 511 aa  311  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  40.58 
 
 		 491 aa  311  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  42.97 
 
 		 498 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  40.86 
 
 		 477 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  41.25 
 
 		 464 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  42 
 
 		 497 aa  310  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  41.51 
 
 		 501 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  41.92 
 
 		 477 aa  309  8e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  41.39 
 
 		 476 aa  309  9e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  44.31 
 
 		 496 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  46 
 
 		 498 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  38.59 
 
 		 524 aa  308  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  41.79 
 
 		 500 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  38.59 
 
 		 524 aa  307  4.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  42.52 
 
 		 505 aa  306  8.000000000000001e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  43.98 
 
 		 506 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  42.76 
 
 		 461 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  41.48 
 
 		 492 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  39.45 
 
 		 484 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  41.04 
 
 		 520 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  41.56 
 
 		 489 aa  304  3.0000000000000004e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  43.76 
 
 		 493 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  44.22 
 
 		 497 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  42.55 
 
 		 501 aa  302  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  40.81 
 
 		 501 aa  302  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  39.12 
 
 		 508 aa  301  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  39.39 
 
 		 478 aa  301  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  41.98 
 
 		 474 aa  301  3e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  41.16 
 
 		 474 aa  300  6e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  43.01 
 
 		 501 aa  299  9e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  41.76 
 
 		 493 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  42.71 
 
 		 511 aa  297  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  42.49 
 
 		 511 aa  296  4e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  41.94 
 
 		 473 aa  296  9e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  40.52 
 
 		 474 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  37.89 
 
 		 506 aa  293  5e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  41.01 
 
 		 480 aa  291  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  42.99 
 
 		 475 aa  291  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  40.47 
 
 		 481 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  44.75 
 
 		 498 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  38.76 
 
 		 481 aa  290  4e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  40.12 
 
 		 471 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  38.66 
 
 		 588 aa  289  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  39.15 
 
 		 482 aa  288  2e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  42.07 
 
 		 522 aa  288  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  42.16 
 
 		 503 aa  288  2e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  40.08 
 
 		 473 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  43.49 
 
 		 493 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  40.69 
 
 		 499 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  40.77 
 
 		 523 aa  287  4e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  39.58 
 
 		 479 aa  286  5e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  44.25 
 
 		 499 aa  286  7e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  43.76 
 
 		 472 aa  286  8e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  39.4 
 
 		 482 aa  286  9e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>