More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1317 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1317  protease Do  100 
 
 
508 aa  1011    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  46.75 
 
 
524 aa  403  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  44.57 
 
 
500 aa  362  9e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  44.16 
 
 
526 aa  358  9e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  41.31 
 
 
520 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  44.18 
 
 
501 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  43.71 
 
 
513 aa  356  5e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  43.71 
 
 
513 aa  356  5e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  45.81 
 
 
504 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  43.04 
 
 
523 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  45.77 
 
 
502 aa  353  4e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  46.14 
 
 
508 aa  353  4e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  43.13 
 
 
523 aa  353  5e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  41.67 
 
 
527 aa  352  8e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  41.19 
 
 
528 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  44.35 
 
 
520 aa  349  6e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  45.28 
 
 
501 aa  347  3e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  43.08 
 
 
516 aa  347  4e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  43.4 
 
 
528 aa  347  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  45.36 
 
 
496 aa  342  8e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  49.11 
 
 
496 aa  341  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  45.14 
 
 
496 aa  342  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  45.3 
 
 
503 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  45.09 
 
 
503 aa  339  5e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  41.74 
 
 
491 aa  338  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  41.91 
 
 
487 aa  333  3e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  44.11 
 
 
525 aa  329  7e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  39.54 
 
 
529 aa  329  7e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  38.41 
 
 
517 aa  326  6e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  40.86 
 
 
485 aa  322  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  42.27 
 
 
524 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  41.27 
 
 
537 aa  321  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  40.13 
 
 
491 aa  320  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  41.78 
 
 
509 aa  318  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  43.14 
 
 
483 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  43.14 
 
 
483 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  40.22 
 
 
498 aa  315  8e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  42.41 
 
 
513 aa  315  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  36.4 
 
 
527 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  36.02 
 
 
527 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  37.45 
 
 
506 aa  313  5.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  38.91 
 
 
505 aa  312  7.999999999999999e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3889  protease Do  41.68 
 
 
524 aa  311  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42007  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  39.87 
 
 
508 aa  311  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  40.48 
 
 
501 aa  310  5e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  41.25 
 
 
481 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  41.32 
 
 
493 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  41.32 
 
 
506 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  39.19 
 
 
501 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  38.78 
 
 
476 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  40.26 
 
 
501 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  39.78 
 
 
500 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  40.44 
 
 
483 aa  302  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  39.15 
 
 
482 aa  300  4e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  40.74 
 
 
503 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  40.52 
 
 
514 aa  299  7e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  40.04 
 
 
503 aa  299  7e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  39.48 
 
 
475 aa  299  9e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  40.48 
 
 
484 aa  298  1e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  39.61 
 
 
499 aa  298  2e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  40.35 
 
 
493 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  39.35 
 
 
528 aa  298  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  38.74 
 
 
474 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  38.96 
 
 
474 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  38.48 
 
 
492 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  38.48 
 
 
477 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  39.69 
 
 
515 aa  295  1e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  43.43 
 
 
511 aa  294  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  38.26 
 
 
477 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  39.17 
 
 
476 aa  293  6e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  39.22 
 
 
505 aa  293  7e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  38.36 
 
 
502 aa  293  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  40.62 
 
 
458 aa  293  7e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  38.36 
 
 
502 aa  293  7e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  38.36 
 
 
502 aa  292  8e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  38.36 
 
 
502 aa  292  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  38.36 
 
 
502 aa  292  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  38.36 
 
 
485 aa  292  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  38.4 
 
 
485 aa  292  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  36.27 
 
 
472 aa  291  1e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  38.36 
 
 
461 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  39.96 
 
 
457 aa  291  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  38.48 
 
 
491 aa  291  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  38.65 
 
 
466 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  39.78 
 
 
494 aa  290  6e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  39.4 
 
 
480 aa  290  6e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  40.27 
 
 
476 aa  289  7e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  38.78 
 
 
493 aa  289  8e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  37.55 
 
 
490 aa  289  9e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  41.33 
 
 
535 aa  289  9e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  40.96 
 
 
476 aa  289  9e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  38.54 
 
 
511 aa  289  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  37.04 
 
 
474 aa  288  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  37.96 
 
 
479 aa  289  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  39.03 
 
 
522 aa  288  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  39.35 
 
 
493 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  37.88 
 
 
496 aa  287  2e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  39.35 
 
 
493 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  39.35 
 
 
493 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  38.84 
 
 
509 aa  288  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.146477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>