More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3198 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  100 
 
 
474 aa  952    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  63.31 
 
 
476 aa  581  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  63.73 
 
 
472 aa  580  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  60.54 
 
 
471 aa  557  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  60.04 
 
 
476 aa  554  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  60.75 
 
 
476 aa  553  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  66.84 
 
 
388 aa  522  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  48.23 
 
 
478 aa  431  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  45.55 
 
 
466 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  49.31 
 
 
457 aa  372  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  46.94 
 
 
476 aa  366  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  50 
 
 
458 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  46.77 
 
 
464 aa  360  4e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  45.43 
 
 
462 aa  345  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  43.62 
 
 
464 aa  341  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  43.4 
 
 
475 aa  333  6e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  43.02 
 
 
497 aa  332  9e-90  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  45.6 
 
 
481 aa  332  1e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  42.44 
 
 
475 aa  331  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  41.41 
 
 
502 aa  330  4e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  43.24 
 
 
482 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  43.08 
 
 
476 aa  327  3e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  43.17 
 
 
473 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  42.79 
 
 
485 aa  320  3e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  41 
 
 
504 aa  319  6e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  41.72 
 
 
479 aa  317  2e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  39.88 
 
 
499 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  40.95 
 
 
505 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  41.22 
 
 
477 aa  312  6.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  41.97 
 
 
484 aa  311  1e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  41.4 
 
 
485 aa  311  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  42.28 
 
 
465 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  40.41 
 
 
473 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  41.5 
 
 
480 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  41.44 
 
 
478 aa  305  8.000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  40.94 
 
 
474 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  39.86 
 
 
474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  37.28 
 
 
498 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  38.39 
 
 
473 aa  302  8.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  40.91 
 
 
469 aa  302  8.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  42.69 
 
 
461 aa  301  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  39 
 
 
502 aa  301  2e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  38.7 
 
 
506 aa  301  2e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  38.7 
 
 
499 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  37.69 
 
 
524 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  48.45 
 
 
396 aa  299  7e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  41 
 
 
467 aa  298  2e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  38.48 
 
 
499 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  38.2 
 
 
498 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  38.2 
 
 
498 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  38.2 
 
 
498 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  40.04 
 
 
513 aa  295  9e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  40.04 
 
 
513 aa  295  9e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  39.27 
 
 
471 aa  295  1e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  38.41 
 
 
490 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  36.25 
 
 
467 aa  293  3e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  38.79 
 
 
492 aa  293  6e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  38.77 
 
 
485 aa  293  6e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  40.36 
 
 
464 aa  292  7e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  47.45 
 
 
382 aa  292  9e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  37.61 
 
 
500 aa  292  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  41.4 
 
 
458 aa  291  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  40.81 
 
 
473 aa  291  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  38.68 
 
 
505 aa  291  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  40.38 
 
 
477 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  40.23 
 
 
474 aa  291  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  38.77 
 
 
502 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  38.77 
 
 
485 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  42.06 
 
 
483 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  41.83 
 
 
483 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  38.77 
 
 
502 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  38.77 
 
 
502 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  38.77 
 
 
502 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  38.77 
 
 
502 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  40.38 
 
 
492 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  40.42 
 
 
460 aa  289  6e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  38.77 
 
 
461 aa  289  7e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  39.15 
 
 
477 aa  289  7e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  39.15 
 
 
477 aa  289  7e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  40.38 
 
 
477 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  40.38 
 
 
479 aa  289  9e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  38.41 
 
 
496 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  39.55 
 
 
473 aa  288  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2069  protease Do  37.38 
 
 
523 aa  289  1e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719287  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  39.16 
 
 
503 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  40.9 
 
 
453 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  38.94 
 
 
503 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  39.29 
 
 
514 aa  287  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  37.98 
 
 
525 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  38.19 
 
 
498 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  40.14 
 
 
456 aa  286  5e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.72 
 
 
386 aa  286  5.999999999999999e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  40.24 
 
 
446 aa  286  8e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.42 
 
 
401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  46.87 
 
 
404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.42 
 
 
401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  40.76 
 
 
483 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  46.42 
 
 
401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.42 
 
 
401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.12 
 
 
381 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>