More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1383 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  100 
 
 
472 aa  941    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  54.47 
 
 
472 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0764  peptidase S1C, Do  54.43 
 
 
471 aa  489  1e-137  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000251476  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  56.02 
 
 
471 aa  488  1e-136  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0806  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  54.55 
 
 
468 aa  472  1e-132  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00374438  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1064  protease DO  55.08 
 
 
467 aa  472  1e-132  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0185007  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  51.37 
 
 
472 aa  460  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  50.94 
 
 
472 aa  455  1e-127  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1242  protease DO  50.94 
 
 
472 aa  456  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000225025  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  48.82 
 
 
461 aa  424  1e-117  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  40.27 
 
 
513 aa  327  4.0000000000000003e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  43.65 
 
 
502 aa  322  9.000000000000001e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  40.58 
 
 
471 aa  319  7.999999999999999e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  40.22 
 
 
465 aa  316  7e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.41 
 
 
396 aa  315  8e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  45.69 
 
 
383 aa  312  9e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3156  peptidase S1C, Do  39.25 
 
 
464 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  0.845897 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  42.96 
 
 
460 aa  309  9e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  38.13 
 
 
474 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  38.13 
 
 
474 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  37.47 
 
 
476 aa  307  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  38.38 
 
 
463 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  39.17 
 
 
496 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  38.63 
 
 
467 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  40.09 
 
 
511 aa  305  8.000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  48.02 
 
 
403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  42.19 
 
 
504 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  38.34 
 
 
468 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  47.99 
 
 
404 aa  303  6.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  41.47 
 
 
476 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.55 
 
 
385 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  40.38 
 
 
506 aa  301  2e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  38.24 
 
 
457 aa  301  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.55 
 
 
398 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2479  protease Do  38.72 
 
 
450 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  38.44 
 
 
463 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  47.85 
 
 
398 aa  299  6e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  38.88 
 
 
511 aa  299  6e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  45.56 
 
 
386 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  47.58 
 
 
442 aa  298  1e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  47.68 
 
 
404 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.13 
 
 
412 aa  298  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  45.15 
 
 
396 aa  297  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  45.56 
 
 
402 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  39.31 
 
 
469 aa  296  5e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.4 
 
 
442 aa  296  5e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  47.19 
 
 
380 aa  296  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  36.82 
 
 
471 aa  296  6e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  45.56 
 
 
386 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  37.67 
 
 
464 aa  295  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  38.09 
 
 
449 aa  294  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  39.55 
 
 
457 aa  294  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  42.74 
 
 
383 aa  293  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  37.91 
 
 
472 aa  293  5e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  45.27 
 
 
386 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  47.09 
 
 
389 aa  292  7e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  45.51 
 
 
443 aa  292  8e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  39.81 
 
 
476 aa  292  8e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  38.99 
 
 
502 aa  292  1e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.67 
 
 
417 aa  291  1e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  39.36 
 
 
458 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  39.5 
 
 
476 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  37.73 
 
 
464 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  43.31 
 
 
453 aa  290  4e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  46.79 
 
 
389 aa  290  6e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  39.43 
 
 
484 aa  289  7e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  46.15 
 
 
386 aa  289  8e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  39.12 
 
 
499 aa  289  1e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.96 
 
 
398 aa  288  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  39.58 
 
 
476 aa  288  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2497  protease Do  39.06 
 
 
488 aa  288  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2221  protease Do  39.06 
 
 
488 aa  288  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  38.83 
 
 
511 aa  288  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  46.45 
 
 
386 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  39.55 
 
 
458 aa  288  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  47.34 
 
 
392 aa  287  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12950  Htr-like protease  46.39 
 
 
383 aa  287  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  36.65 
 
 
479 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1718  protease Do  38.48 
 
 
471 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759509  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2041  protease Do  34.84 
 
 
480 aa  286  4e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  39.33 
 
 
459 aa  286  5e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  39.28 
 
 
451 aa  286  5e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  39.04 
 
 
450 aa  286  5e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  41.05 
 
 
505 aa  286  5.999999999999999e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  41.04 
 
 
464 aa  286  7e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  39.04 
 
 
450 aa  286  8e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  38.96 
 
 
478 aa  286  8e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  39.04 
 
 
450 aa  286  8e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0470  protease Do  37.79 
 
 
471 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102018  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  42.58 
 
 
458 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  39.56 
 
 
467 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1364  protease Do  37.1 
 
 
467 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  39.47 
 
 
450 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  39.47 
 
 
450 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  39.47 
 
 
450 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  39.47 
 
 
450 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1518  protease Do  37.53 
 
 
504 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2179  protease Do  38.36 
 
 
494 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2762  protease Do  37.14 
 
 
485 aa  283  6.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.280827 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  38.6 
 
 
450 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>