More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1718 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2179  protease Do  74.35 
 
 		 494 aa  686    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1718  protease Do  100 
 
 		 471 aa  929    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2221  protease Do  73.26 
 
 		 488 aa  684    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2497  protease Do  73.26 
 
 		 488 aa  682    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0470  protease Do  91.93 
 
 		 471 aa  825    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102018  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1518  protease Do  72.71 
 
 		 504 aa  661    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4771  protease Do  61.35 
 
 		 496 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.411686  hitchhiker  0.000180606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  58.74 
 
 		 464 aa  498  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3156  peptidase S1C, Do  57.14 
 
 		 464 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  0.845897 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  56.86 
 
 		 463 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  57.62 
 
 		 468 aa  495  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  57.85 
 
 		 496 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  56.08 
 
 		 467 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2041  protease Do  55.14 
 
 		 480 aa  485  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  55.93 
 
 		 463 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2993  protease Do  55.03 
 
 		 476 aa  483  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.700896 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2762  protease Do  53.09 
 
 		 485 aa  445  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280827 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  49.01 
 
 		 476 aa  424  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  50 
 
 		 474 aa  422  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1014  protease Do  49.1 
 
 		 465 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370386  normal  0.451123 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  50 
 
 		 474 aa  422  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  47.95 
 
 		 467 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1364  protease Do  48.75 
 
 		 467 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2485  serine protease  47.31 
 
 		 467 aa  408  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1651  protease Do  50 
 
 		 492 aa  391  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  47.79 
 
 		 485 aa  385  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  49.89 
 
 		 491 aa  374  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1649  protease Do  47.79 
 
 		 474 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0724  putative protease do  44.37 
 
 		 464 aa  355  7.999999999999999e-97  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300996  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0388  protease Do  43.56 
 
 		 461 aa  351  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1742  serine protease  43.56 
 
 		 461 aa  351  2e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2507  protease Do  43.86 
 
 		 461 aa  343  4e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0254484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0287  peptidase S1C, Do  40.17 
 
 		 465 aa  326  5e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  41.99 
 
 		 476 aa  295  9e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  42.15 
 
 		 511 aa  294  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  41.95 
 
 		 457 aa  293  4e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  40.52 
 
 		 465 aa  290  4e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  37.31 
 
 		 472 aa  290  5.0000000000000004e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  40.78 
 
 		 479 aa  286  7e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.33 
 
 		 412 aa  281  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  41.39 
 
 		 450 aa  280  3e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  40.69 
 
 		 450 aa  279  7e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  40.69 
 
 		 450 aa  279  7e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  41.22 
 
 		 458 aa  279  9e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  48.2 
 
 		 404 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  39.91 
 
 		 450 aa  278  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  41.53 
 
 		 501 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  49.84 
 
 		 398 aa  277  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  40.13 
 
 		 449 aa  276  5e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  47.9 
 
 		 404 aa  276  6e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  45.16 
 
 		 403 aa  276  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  41.63 
 
 		 500 aa  276  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  46.81 
 
 		 383 aa  276  8e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  40.72 
 
 		 453 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  46.99 
 
 		 383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.59 
 
 		 385 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  41.2 
 
 		 502 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  44.38 
 
 		 407 aa  273  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  34.97 
 
 		 497 aa  272  9e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  47.4 
 
 		 403 aa  271  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  40.37 
 
 		 458 aa  271  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.56 
 
 		 408 aa  271  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  46.39 
 
 		 380 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  36.77 
 
 		 496 aa  270  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  39.47 
 
 		 446 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.26 
 
 		 396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  38.65 
 
 		 456 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  46.5 
 
 		 386 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  39.16 
 
 		 502 aa  270  4e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.8 
 
 		 398 aa  270  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  50.34 
 
 		 385 aa  270  4e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  39.35 
 
 		 450 aa  270  5e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  38.49 
 
 		 455 aa  270  5.9999999999999995e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  37.34 
 
 		 461 aa  269  7e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.71 
 
 		 390 aa  268  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  44.38 
 
 		 407 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  41.13 
 
 		 458 aa  268  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  41.23 
 
 		 456 aa  268  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  40.56 
 
 		 450 aa  268  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  36.81 
 
 		 474 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  36.81 
 
 		 474 aa  268  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  39.26 
 
 		 450 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  37.63 
 
 		 455 aa  268  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  39.26 
 
 		 450 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  36.81 
 
 		 474 aa  268  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  36.81 
 
 		 474 aa  268  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  36.38 
 
 		 474 aa  268  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  39.26 
 
 		 450 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  36.38 
 
 		 474 aa  268  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  39.26 
 
 		 450 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  36.81 
 
 		 474 aa  268  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  38.95 
 
 		 469 aa  268  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  46.71 
 
 		 389 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  39.13 
 
 		 451 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  41.94 
 
 		 483 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  39.57 
 
 		 508 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  37.1 
 
 		 522 aa  267  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  41.76 
 
 		 483 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  44.29 
 
 		 401 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  46.39 
 
 		 389 aa  267  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>