More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2507 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2507  protease Do  100 
 
 		 461 aa  904    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0254484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0388  protease Do  87.42 
 
 		 461 aa  796    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1742  serine protease  87.2 
 
 		 461 aa  795    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0287  peptidase S1C, Do  59.44 
 
 		 465 aa  485  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1651  protease Do  47.86 
 
 		 492 aa  388  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2762  protease Do  46.09 
 
 		 485 aa  382  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280827 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2485  serine protease  44.44 
 
 		 467 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  46.24 
 
 		 464 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  45.47 
 
 		 476 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  43.94 
 
 		 467 aa  372  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1364  protease Do  44.87 
 
 		 467 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4771  protease Do  47.48 
 
 		 496 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.411686  hitchhiker  0.000180606 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1014  protease Do  46.4 
 
 		 465 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370386  normal  0.451123 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2993  protease Do  43.89 
 
 		 476 aa  365  1e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.700896 
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  46.19 
 
 		 474 aa  364  2e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  46.19 
 
 		 474 aa  364  2e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3156  peptidase S1C, Do  43.23 
 
 		 464 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  0.845897 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  43.25 
 
 		 468 aa  359  7e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  42.76 
 
 		 463 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  43.51 
 
 		 467 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0724  putative protease do  44.09 
 
 		 464 aa  352  8e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300996  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  43.25 
 
 		 496 aa  351  1e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  48.18 
 
 		 491 aa  352  1e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  43.52 
 
 		 463 aa  350  4e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2041  protease Do  43.94 
 
 		 480 aa  349  6e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2497  protease Do  44.04 
 
 		 488 aa  345  1e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2179  protease Do  43.6 
 
 		 494 aa  345  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2221  protease Do  44.04 
 
 		 488 aa  345  1e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1718  protease Do  43.86 
 
 		 471 aa  343  4e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0470  protease Do  43.44 
 
 		 471 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102018  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  45.13 
 
 		 485 aa  337  1.9999999999999998e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1518  protease Do  42.6 
 
 		 504 aa  333  4e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1649  protease Do  42.48 
 
 		 474 aa  293  4e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  39.32 
 
 		 513 aa  288  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.16 
 
 		 412 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  46.63 
 
 		 385 aa  263  4e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  34.4 
 
 		 461 aa  262  6.999999999999999e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1242  protease DO  33.83 
 
 		 472 aa  262  1e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000225025  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  33.83 
 
 		 472 aa  261  2e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  43.28 
 
 		 446 aa  261  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  33.62 
 
 		 472 aa  261  2e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  38.73 
 
 		 483 aa  261  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  38.51 
 
 		 483 aa  260  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  38.09 
 
 		 455 aa  258  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  38.75 
 
 		 483 aa  256  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  37.77 
 
 		 465 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  37.74 
 
 		 459 aa  253  4.0000000000000004e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  34.67 
 
 		 472 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  41.92 
 
 		 383 aa  253  5.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  37.76 
 
 		 500 aa  253  6e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  38.48 
 
 		 449 aa  250  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  43.29 
 
 		 386 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  37.78 
 
 		 478 aa  249  5e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  36.87 
 
 		 456 aa  248  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.38 
 
 		 385 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  36.53 
 
 		 503 aa  247  2e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.85 
 
 		 417 aa  248  2e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  37.37 
 
 		 450 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  36.76 
 
 		 451 aa  247  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  37.04 
 
 		 450 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  37.04 
 
 		 450 aa  247  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  37.04 
 
 		 450 aa  247  4e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  42.77 
 
 		 386 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  42.77 
 
 		 402 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  37.04 
 
 		 450 aa  246  6e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  36.19 
 
 		 450 aa  246  9e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  36.19 
 
 		 450 aa  246  9e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  36.38 
 
 		 455 aa  246  9e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  43.28 
 
 		 386 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  43.73 
 
 		 389 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  38.89 
 
 		 473 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  37.12 
 
 		 476 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  35.5 
 
 		 457 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  37.41 
 
 		 458 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  37.19 
 
 		 502 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  39.74 
 
 		 458 aa  244  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  35.86 
 
 		 469 aa  243  5e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  35.54 
 
 		 455 aa  243  5e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0220  protease Do  39.45 
 
 		 481 aa  243  6e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.850727  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  36.94 
 
 		 450 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  43.43 
 
 		 389 aa  243  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  43.03 
 
 		 380 aa  243  7e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  39.08 
 
 		 469 aa  242  9e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0250  heat shock protein  39.95 
 
 		 481 aa  242  1e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  36.54 
 
 		 455 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  35.87 
 
 		 500 aa  242  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  37.08 
 
 		 456 aa  241  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0764  peptidase S1C, Do  34.39 
 
 		 471 aa  242  1e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000251476  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  37.76 
 
 		 471 aa  241  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  36.91 
 
 		 451 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  36.55 
 
 		 456 aa  241  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  36.54 
 
 		 455 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  36.54 
 
 		 455 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  34.19 
 
 		 462 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  36.48 
 
 		 485 aa  240  4e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3800  protease Do  37.59 
 
 		 456 aa  240  4e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00053297  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  36.62 
 
 		 451 aa  239  5e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  35.56 
 
 		 466 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3669  serine endoprotease  34.65 
 
 		 455 aa  239  6.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0364754  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3646  serine endoprotease  36.32 
 
 		 455 aa  239  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>