More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2179 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1518  protease Do  77.56 
 
 		 504 aa  705    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2497  protease Do  92.51 
 
 		 488 aa  896    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2179  protease Do  100 
 
 		 494 aa  986    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1718  protease Do  76.34 
 
 		 471 aa  688    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0470  protease Do  76.34 
 
 		 471 aa  687    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102018  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2221  protease Do  92.71 
 
 		 488 aa  898    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4771  protease Do  58.71 
 
 		 496 aa  497  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.411686  hitchhiker  0.000180606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  56.98 
 
 		 468 aa  498  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  57.21 
 
 		 496 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  56.98 
 
 		 464 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  55.24 
 
 		 463 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  56.73 
 
 		 463 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2041  protease Do  56.51 
 
 		 480 aa  486  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3156  peptidase S1C, Do  55.88 
 
 		 464 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  0.845897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  56.42 
 
 		 467 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2993  protease Do  55.8 
 
 		 476 aa  475  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.700896 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2762  protease Do  53.32 
 
 		 485 aa  452  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280827 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  51.33 
 
 		 476 aa  441  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  48.73 
 
 		 474 aa  424  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  48.73 
 
 		 474 aa  424  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1364  protease Do  48.43 
 
 		 467 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1014  protease Do  48.99 
 
 		 465 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370386  normal  0.451123 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  48.43 
 
 		 467 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1651  protease Do  49.78 
 
 		 492 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2485  serine protease  45.98 
 
 		 467 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  46.43 
 
 		 485 aa  382  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  49.24 
 
 		 491 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0724  putative protease do  47.17 
 
 		 464 aa  371  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300996  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1649  protease Do  46.77 
 
 		 474 aa  360  3e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0388  protease Do  44.94 
 
 		 461 aa  355  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1742  serine protease  44.72 
 
 		 461 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2507  protease Do  44.04 
 
 		 461 aa  347  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0254484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0287  peptidase S1C, Do  41.1 
 
 		 465 aa  331  2e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  43.42 
 
 		 511 aa  311  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  41.83 
 
 		 476 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  41.2 
 
 		 457 aa  295  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  37.91 
 
 		 478 aa  290  3e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  41.44 
 
 		 458 aa  289  7e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  38.1 
 
 		 472 aa  288  1e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.28 
 
 		 412 aa  288  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  39.31 
 
 		 450 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  39.52 
 
 		 450 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  39.52 
 
 		 450 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  39.52 
 
 		 450 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  40.89 
 
 		 465 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  39.91 
 
 		 479 aa  282  9e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  40.88 
 
 		 449 aa  282  9e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  40.24 
 
 		 491 aa  282  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  38.6 
 
 		 455 aa  281  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  51.33 
 
 		 398 aa  280  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  51.84 
 
 		 385 aa  279  7e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  39.15 
 
 		 456 aa  279  7e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  45.86 
 
 		 403 aa  278  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.86 
 
 		 390 aa  278  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  45.09 
 
 		 403 aa  278  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  39.37 
 
 		 446 aa  277  3e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  42.93 
 
 		 483 aa  277  4e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  37.58 
 
 		 455 aa  276  5e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  42.69 
 
 		 483 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  47.89 
 
 		 383 aa  276  5e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  45.51 
 
 		 407 aa  276  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  39.64 
 
 		 450 aa  276  8e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  47.35 
 
 		 404 aa  276  8e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  47.35 
 
 		 404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  38.5 
 
 		 455 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.67 
 
 		 398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  38.5 
 
 		 485 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  43.69 
 
 		 460 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.62 
 
 		 385 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  40.86 
 
 		 502 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  44.93 
 
 		 407 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  39.2 
 
 		 453 aa  274  3e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  38.23 
 
 		 497 aa  273  4.0000000000000004e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  40.46 
 
 		 458 aa  273  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  39.59 
 
 		 450 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  39.42 
 
 		 450 aa  273  7e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  41.9 
 
 		 458 aa  273  7e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  39.36 
 
 		 450 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  38.57 
 
 		 476 aa  271  1e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  39.36 
 
 		 450 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  40.36 
 
 		 469 aa  272  1e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  40.05 
 
 		 451 aa  272  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  44.28 
 
 		 392 aa  271  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  41.06 
 
 		 513 aa  272  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  39.36 
 
 		 450 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  44.48 
 
 		 383 aa  271  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  38.52 
 
 		 461 aa  271  2e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  39.31 
 
 		 449 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  41.01 
 
 		 475 aa  270  5e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  41 
 
 		 501 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0789  serine endoprotease  36.53 
 
 		 476 aa  270  5.9999999999999995e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.290182 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  39.67 
 
 		 500 aa  269  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  40.33 
 
 		 477 aa  269  7e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.32 
 
 		 396 aa  269  8e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  46.53 
 
 		 401 aa  269  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  44.58 
 
 		 380 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  45.95 
 
 		 388 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  40.7 
 
 		 469 aa  268  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.53 
 
 		 401 aa  269  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  38.37 
 
 		 457 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>