More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4771 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4771  protease Do  100 
 
 		 496 aa  974    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.411686  hitchhiker  0.000180606 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  62.55 
 
 		 463 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  63.1 
 
 		 467 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3156  peptidase S1C, Do  61.42 
 
 		 464 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  0.845897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  64.13 
 
 		 464 aa  570  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  63.68 
 
 		 496 aa  566  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  61.66 
 
 		 468 aa  555  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  60.99 
 
 		 463 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1718  protease Do  62.02 
 
 		 471 aa  533  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2041  protease Do  59.64 
 
 		 480 aa  519  1e-146  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0470  protease Do  60.9 
 
 		 471 aa  520  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102018  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2497  protease Do  58.8 
 
 		 488 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2221  protease Do  58.8 
 
 		 488 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2179  protease Do  59.6 
 
 		 494 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1518  protease Do  57.46 
 
 		 504 aa  489  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2993  protease Do  56.03 
 
 		 476 aa  478  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.700896 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1651  protease Do  51.39 
 
 		 492 aa  464  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2762  protease Do  53.57 
 
 		 485 aa  460  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280827 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  53.63 
 
 		 476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  53.42 
 
 		 474 aa  450  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  53.42 
 
 		 474 aa  450  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  51.67 
 
 		 467 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1364  protease Do  51.57 
 
 		 467 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  54.14 
 
 		 491 aa  430  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1014  protease Do  50.44 
 
 		 465 aa  425  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370386  normal  0.451123 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2485  serine protease  49.67 
 
 		 467 aa  421  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0724  putative protease do  47.96 
 
 		 464 aa  402  1e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300996  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1742  serine protease  48.76 
 
 		 461 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0388  protease Do  48.53 
 
 		 461 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  47.64 
 
 		 485 aa  388  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2507  protease Do  47.63 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0254484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1649  protease Do  48.28 
 
 		 474 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0287  peptidase S1C, Do  43.01 
 
 		 465 aa  333  6e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  47.08 
 
 		 383 aa  300  3e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  50.62 
 
 		 383 aa  298  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  49.71 
 
 		 403 aa  296  7e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  50.44 
 
 		 404 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  41.39 
 
 		 513 aa  293  5e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  50.61 
 
 		 385 aa  293  7e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  42.69 
 
 		 457 aa  292  8e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  49.56 
 
 		 404 aa  292  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  37.19 
 
 		 472 aa  291  3e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  43.61 
 
 		 458 aa  288  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.76 
 
 		 396 aa  286  4e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  48.85 
 
 		 398 aa  286  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.58 
 
 		 385 aa  286  5e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  35.09 
 
 		 503 aa  286  5e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  48.33 
 
 		 386 aa  286  8e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.71 
 
 		 398 aa  286  8e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  49.09 
 
 		 401 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  45.22 
 
 		 396 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.09 
 
 		 401 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.09 
 
 		 401 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  47.42 
 
 		 402 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  47.42 
 
 		 386 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1183  HtrA2 peptidase  50.16 
 
 		 386 aa  283  6.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.31 
 
 		 412 aa  283  7.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  47.72 
 
 		 386 aa  282  9e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  48.8 
 
 		 380 aa  281  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  38.61 
 
 		 473 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  42.4 
 
 		 483 aa  282  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  48.04 
 
 		 389 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  42.17 
 
 		 483 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  42.45 
 
 		 458 aa  281  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  48.48 
 
 		 402 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  47.11 
 
 		 403 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  48.48 
 
 		 401 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.48 
 
 		 401 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.48 
 
 		 401 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  37.2 
 
 		 458 aa  280  4e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  49.84 
 
 		 386 aa  280  6e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  47.76 
 
 		 388 aa  279  7e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  39.39 
 
 		 450 aa  279  7e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  47.76 
 
 		 402 aa  279  9e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  47.59 
 
 		 389 aa  279  9e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  47.76 
 
 		 402 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  47.88 
 
 		 407 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  47.76 
 
 		 402 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  47.76 
 
 		 402 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  47.76 
 
 		 402 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  37.61 
 
 		 461 aa  277  3e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  38.45 
 
 		 449 aa  277  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  47.88 
 
 		 407 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  48.18 
 
 		 392 aa  277  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  47.76 
 
 		 387 aa  277  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  40.38 
 
 		 465 aa  276  6e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  39.18 
 
 		 455 aa  276  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  40.95 
 
 		 476 aa  276  7e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  40.74 
 
 		 450 aa  276  7e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  47.46 
 
 		 388 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  39.26 
 
 		 473 aa  276  9e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  40.34 
 
 		 450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  36.94 
 
 		 497 aa  274  2.0000000000000002e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.27 
 
 		 379 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  40.35 
 
 		 478 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  40.55 
 
 		 450 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  40.55 
 
 		 450 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  38.82 
 
 		 455 aa  274  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  41.71 
 
 		 483 aa  274  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0250  heat shock protein  42.5 
 
 		 481 aa  274  3e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>