More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2485 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  68.8 
 
 		 467 aa  650    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2485  serine protease  100 
 
 		 467 aa  938    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1364  protease Do  69.98 
 
 		 467 aa  637    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1014  protease Do  65.18 
 
 		 465 aa  600  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370386  normal  0.451123 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  56.73 
 
 		 476 aa  499  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  54.53 
 
 		 474 aa  494  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  54.53 
 
 		 474 aa  494  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1651  protease Do  51.88 
 
 		 492 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  49.56 
 
 		 463 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  50.46 
 
 		 464 aa  438  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  48.9 
 
 		 463 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3156  peptidase S1C, Do  49.12 
 
 		 464 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  0.845897 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0470  protease Do  50.11 
 
 		 471 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102018  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  49.12 
 
 		 467 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  49.1 
 
 		 468 aa  427  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2762  protease Do  50.55 
 
 		 485 aa  422  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280827 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  48.88 
 
 		 496 aa  423  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2993  protease Do  47.88 
 
 		 476 aa  423  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.700896 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1718  protease Do  48.53 
 
 		 471 aa  423  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4771  protease Do  49.45 
 
 		 496 aa  421  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.411686  hitchhiker  0.000180606 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0724  putative protease do  50.57 
 
 		 464 aa  419  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300996  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2179  protease Do  47.09 
 
 		 494 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2221  protease Do  46.86 
 
 		 488 aa  411  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2497  protease Do  46.86 
 
 		 488 aa  411  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2041  protease Do  47.1 
 
 		 480 aa  402  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1518  protease Do  46.19 
 
 		 504 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1742  serine protease  44.83 
 
 		 461 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2507  protease Do  45.43 
 
 		 461 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0254484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0388  protease Do  44.83 
 
 		 461 aa  388  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  43.25 
 
 		 485 aa  371  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  45.09 
 
 		 491 aa  362  6e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0287  peptidase S1C, Do  42.79 
 
 		 465 aa  351  1e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1649  protease Do  45.78 
 
 		 474 aa  343  2.9999999999999997e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  40.22 
 
 		 455 aa  292  8e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  40.17 
 
 		 458 aa  291  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  41.31 
 
 		 464 aa  289  9e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  39.83 
 
 		 455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  46.11 
 
 		 398 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  39.27 
 
 		 458 aa  285  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.87 
 
 		 412 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  41.07 
 
 		 513 aa  282  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  40.35 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  39.86 
 
 		 456 aa  278  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  40.35 
 
 		 458 aa  277  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.83 
 
 		 398 aa  276  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  36.12 
 
 		 472 aa  273  6e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  36.28 
 
 		 472 aa  272  8.000000000000001e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  38.07 
 
 		 472 aa  270  5e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  41.02 
 
 		 465 aa  269  8e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  40.4 
 
 		 450 aa  267  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  40.4 
 
 		 450 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  38.41 
 
 		 464 aa  267  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  42.66 
 
 		 403 aa  266  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  40.4 
 
 		 450 aa  266  5e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  37.22 
 
 		 455 aa  266  5.999999999999999e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  39.25 
 
 		 482 aa  266  8e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  38.95 
 
 		 450 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  38.65 
 
 		 478 aa  265  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  39.13 
 
 		 475 aa  265  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  37.95 
 
 		 456 aa  265  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  39.91 
 
 		 476 aa  264  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  39.91 
 
 		 453 aa  264  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  37.16 
 
 		 472 aa  264  3e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.93 
 
 		 396 aa  264  3e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1242  protease DO  37.16 
 
 		 472 aa  264  3e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000225025  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  39.31 
 
 		 501 aa  263  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  43.68 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  43.68 
 
 		 402 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  40.68 
 
 		 451 aa  263  4e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3530  serine endoprotease  38.75 
 
 		 455 aa  263  4e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00269541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  37.58 
 
 		 466 aa  263  4e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03094  serine endoprotease, periplasmic  38.53 
 
 		 455 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0472  protease Do  38.53 
 
 		 455 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00978488  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03045  hypothetical protein  38.53 
 
 		 455 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.471822  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3423  serine endoprotease  38.53 
 
 		 455 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  43.73 
 
 		 396 aa  263  6.999999999999999e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3542  serine endoprotease  38.53 
 
 		 455 aa  263  6.999999999999999e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0472  serine endoprotease  38.53 
 
 		 455 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0649674  normal  0.0819783 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3717  serine endoprotease  38.53 
 
 		 455 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000159943  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  43.68 
 
 		 402 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  43.68 
 
 		 402 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  43.68 
 
 		 388 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  43.68 
 
 		 402 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  43.68 
 
 		 402 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  41.16 
 
 		 383 aa  262  8e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  44.64 
 
 		 401 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  38.95 
 
 		 473 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  40.45 
 
 		 450 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  40.45 
 
 		 450 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.64 
 
 		 401 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  40.45 
 
 		 450 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  43.18 
 
 		 404 aa  262  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4551  serine endoprotease  38.31 
 
 		 455 aa  261  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00837947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  44.38 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  41.96 
 
 		 460 aa  261  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  43.39 
 
 		 387 aa  261  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.35 
 
 		 401 aa  259  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  44.35 
 
 		 401 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.35 
 
 		 401 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.35 
 
 		 401 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>