More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2762 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2762  protease Do  100 
 
 		 485 aa  967    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280827 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  54.19 
 
 		 463 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  54.89 
 
 		 467 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  55.27 
 
 		 463 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  55.97 
 
 		 468 aa  473  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  55.68 
 
 		 464 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3156  peptidase S1C, Do  54.99 
 
 		 464 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  0.845897 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  55.41 
 
 		 496 aa  463  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2221  protease Do  53.48 
 
 		 488 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2497  protease Do  53.7 
 
 		 488 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2041  protease Do  52.39 
 
 		 480 aa  449  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2993  protease Do  52.26 
 
 		 476 aa  451  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.700896 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  53 
 
 		 476 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2179  protease Do  53.32 
 
 		 494 aa  442  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  53.19 
 
 		 474 aa  441  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  53.19 
 
 		 474 aa  441  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4771  protease Do  52.7 
 
 		 496 aa  438  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.411686  hitchhiker  0.000180606 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0470  protease Do  54.14 
 
 		 471 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102018  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1718  protease Do  53.69 
 
 		 471 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1518  protease Do  52.01 
 
 		 504 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  52.91 
 
 		 491 aa  412  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  49.89 
 
 		 467 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1651  protease Do  50.22 
 
 		 492 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  48.96 
 
 		 485 aa  406  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1364  protease Do  50.45 
 
 		 467 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0724  putative protease do  49.09 
 
 		 464 aa  399  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300996  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2485  serine protease  50.55 
 
 		 467 aa  395  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1014  protease Do  49.55 
 
 		 465 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370386  normal  0.451123 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1742  serine protease  48.57 
 
 		 461 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0388  protease Do  48.34 
 
 		 461 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2507  protease Do  46.64 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0254484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1649  protease Do  47.86 
 
 		 474 aa  360  4e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0287  peptidase S1C, Do  42.43 
 
 		 465 aa  338  9.999999999999999e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  41.51 
 
 		 458 aa  301  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  41.28 
 
 		 513 aa  301  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.13 
 
 		 412 aa  295  9e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  41.39 
 
 		 476 aa  295  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  38 
 
 		 461 aa  295  1e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  41.69 
 
 		 455 aa  295  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  41.26 
 
 		 455 aa  288  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  44.39 
 
 		 396 aa  288  1e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  49.42 
 
 		 383 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  46.78 
 
 		 383 aa  288  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  48.31 
 
 		 385 aa  286  5e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  37.14 
 
 		 472 aa  283  7.000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  38.71 
 
 		 456 aa  282  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  39.91 
 
 		 450 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  38.53 
 
 		 455 aa  282  1e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  39.67 
 
 		 457 aa  282  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  38.68 
 
 		 450 aa  281  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  39.91 
 
 		 450 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  44.44 
 
 		 398 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  39.91 
 
 		 450 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  37.97 
 
 		 472 aa  281  2e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  40.36 
 
 		 450 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.7 
 
 		 396 aa  280  4e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  38.61 
 
 		 491 aa  279  6e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1242  protease DO  38.19 
 
 		 472 aa  279  6e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000225025  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  40.22 
 
 		 451 aa  279  7e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  40.13 
 
 		 450 aa  279  7e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  40.13 
 
 		 450 aa  279  7e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  38.19 
 
 		 472 aa  278  1e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  39.69 
 
 		 450 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  41.91 
 
 		 449 aa  278  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  39.47 
 
 		 465 aa  277  3e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  40.48 
 
 		 476 aa  277  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  46.57 
 
 		 404 aa  276  4e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  41.57 
 
 		 464 aa  276  5e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  46.27 
 
 		 404 aa  276  6e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  42.02 
 
 		 501 aa  276  8e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  43.92 
 
 		 386 aa  276  9e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  40.17 
 
 		 483 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  37.32 
 
 		 446 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  44.24 
 
 		 402 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  45.51 
 
 		 403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  39.96 
 
 		 483 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  44.59 
 
 		 386 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  40.28 
 
 		 450 aa  274  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.15 
 
 		 385 aa  274  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.3 
 
 		 398 aa  274  3e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  49.23 
 
 		 386 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  40 
 
 		 476 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  41.2 
 
 		 458 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.06 
 
 		 398 aa  273  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  39.15 
 
 		 476 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  39.13 
 
 		 458 aa  272  9e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  38.57 
 
 		 449 aa  272  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  39.6 
 
 		 474 aa  271  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  42.59 
 
 		 392 aa  271  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  39.53 
 
 		 453 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  36.98 
 
 		 472 aa  270  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  38.1 
 
 		 471 aa  269  7e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.26 
 
 		 408 aa  269  7e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  42.32 
 
 		 402 aa  269  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3323  serine endoprotease  35.52 
 
 		 481 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00403874  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3452  serine endoprotease  35.52 
 
 		 481 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342049  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  36.26 
 
 		 503 aa  269  1e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  38.59 
 
 		 469 aa  268  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  38.37 
 
 		 508 aa  268  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  46.54 
 
 		 389 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>