More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1014 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  67.03 
 
 		 467 aa  637    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1014  protease Do  100 
 
 		 465 aa  922    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370386  normal  0.451123 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1364  protease Do  67.89 
 
 		 467 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2485  serine protease  64.85 
 
 		 467 aa  584  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  56.77 
 
 		 476 aa  508  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  55.15 
 
 		 474 aa  496  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  55.15 
 
 		 474 aa  496  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1651  protease Do  57.24 
 
 		 492 aa  478  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3156  peptidase S1C, Do  50.66 
 
 		 464 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  0.845897 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  49.78 
 
 		 463 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0724  putative protease do  51.93 
 
 		 464 aa  434  1e-120  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300996  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  49.78 
 
 		 463 aa  435  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  50 
 
 		 467 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  50.9 
 
 		 468 aa  427  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0470  protease Do  50.11 
 
 		 471 aa  428  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102018  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1718  protease Do  49.21 
 
 		 471 aa  423  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  49.21 
 
 		 496 aa  414  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2179  protease Do  48.99 
 
 		 494 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  49.2 
 
 		 464 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2993  protease Do  47.89 
 
 		 476 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.700896 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2221  protease Do  49.45 
 
 		 488 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2497  protease Do  49.45 
 
 		 488 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4771  protease Do  49.13 
 
 		 496 aa  410  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.411686  hitchhiker  0.000180606 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2041  protease Do  48.43 
 
 		 480 aa  409  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1518  protease Do  45.92 
 
 		 504 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2762  protease Do  48.82 
 
 		 485 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280827 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  46.41 
 
 		 485 aa  383  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0388  protease Do  46.27 
 
 		 461 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1742  serine protease  46.27 
 
 		 461 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2507  protease Do  46.4 
 
 		 461 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0254484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1649  protease Do  47.9 
 
 		 474 aa  361  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  46.49 
 
 		 491 aa  347  2e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0287  peptidase S1C, Do  43.38 
 
 		 465 aa  325  1e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  48.35 
 
 		 404 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.49 
 
 		 412 aa  281  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  48.05 
 
 		 404 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  36.65 
 
 		 472 aa  278  2e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  48.16 
 
 		 403 aa  276  6e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  37.08 
 
 		 472 aa  276  6e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  39.76 
 
 		 457 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  38.32 
 
 		 500 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  47.26 
 
 		 398 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1242  protease DO  36.86 
 
 		 472 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000225025  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  38.29 
 
 		 501 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  42.65 
 
 		 465 aa  271  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  34.66 
 
 		 472 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  39.42 
 
 		 483 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  39.64 
 
 		 483 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.77 
 
 		 398 aa  268  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  39.36 
 
 		 458 aa  266  7e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  37.63 
 
 		 514 aa  266  8.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  39.39 
 
 		 476 aa  264  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  38.06 
 
 		 450 aa  264  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  38.06 
 
 		 450 aa  264  3e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  32.81 
 
 		 472 aa  263  4e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  38.06 
 
 		 450 aa  263  6e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  42.13 
 
 		 483 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  39.55 
 
 		 473 aa  260  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  37.63 
 
 		 450 aa  259  6e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  37.92 
 
 		 506 aa  259  1e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  37.06 
 
 		 455 aa  258  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  43.88 
 
 		 392 aa  257  3e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  45.48 
 
 		 396 aa  256  4e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  41.44 
 
 		 464 aa  256  9e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  40.26 
 
 		 458 aa  255  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  35.85 
 
 		 502 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  37.28 
 
 		 451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  37.61 
 
 		 504 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  37.07 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  36.49 
 
 		 478 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  38.41 
 
 		 464 aa  254  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  37.05 
 
 		 480 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  35.98 
 
 		 467 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.16 
 
 		 390 aa  253  7e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  36.44 
 
 		 508 aa  253  7e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  44.51 
 
 		 380 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  39.41 
 
 		 501 aa  252  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  38.1 
 
 		 476 aa  251  2e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  42.27 
 
 		 386 aa  251  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  37.22 
 
 		 453 aa  251  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  42.36 
 
 		 383 aa  251  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.36 
 
 		 408 aa  251  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  36.99 
 
 		 450 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50 
 
 		 396 aa  250  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  36.99 
 
 		 450 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  41.44 
 
 		 403 aa  250  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  37.18 
 
 		 458 aa  250  5e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  36.77 
 
 		 450 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  43.81 
 
 		 386 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4551  serine endoprotease  34.92 
 
 		 455 aa  249  6e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00837947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  37.31 
 
 		 487 aa  249  7e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3530  serine endoprotease  34.92 
 
 		 455 aa  249  7e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00269541  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03094  serine endoprotease, periplasmic  34.92 
 
 		 455 aa  249  9e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0472  protease Do  34.92 
 
 		 455 aa  249  9e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00978488  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03045  hypothetical protein  34.92 
 
 		 455 aa  249  9e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.471822  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3423  serine endoprotease  34.92 
 
 		 455 aa  249  9e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3542  serine endoprotease  34.92 
 
 		 455 aa  249  9e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0472  serine endoprotease  34.92 
 
 		 455 aa  249  9e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0649674  normal  0.0819783 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3717  serine endoprotease  34.92 
 
 		 455 aa  249  9e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000159943  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  43.81 
 
 		 387 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>