More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2993 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2041  protease Do  69.51 
 
 		 480 aa  640    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2993  protease Do  100 
 
 		 476 aa  947    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.700896 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  60.18 
 
 		 464 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  58.39 
 
 		 463 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3156  peptidase S1C, Do  58.39 
 
 		 464 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  0.845897 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  58.67 
 
 		 496 aa  502  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  57.05 
 
 		 467 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  56.9 
 
 		 463 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0470  protease Do  57.88 
 
 		 471 aa  496  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102018  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2221  protease Do  56.64 
 
 		 488 aa  496  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2497  protease Do  56.64 
 
 		 488 aa  495  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1718  protease Do  57.21 
 
 		 471 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  56.33 
 
 		 468 aa  490  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2179  protease Do  55.8 
 
 		 494 aa  484  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1518  protease Do  55.38 
 
 		 504 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4771  protease Do  56.89 
 
 		 496 aa  474  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.411686  hitchhiker  0.000180606 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2762  protease Do  52.26 
 
 		 485 aa  463  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280827 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  48.39 
 
 		 476 aa  430  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  47.92 
 
 		 467 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  48.91 
 
 		 474 aa  422  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  48.91 
 
 		 474 aa  422  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1364  protease Do  49.31 
 
 		 467 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2485  serine protease  47.26 
 
 		 467 aa  415  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1651  protease Do  48.98 
 
 		 492 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1014  protease Do  48.53 
 
 		 465 aa  411  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370386  normal  0.451123 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0724  putative protease do  47.17 
 
 		 464 aa  395  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300996  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  48.44 
 
 		 491 aa  382  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0388  protease Do  45.7 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1742  serine protease  45.25 
 
 		 461 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  47.93 
 
 		 485 aa  373  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2507  protease Do  44.8 
 
 		 461 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0254484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1649  protease Do  46.44 
 
 		 474 aa  342  5.999999999999999e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0287  peptidase S1C, Do  41.23 
 
 		 465 aa  322  9.000000000000001e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  39.24 
 
 		 478 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  49.83 
 
 		 383 aa  278  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  39.35 
 
 		 458 aa  276  6e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  46.09 
 
 		 383 aa  276  7e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  47.53 
 
 		 403 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  36.77 
 
 		 474 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  36.77 
 
 		 474 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  36.77 
 
 		 474 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  36.77 
 
 		 474 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  36.77 
 
 		 474 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.95 
 
 		 401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  36.77 
 
 		 474 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  36.77 
 
 		 474 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  46.25 
 
 		 398 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  46.63 
 
 		 402 aa  274  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  47.26 
 
 		 388 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  46.95 
 
 		 401 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.48 
 
 		 398 aa  274  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.95 
 
 		 401 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.95 
 
 		 401 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  39.76 
 
 		 457 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  47.26 
 
 		 402 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  46.65 
 
 		 401 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.65 
 
 		 401 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  47.5 
 
 		 407 aa  273  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  47.26 
 
 		 402 aa  272  9e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  47.26 
 
 		 402 aa  272  9e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  47.26 
 
 		 402 aa  272  9e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  47.26 
 
 		 402 aa  272  9e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  46.11 
 
 		 407 aa  272  9e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  36.29 
 
 		 474 aa  272  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  35.12 
 
 		 476 aa  272  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  37.21 
 
 		 476 aa  271  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  39.16 
 
 		 450 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  39.16 
 
 		 450 aa  270  4e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  39.16 
 
 		 450 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  46.95 
 
 		 388 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  46.65 
 
 		 387 aa  270  5e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  38.1 
 
 		 508 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  45.43 
 
 		 403 aa  268  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  38.72 
 
 		 450 aa  268  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  37.42 
 
 		 455 aa  268  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  44.27 
 
 		 392 aa  268  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.64 
 
 		 412 aa  268  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00159  hypothetical protein  36.34 
 
 		 474 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  37.01 
 
 		 474 aa  268  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  36.76 
 
 		 496 aa  267  4e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  35.96 
 
 		 476 aa  267  4e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  36.34 
 
 		 485 aa  266  4e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  40.09 
 
 		 473 aa  266  5e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0789  serine endoprotease  36.4 
 
 		 476 aa  266  5e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.290182 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  46.46 
 
 		 404 aa  266  8e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0248  serine endoprotease  37.01 
 
 		 478 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  46.75 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0232  serine endoprotease  37.01 
 
 		 475 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0586414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  33.48 
 
 		 472 aa  265  1e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  41.28 
 
 		 483 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0229  serine endoprotease  37.01 
 
 		 475 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0246  serine endoprotease  37.01 
 
 		 475 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.561258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  39.29 
 
 		 458 aa  265  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  39.34 
 
 		 460 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0230  serine endoprotease  37.01 
 
 		 478 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  44.12 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  41.06 
 
 		 483 aa  265  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  38.88 
 
 		 456 aa  264  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  44.12 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  37.3 
 
 		 475 aa  264  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>