More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1742 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2507  protease Do  88.12 
 
 		 461 aa  781    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0254484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0388  protease Do  99.57 
 
 		 461 aa  894    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1742  serine protease  100 
 
 		 461 aa  901    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0287  peptidase S1C, Do  59.38 
 
 		 465 aa  487  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1651  protease Do  48.11 
 
 		 492 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2762  protease Do  48.57 
 
 		 485 aa  387  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280827 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3156  peptidase S1C, Do  46.19 
 
 		 464 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  0.845897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  46.92 
 
 		 464 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  47.87 
 
 		 476 aa  381  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  46.42 
 
 		 463 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  46.27 
 
 		 467 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4771  protease Do  48.76 
 
 		 496 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.411686  hitchhiker  0.000180606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  45.41 
 
 		 463 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  44.83 
 
 		 467 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2485  serine protease  44.28 
 
 		 467 aa  375  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1014  protease Do  46.24 
 
 		 465 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370386  normal  0.451123 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1364  protease Do  45.91 
 
 		 467 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2993  protease Do  45.25 
 
 		 476 aa  369  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.700896 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  44.7 
 
 		 468 aa  371  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  46.32 
 
 		 474 aa  366  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  46.32 
 
 		 474 aa  366  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2041  protease Do  44.25 
 
 		 480 aa  361  1e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  43.75 
 
 		 496 aa  360  3e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2497  protease Do  45.01 
 
 		 488 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2221  protease Do  45.01 
 
 		 488 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0724  putative protease do  42.86 
 
 		 464 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300996  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2179  protease Do  44.27 
 
 		 494 aa  351  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1718  protease Do  43.64 
 
 		 471 aa  346  6e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1518  protease Do  42.7 
 
 		 504 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  47.32 
 
 		 491 aa  339  5e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0470  protease Do  43.18 
 
 		 471 aa  339  7e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102018  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  45.15 
 
 		 485 aa  337  1.9999999999999998e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  40.4 
 
 		 513 aa  290  3e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1649  protease Do  42.22 
 
 		 474 aa  286  4e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  39.25 
 
 		 483 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.76 
 
 		 412 aa  272  8.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  39.04 
 
 		 483 aa  272  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  38.11 
 
 		 455 aa  267  4e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  39.91 
 
 		 465 aa  264  3e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  34.88 
 
 		 472 aa  263  3e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1242  protease DO  34.88 
 
 		 472 aa  262  1e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000225025  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  34.88 
 
 		 472 aa  261  2e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  42.92 
 
 		 446 aa  260  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  39.53 
 
 		 483 aa  259  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  37.28 
 
 		 459 aa  258  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  47.09 
 
 		 385 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  34.98 
 
 		 461 aa  258  2e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  36.84 
 
 		 455 aa  257  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  38.67 
 
 		 449 aa  257  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  38.14 
 
 		 456 aa  257  4e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  35.27 
 
 		 472 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  36.83 
 
 		 450 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  36.83 
 
 		 450 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  36.83 
 
 		 450 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  37.47 
 
 		 500 aa  253  6e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  46.64 
 
 		 383 aa  251  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  37.26 
 
 		 451 aa  250  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  36.62 
 
 		 450 aa  250  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  37.11 
 
 		 478 aa  250  4e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  38.7 
 
 		 456 aa  248  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  34.95 
 
 		 462 aa  248  1e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  36.22 
 
 		 503 aa  248  2e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  36 
 
 		 456 aa  247  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  37.84 
 
 		 449 aa  247  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  35.76 
 
 		 450 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  36.6 
 
 		 455 aa  247  4e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  35.76 
 
 		 450 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  35.76 
 
 		 450 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  39.31 
 
 		 473 aa  246  6.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  34.33 
 
 		 497 aa  246  9e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.31 
 
 		 385 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  33.56 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  36.55 
 
 		 500 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  35.55 
 
 		 450 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  38.9 
 
 		 450 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  37.69 
 
 		 473 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  36.86 
 
 		 458 aa  243  3.9999999999999997e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  35.63 
 
 		 469 aa  243  5e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.76 
 
 		 417 aa  243  7e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  43.59 
 
 		 383 aa  242  7.999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  40.73 
 
 		 386 aa  242  9e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  42.06 
 
 		 386 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  36.82 
 
 		 453 aa  242  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  42.18 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  38.98 
 
 		 457 aa  241  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  34.24 
 
 		 484 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  36.79 
 
 		 476 aa  240  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  40.73 
 
 		 402 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  36.01 
 
 		 458 aa  239  5.999999999999999e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  41.47 
 
 		 386 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3800  protease Do  36.8 
 
 		 456 aa  239  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00053297  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  41.89 
 
 		 389 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  35.68 
 
 		 474 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  44.07 
 
 		 404 aa  239  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  35.45 
 
 		 464 aa  239  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  36.17 
 
 		 451 aa  238  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  39.14 
 
 		 471 aa  238  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  35.68 
 
 		 474 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  43.06 
 
 		 403 aa  238  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  42.18 
 
 		 380 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>