More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0287 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0287  peptidase S1C, Do  100 
 
 		 465 aa  922    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1742  serine protease  59.38 
 
 		 461 aa  522  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0388  protease Do  59.38 
 
 		 461 aa  521  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2507  protease Do  59.47 
 
 		 461 aa  514  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0254484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  48.42 
 
 		 476 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  45.63 
 
 		 467 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  47.86 
 
 		 474 aa  374  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  47.86 
 
 		 474 aa  374  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2762  protease Do  43.5 
 
 		 485 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280827 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2485  serine protease  44.54 
 
 		 467 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1651  protease Do  45.33 
 
 		 492 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1364  protease Do  46.36 
 
 		 467 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  43.76 
 
 		 464 aa  362  8e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3156  peptidase S1C, Do  44.09 
 
 		 464 aa  362  9e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  0.845897 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  44.07 
 
 		 468 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  44.66 
 
 		 485 aa  355  6.999999999999999e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  43.17 
 
 		 463 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  43.23 
 
 		 467 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1014  protease Do  45 
 
 		 465 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370386  normal  0.451123 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  41.9 
 
 		 463 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  41.78 
 
 		 496 aa  345  1e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0724  putative protease do  41.59 
 
 		 464 aa  344  2e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300996  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2993  protease Do  41.45 
 
 		 476 aa  340  2e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.700896 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2179  protease Do  41.59 
 
 		 494 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4771  protease Do  43.79 
 
 		 496 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.411686  hitchhiker  0.000180606 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2497  protease Do  41.14 
 
 		 488 aa  334  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2221  protease Do  41.14 
 
 		 488 aa  334  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1718  protease Do  40.59 
 
 		 471 aa  332  9e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2041  protease Do  40.78 
 
 		 480 aa  328  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0470  protease Do  40.82 
 
 		 471 aa  326  7e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102018  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1518  protease Do  40.09 
 
 		 504 aa  323  6e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1649  protease Do  41.89 
 
 		 474 aa  302  9e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  42.32 
 
 		 491 aa  298  1e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  38.7 
 
 		 458 aa  263  4e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  36.6 
 
 		 483 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  36.38 
 
 		 483 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  38.49 
 
 		 483 aa  250  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  37.61 
 
 		 473 aa  249  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  37.16 
 
 		 513 aa  248  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  37.61 
 
 		 457 aa  249  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  36.89 
 
 		 465 aa  247  3e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  37.53 
 
 		 458 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  42.28 
 
 		 383 aa  246  6e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  36.45 
 
 		 461 aa  245  9.999999999999999e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  35.65 
 
 		 472 aa  243  5e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  36.58 
 
 		 450 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  39.24 
 
 		 500 aa  242  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.98 
 
 		 412 aa  242  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  35.88 
 
 		 450 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  35.88 
 
 		 450 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3800  protease Do  36.64 
 
 		 456 aa  241  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00053297  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  36.76 
 
 		 511 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  35.67 
 
 		 450 aa  240  4e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  36.31 
 
 		 450 aa  239  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  38.32 
 
 		 501 aa  238  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  34.77 
 
 		 451 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  33.76 
 
 		 455 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  34.04 
 
 		 456 aa  238  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  35.79 
 
 		 458 aa  237  4e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  35.78 
 
 		 506 aa  237  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  33.76 
 
 		 455 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  35.78 
 
 		 493 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  35.55 
 
 		 449 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  33.76 
 
 		 455 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  40.98 
 
 		 455 aa  236  6e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  42.77 
 
 		 455 aa  236  6e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  36.09 
 
 		 450 aa  236  6e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  37.31 
 
 		 481 aa  236  8e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0289  protease Do  34.89 
 
 		 456 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0319386  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  33.7 
 
 		 502 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3646  serine endoprotease  33.55 
 
 		 455 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  36.64 
 
 		 455 aa  235  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  35.88 
 
 		 450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  35.88 
 
 		 450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  41.83 
 
 		 456 aa  234  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  35.43 
 
 		 446 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3642  protease Do  36.34 
 
 		 456 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.393796  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  36.14 
 
 		 482 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  36.52 
 
 		 469 aa  233  7.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  34.86 
 
 		 503 aa  232  8.000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  37.26 
 
 		 501 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  44.58 
 
 		 383 aa  232  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  35.18 
 
 		 487 aa  232  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  35.19 
 
 		 502 aa  231  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  37.5 
 
 		 491 aa  231  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  38.08 
 
 		 460 aa  231  3e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4551  serine endoprotease  34.62 
 
 		 455 aa  231  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00837947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  35.59 
 
 		 493 aa  231  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  35.24 
 
 		 451 aa  231  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03094  serine endoprotease, periplasmic  34.62 
 
 		 455 aa  230  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0472  protease Do  34.62 
 
 		 455 aa  230  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00978488  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3542  serine endoprotease  34.62 
 
 		 455 aa  230  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03045  hypothetical protein  34.62 
 
 		 455 aa  230  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.471822  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  34.31 
 
 		 484 aa  230  4e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3423  serine endoprotease  34.62 
 
 		 455 aa  230  4e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  32.13 
 
 		 476 aa  230  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0472  serine endoprotease  34.62 
 
 		 455 aa  230  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0649674  normal  0.0819783 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3530  serine endoprotease  34.62 
 
 		 455 aa  230  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00269541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3717  serine endoprotease  34.62 
 
 		 455 aa  230  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000159943  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  35.08 
 
 		 449 aa  230  5e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>