More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1364 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1364  protease Do  100 
 
 		 467 aa  934    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1014  protease Do  67.89 
 
 		 465 aa  641    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370386  normal  0.451123 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  95.93 
 
 		 467 aa  902    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2485  serine protease  67.95 
 
 		 467 aa  623  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  57.76 
 
 		 476 aa  518  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  55.73 
 
 		 474 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  55.73 
 
 		 474 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1651  protease Do  55.76 
 
 		 492 aa  475  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  52.3 
 
 		 463 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3156  peptidase S1C, Do  51.43 
 
 		 464 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  0.845897 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  51.09 
 
 		 463 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  51.88 
 
 		 467 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  51.49 
 
 		 464 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  51.89 
 
 		 496 aa  445  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  51.83 
 
 		 468 aa  444  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0724  putative protease do  50 
 
 		 464 aa  439  9.999999999999999e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300996  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2993  protease Do  49.22 
 
 		 476 aa  419  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.700896 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4771  protease Do  50.65 
 
 		 496 aa  419  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.411686  hitchhiker  0.000180606 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2497  protease Do  47.69 
 
 		 488 aa  414  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2221  protease Do  47.69 
 
 		 488 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2179  protease Do  48.43 
 
 		 494 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2762  protease Do  49.89 
 
 		 485 aa  411  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280827 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1718  protease Do  48.75 
 
 		 471 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2041  protease Do  49.32 
 
 		 480 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0470  protease Do  48.07 
 
 		 471 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102018  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  45.97 
 
 		 485 aa  389  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1518  protease Do  45.19 
 
 		 504 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1742  serine protease  45.28 
 
 		 461 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0388  protease Do  45.28 
 
 		 461 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2507  protease Do  44.87 
 
 		 461 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0254484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1649  protease Do  46.86 
 
 		 474 aa  347  2e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  44.62 
 
 		 491 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0287  peptidase S1C, Do  45.63 
 
 		 465 aa  340  5e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  44.61 
 
 		 457 aa  297  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  49.85 
 
 		 398 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  44.72 
 
 		 458 aa  290  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  42.27 
 
 		 458 aa  288  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  38.95 
 
 		 472 aa  286  5e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.85 
 
 		 412 aa  286  5e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  36.94 
 
 		 472 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.77 
 
 		 398 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  36.82 
 
 		 472 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1242  protease DO  38.98 
 
 		 472 aa  283  5.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000225025  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  38.98 
 
 		 472 aa  283  7.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  41.27 
 
 		 450 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  41.05 
 
 		 450 aa  281  3e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  41.05 
 
 		 450 aa  281  3e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  40.17 
 
 		 450 aa  279  6e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  38.03 
 
 		 455 aa  279  7e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  40.04 
 
 		 450 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  38.35 
 
 		 484 aa  277  4e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  40.04 
 
 		 450 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  40.04 
 
 		 450 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  38.92 
 
 		 455 aa  276  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  48.35 
 
 		 404 aa  275  9e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  39.83 
 
 		 451 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  48.05 
 
 		 404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  40.51 
 
 		 457 aa  275  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  48.19 
 
 		 403 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  39.69 
 
 		 496 aa  273  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  41.2 
 
 		 476 aa  274  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  39.69 
 
 		 472 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.78 
 
 		 396 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  39.83 
 
 		 450 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  41.03 
 
 		 473 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  40.65 
 
 		 481 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  40.53 
 
 		 464 aa  272  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  37.84 
 
 		 456 aa  271  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  46.91 
 
 		 383 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  39.37 
 
 		 483 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  39.15 
 
 		 483 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3530  serine endoprotease  37.72 
 
 		 455 aa  270  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00269541  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03094  serine endoprotease, periplasmic  37.72 
 
 		 455 aa  269  8e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0472  protease Do  37.72 
 
 		 455 aa  269  8e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00978488  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03045  hypothetical protein  37.72 
 
 		 455 aa  269  8e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.471822  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0472  serine endoprotease  37.72 
 
 		 455 aa  269  8e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0649674  normal  0.0819783 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  40.54 
 
 		 465 aa  269  8e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  39.11 
 
 		 449 aa  269  8e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3717  serine endoprotease  37.72 
 
 		 455 aa  269  8e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000159943  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3423  serine endoprotease  37.72 
 
 		 455 aa  269  8e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3542  serine endoprotease  37.72 
 
 		 455 aa  269  8e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  38.07 
 
 		 474 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  38.07 
 
 		 474 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  38.07 
 
 		 474 aa  268  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  40.09 
 
 		 482 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  38.07 
 
 		 474 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  38.07 
 
 		 474 aa  268  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  38.07 
 
 		 474 aa  268  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  37.64 
 
 		 474 aa  268  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  47.55 
 
 		 401 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  38.07 
 
 		 474 aa  268  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.55 
 
 		 401 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  39.49 
 
 		 513 aa  267  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4551  serine endoprotease  37.5 
 
 		 455 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00837947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  40.14 
 
 		 456 aa  267  4e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  45.99 
 
 		 396 aa  266  4e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  39.81 
 
 		 474 aa  266  5.999999999999999e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  45.92 
 
 		 392 aa  266  5.999999999999999e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  38.86 
 
 		 453 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  37.64 
 
 		 455 aa  266  5.999999999999999e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>