More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0784 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 
379 aa  747    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  99.47 
 
 
379 aa  745    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  79.9 
 
 
383 aa  592  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  77.17 
 
 
385 aa  566  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1183  HtrA2 peptidase  77.11 
 
 
386 aa  559  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  72.77 
 
 
380 aa  550  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  71.65 
 
 
384 aa  514  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  70.59 
 
 
388 aa  511  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  64.42 
 
 
386 aa  477  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  61.42 
 
 
398 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  60.53 
 
 
398 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  57.92 
 
 
401 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  57.92 
 
 
401 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  57.66 
 
 
402 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  57.33 
 
 
403 aa  435  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  57.66 
 
 
402 aa  434  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  57.92 
 
 
401 aa  437  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  57.66 
 
 
402 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  57.66 
 
 
402 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  57.92 
 
 
402 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  58.03 
 
 
402 aa  437  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  57.92 
 
 
401 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  57.92 
 
 
401 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  57.92 
 
 
401 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  57.29 
 
 
407 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  56.88 
 
 
407 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  57.44 
 
 
404 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  56.99 
 
 
403 aa  428  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  57.44 
 
 
404 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  57.11 
 
 
383 aa  426  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  58.05 
 
 
383 aa  423  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  56.92 
 
 
392 aa  422  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  58.06 
 
 
388 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  58.06 
 
 
387 aa  421  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  57.53 
 
 
388 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  55.47 
 
 
390 aa  409  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  54.85 
 
 
398 aa  396  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  53.09 
 
 
396 aa  390  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.03 
 
 
396 aa  390  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1605  2-alkenal reductase  55.94 
 
 
385 aa  379  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436797 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.53 
 
 
412 aa  353  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.51 
 
 
385 aa  349  5e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  50 
 
 
386 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  49.87 
 
 
402 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  49.87 
 
 
386 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  51.91 
 
 
380 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  49.33 
 
 
386 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  54.91 
 
 
385 aa  340  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.5 
 
 
408 aa  338  9e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  51.48 
 
 
389 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  50.28 
 
 
389 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  48.66 
 
 
386 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  51.48 
 
 
386 aa  322  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.46 
 
 
417 aa  315  7e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12950  Htr-like protease  51.55 
 
 
383 aa  313  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2688  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.31 
 
 
391 aa  298  8e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  50.45 
 
 
372 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  46.86 
 
 
513 aa  296  3e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1505  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.72 
 
 
387 aa  294  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.98947  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  44.53 
 
 
443 aa  293  4e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  47.09 
 
 
465 aa  292  8e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.32 
 
 
442 aa  291  1e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  47.71 
 
 
442 aa  290  4e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2404  2-alkenal reductase  44.27 
 
 
350 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.993946  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  53.23 
 
 
460 aa  283  5.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  47.87 
 
 
474 aa  280  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  47.87 
 
 
474 aa  280  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  45.99 
 
 
496 aa  280  4e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  45.99 
 
 
468 aa  278  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  48.46 
 
 
471 aa  277  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  42.33 
 
 
472 aa  277  2e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  46.15 
 
 
467 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  47.06 
 
 
463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  45.59 
 
 
467 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  47.37 
 
 
463 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  47.95 
 
 
505 aa  272  6e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  48.41 
 
 
453 aa  272  6e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  47.89 
 
 
393 aa  271  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  43.77 
 
 
472 aa  271  1e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  45.99 
 
 
464 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  46.58 
 
 
450 aa  271  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  46.58 
 
 
450 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  46.58 
 
 
450 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  46.58 
 
 
450 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  47.95 
 
 
457 aa  270  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  47.4 
 
 
506 aa  270  4e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  46.32 
 
 
502 aa  269  5e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  44.86 
 
 
478 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  44.41 
 
 
476 aa  269  7e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  48.56 
 
 
485 aa  268  1e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  47.13 
 
 
451 aa  267  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  46.54 
 
 
450 aa  267  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  46.06 
 
 
476 aa  268  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  45.57 
 
 
476 aa  267  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  46.9 
 
 
487 aa  267  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  48.57 
 
 
451 aa  267  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  45.51 
 
 
504 aa  267  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  42.14 
 
 
479 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  45.94 
 
 
500 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  44.67 
 
 
479 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>