More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2688 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2688  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 391 aa  762    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1505  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  81.77 
 
 		 387 aa  567  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.98947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  50.13 
 
 		 396 aa  350  2e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  50.26 
 
 		 383 aa  350  3e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  51.38 
 
 		 403 aa  348  9e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  51.25 
 
 		 404 aa  346  3e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  50.75 
 
 		 404 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.21 
 
 		 396 aa  340  2e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  49.37 
 
 		 407 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  49.25 
 
 		 407 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  51.41 
 
 		 383 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  49.87 
 
 		 398 aa  335  5.999999999999999e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.99 
 
 		 401 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  48.99 
 
 		 401 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.99 
 
 		 401 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  47.1 
 
 		 403 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.49 
 
 		 398 aa  333  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.99 
 
 		 401 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  48.99 
 
 		 401 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.74 
 
 		 401 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.23 
 
 		 380 aa  332  8e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  48.74 
 
 		 402 aa  332  9e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  48.24 
 
 		 402 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  48.24 
 
 		 402 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  48.24 
 
 		 402 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.57 
 
 		 398 aa  330  2e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  48.24 
 
 		 402 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  48.24 
 
 		 402 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  53.37 
 
 		 388 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  48.96 
 
 		 386 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  53.37 
 
 		 387 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  53.07 
 
 		 388 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  45.71 
 
 		 392 aa  317  3e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.36 
 
 		 379 aa  316  6e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.73 
 
 		 390 aa  314  9.999999999999999e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.33 
 
 		 388 aa  311  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.95 
 
 		 384 aa  310  2.9999999999999997e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.74 
 
 		 385 aa  305  7e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  49.36 
 
 		 379 aa  305  7e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1605  2-alkenal reductase  55.07 
 
 		 385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436797 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1183  HtrA2 peptidase  47.52 
 
 		 386 aa  302  7.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  48.45 
 
 		 383 aa  300  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.75 
 
 		 408 aa  299  5e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.66 
 
 		 417 aa  296  4e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.81 
 
 		 412 aa  295  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  49.22 
 
 		 442 aa  290  3e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  48.5 
 
 		 380 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  47.49 
 
 		 443 aa  289  5.0000000000000004e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.6 
 
 		 385 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.9 
 
 		 442 aa  287  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  49.39 
 
 		 385 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  48.04 
 
 		 389 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  48.04 
 
 		 389 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12950  Htr-like protease  51.79 
 
 		 383 aa  281  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  47.66 
 
 		 386 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  44.47 
 
 		 386 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  46.83 
 
 		 386 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  46.83 
 
 		 402 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  49.19 
 
 		 386 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  49.84 
 
 		 386 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  47.31 
 
 		 372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  54.81 
 
 		 513 aa  270  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  42.71 
 
 		 511 aa  266  4e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  41.43 
 
 		 472 aa  266  5.999999999999999e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0806  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  43.26 
 
 		 468 aa  263  4.999999999999999e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00374438  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1064  protease DO  42.63 
 
 		 467 aa  262  8.999999999999999e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0185007  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  40.45 
 
 		 502 aa  261  2e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  41.61 
 
 		 471 aa  260  4e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  41.21 
 
 		 506 aa  259  7e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  40.89 
 
 		 502 aa  258  9e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  39.7 
 
 		 504 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0764  peptidase S1C, Do  41.18 
 
 		 471 aa  255  1.0000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000251476  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  40.33 
 
 		 505 aa  253  3e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  39 
 
 		 498 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  46.32 
 
 		 461 aa  251  2e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  43.3 
 
 		 472 aa  248  1e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2404  2-alkenal reductase  41.12 
 
 		 350 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.993946  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1242  protease DO  44.19 
 
 		 472 aa  248  1e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000225025  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  44.19 
 
 		 472 aa  248  2e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2179  protease Do  41 
 
 		 494 aa  248  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2221  protease Do  42.9 
 
 		 488 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2497  protease Do  42.9 
 
 		 488 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  41.59 
 
 		 453 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  44.91 
 
 		 511 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  41.1 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  44.81 
 
 		 471 aa  244  3e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  45.54 
 
 		 393 aa  243  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3167  DEAD/DEAH box helicase-like  47.4 
 
 		 384 aa  243  6e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  40.4 
 
 		 499 aa  241  1e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0470  protease Do  44.78 
 
 		 471 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102018  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  48.18 
 
 		 449 aa  241  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1718  protease Do  44.35 
 
 		 471 aa  239  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759509  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  43.87 
 
 		 465 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  41.3 
 
 		 467 aa  239  9e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  47.96 
 
 		 450 aa  238  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  44.3 
 
 		 450 aa  238  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1518  protease Do  41.48 
 
 		 504 aa  238  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  50.74 
 
 		 491 aa  237  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  42.52 
 
 		 481 aa  236  4e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  44.71 
 
 		 485 aa  235  8e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>