More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1605 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1605  2-alkenal reductase  100 
 
 		 385 aa  754    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436797 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  62.04 
 
 		 386 aa  421  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  58.01 
 
 		 380 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  54.06 
 
 		 388 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  55.67 
 
 		 379 aa  398  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  53.06 
 
 		 401 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  53.06 
 
 		 401 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  53.55 
 
 		 388 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  55.56 
 
 		 398 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  53.96 
 
 		 402 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.06 
 
 		 401 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  53.55 
 
 		 387 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  53.96 
 
 		 402 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  54.22 
 
 		 402 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.06 
 
 		 401 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  54.22 
 
 		 402 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  53.96 
 
 		 402 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.06 
 
 		 401 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.06 
 
 		 401 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  52.81 
 
 		 403 aa  388  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  53.42 
 
 		 407 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  53.28 
 
 		 407 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  54.95 
 
 		 398 aa  391  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  53.61 
 
 		 402 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  53.38 
 
 		 404 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  53.13 
 
 		 404 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  55.09 
 
 		 384 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  58.1 
 
 		 385 aa  383  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  53.28 
 
 		 403 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  55.15 
 
 		 379 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  54.81 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  56.35 
 
 		 383 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  56.28 
 
 		 383 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  51.94 
 
 		 383 aa  371  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1183  HtrA2 peptidase  55.35 
 
 		 386 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  57.8 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.52 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  49.36 
 
 		 392 aa  359  5e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.17 
 
 		 398 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.37 
 
 		 390 aa  348  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  51.3 
 
 		 386 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  51.01 
 
 		 402 aa  339  4e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  54.66 
 
 		 389 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  50.72 
 
 		 386 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.45 
 
 		 385 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  49.86 
 
 		 380 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  54.04 
 
 		 389 aa  335  7e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  52.25 
 
 		 386 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  50.83 
 
 		 385 aa  329  4e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  51.65 
 
 		 386 aa  322  6e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  51.35 
 
 		 386 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.55 
 
 		 412 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12950  Htr-like protease  52.33 
 
 		 383 aa  309  5e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.3 
 
 		 417 aa  306  3e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2688  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  55.07 
 
 		 391 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.4 
 
 		 408 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  48.96 
 
 		 513 aa  301  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  47.04 
 
 		 442 aa  293  2e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  48.93 
 
 		 443 aa  292  6e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.77 
 
 		 442 aa  292  7e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  50.15 
 
 		 372 aa  291  2e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1505  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.02 
 
 		 387 aa  288  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.98947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  42.49 
 
 		 472 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  46.2 
 
 		 465 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2404  2-alkenal reductase  43.48 
 
 		 350 aa  273  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.993946  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  50.15 
 
 		 460 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  46.92 
 
 		 461 aa  269  5e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  46.01 
 
 		 502 aa  269  5e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1518  protease Do  47.32 
 
 		 504 aa  266  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  44.41 
 
 		 479 aa  266  4e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2221  protease Do  46.76 
 
 		 488 aa  266  4e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  50.67 
 
 		 471 aa  266  5e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2497  protease Do  46.76 
 
 		 488 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  46.5 
 
 		 474 aa  264  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  44.85 
 
 		 450 aa  264  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1718  protease Do  45.67 
 
 		 471 aa  264  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  46.5 
 
 		 474 aa  264  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  43.79 
 
 		 472 aa  262  8e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2179  protease Do  43.86 
 
 		 494 aa  261  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  44.79 
 
 		 393 aa  261  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  45.4 
 
 		 450 aa  261  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  45.1 
 
 		 449 aa  260  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0470  protease Do  45.72 
 
 		 471 aa  260  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102018  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  46.28 
 
 		 457 aa  260  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  43.57 
 
 		 449 aa  259  4e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  44.61 
 
 		 502 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  43.92 
 
 		 450 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  44.51 
 
 		 451 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  45.89 
 
 		 506 aa  259  7e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  43.62 
 
 		 453 aa  258  8e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  42.04 
 
 		 498 aa  258  1e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  43.27 
 
 		 450 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  43.86 
 
 		 450 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  45.71 
 
 		 511 aa  257  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  45.32 
 
 		 471 aa  257  3e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  43.94 
 
 		 458 aa  257  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0806  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  47.86 
 
 		 468 aa  257  3e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00374438  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  43.86 
 
 		 450 aa  257  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  43.86 
 
 		 450 aa  257  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  42.99 
 
 		 504 aa  257  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>