More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2110 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 
417 aa  824    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  59.7 
 
 
408 aa  424  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  60.23 
 
 
385 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.63 
 
 
412 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  56.62 
 
 
403 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  54.2 
 
 
407 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  56.44 
 
 
404 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  56.13 
 
 
404 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.66 
 
 
385 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  51.26 
 
 
402 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.8 
 
 
396 aa  352  5e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  54.91 
 
 
407 aa  352  7e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  55.26 
 
 
398 aa  350  4e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  49.37 
 
 
396 aa  349  5e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  47.62 
 
 
392 aa  349  5e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  56.13 
 
 
398 aa  349  5e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  55.66 
 
 
380 aa  348  7e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  50 
 
 
386 aa  348  7e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.01 
 
 
401 aa  348  8e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  51.01 
 
 
401 aa  348  8e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  54.6 
 
 
403 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.75 
 
 
401 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  49.34 
 
 
386 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  55.21 
 
 
389 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  49.34 
 
 
402 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  50.75 
 
 
401 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  49.6 
 
 
386 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.75 
 
 
401 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.75 
 
 
401 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  54.91 
 
 
389 aa  344  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  55.66 
 
 
387 aa  345  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  55.35 
 
 
388 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  55.35 
 
 
402 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  55.35 
 
 
402 aa  342  7e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  55.35 
 
 
402 aa  342  7e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  55.35 
 
 
402 aa  342  7e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  55.35 
 
 
402 aa  342  9e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.57 
 
 
390 aa  341  2e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  52.13 
 
 
386 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  55.05 
 
 
388 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  52.55 
 
 
383 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  50.9 
 
 
383 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.18 
 
 
398 aa  338  8e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  51.33 
 
 
386 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12950  Htr-like protease  55.22 
 
 
383 aa  330  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.33 
 
 
380 aa  323  4e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  54.88 
 
 
383 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.46 
 
 
379 aa  315  8e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  52.91 
 
 
372 aa  315  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  48.8 
 
 
471 aa  312  6.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  48.37 
 
 
513 aa  306  5.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.3 
 
 
388 aa  306  5.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1183  HtrA2 peptidase  50 
 
 
386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  51.12 
 
 
386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.52 
 
 
384 aa  301  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  51.5 
 
 
379 aa  301  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.27 
 
 
385 aa  299  5e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.77 
 
 
442 aa  298  1e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1605  2-alkenal reductase  50.3 
 
 
385 aa  297  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436797 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  48.47 
 
 
442 aa  297  3e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  49.25 
 
 
443 aa  297  3e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2404  2-alkenal reductase  45.78 
 
 
350 aa  296  6e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.993946  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  41.67 
 
 
472 aa  291  1e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2688  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.89 
 
 
391 aa  290  4e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  49.68 
 
 
457 aa  285  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  48.65 
 
 
474 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  48.65 
 
 
474 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  48.53 
 
 
465 aa  281  1e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1064  protease DO  44.38 
 
 
467 aa  281  1e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0185007  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  39.71 
 
 
461 aa  280  2e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1505  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.22 
 
 
387 aa  280  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.98947  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  50.81 
 
 
468 aa  280  3e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  48.8 
 
 
464 aa  280  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0764  peptidase S1C, Do  44.02 
 
 
471 aa  280  4e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000251476  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  46.59 
 
 
476 aa  278  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  47.11 
 
 
496 aa  277  3e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  44.21 
 
 
472 aa  276  4e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  45.54 
 
 
476 aa  275  8e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0806  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  43.82 
 
 
468 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00374438  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  48.78 
 
 
460 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  43.38 
 
 
472 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  45.75 
 
 
449 aa  273  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1242  protease DO  43.62 
 
 
472 aa  272  9e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000225025  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  43.62 
 
 
472 aa  271  1e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  43.11 
 
 
502 aa  272  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  51.01 
 
 
463 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  47.11 
 
 
463 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  46.26 
 
 
393 aa  271  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  50.17 
 
 
467 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  44.71 
 
 
449 aa  271  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  47.44 
 
 
473 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  44.25 
 
 
464 aa  270  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2762  protease Do  46.53 
 
 
485 aa  268  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.280827 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  48.15 
 
 
458 aa  266  5e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  43.5 
 
 
382 aa  266  5e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  45.43 
 
 
453 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  45.03 
 
 
450 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  45.03 
 
 
450 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  45.03 
 
 
450 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0267  protease Do  47.26 
 
 
477 aa  265  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.326354  normal  0.464292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>