More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0817 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 
384 aa  759    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  84.14 
 
 
388 aa  624  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  72.85 
 
 
380 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  71.65 
 
 
379 aa  525  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  71.91 
 
 
379 aa  514  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  71.58 
 
 
383 aa  508  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1183  HtrA2 peptidase  72.25 
 
 
386 aa  504  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  71.06 
 
 
385 aa  506  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  61.7 
 
 
386 aa  444  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  58.66 
 
 
398 aa  438  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  56.49 
 
 
407 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  56.96 
 
 
402 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  56.71 
 
 
402 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  56.52 
 
 
404 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  56.71 
 
 
402 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  57.69 
 
 
403 aa  427  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  58.44 
 
 
398 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  56.96 
 
 
402 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  57.11 
 
 
401 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  56.09 
 
 
407 aa  425  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  56.71 
 
 
402 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  57.11 
 
 
401 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  57.11 
 
 
401 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  56.2 
 
 
402 aa  421  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  56.85 
 
 
401 aa  423  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  56.27 
 
 
404 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  54.68 
 
 
403 aa  418  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  55.08 
 
 
392 aa  419  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  56.6 
 
 
401 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  56.6 
 
 
401 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  56.81 
 
 
388 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  56.54 
 
 
387 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  56.28 
 
 
388 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  54.12 
 
 
383 aa  399  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  54.36 
 
 
390 aa  395  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  56.3 
 
 
383 aa  397  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.01 
 
 
396 aa  387  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  52.7 
 
 
396 aa  381  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  54.06 
 
 
398 aa  377  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1605  2-alkenal reductase  53.79 
 
 
385 aa  374  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.06 
 
 
385 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  51.68 
 
 
380 aa  333  3e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  49.47 
 
 
386 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  51.12 
 
 
386 aa  332  5e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  49.2 
 
 
402 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  48.94 
 
 
386 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  52.07 
 
 
385 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  50.13 
 
 
386 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.44 
 
 
412 aa  325  1e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  50.72 
 
 
389 aa  323  4e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  49.72 
 
 
389 aa  323  5e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  50.27 
 
 
386 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12950  Htr-like protease  48.6 
 
 
383 aa  317  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.82 
 
 
408 aa  317  3e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.62 
 
 
417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2688  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.57 
 
 
391 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1505  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.06 
 
 
387 aa  296  3e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.98947  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  49.38 
 
 
372 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.5 
 
 
442 aa  291  1e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  47.58 
 
 
443 aa  289  5.0000000000000004e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  51.19 
 
 
513 aa  289  6e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  46.48 
 
 
442 aa  288  9e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  43.59 
 
 
472 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2404  2-alkenal reductase  44.55 
 
 
350 aa  273  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.993946  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  46.08 
 
 
465 aa  271  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  51.32 
 
 
460 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  45.4 
 
 
458 aa  268  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  49.04 
 
 
451 aa  268  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  46.73 
 
 
502 aa  267  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  49.66 
 
 
491 aa  267  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  44.89 
 
 
476 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  46.95 
 
 
471 aa  266  5e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  45.62 
 
 
502 aa  265  7e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  42.05 
 
 
467 aa  265  7e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  50.72 
 
 
511 aa  265  8.999999999999999e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  46.71 
 
 
506 aa  265  1e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1364  protease Do  46.88 
 
 
467 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  44.55 
 
 
457 aa  265  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  46.29 
 
 
467 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  47.62 
 
 
453 aa  263  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  47.27 
 
 
464 aa  263  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  47.94 
 
 
474 aa  263  4.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  47.94 
 
 
474 aa  263  4.999999999999999e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  45.86 
 
 
474 aa  262  6e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  43.66 
 
 
469 aa  262  6.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  46.43 
 
 
478 aa  262  8e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  46.03 
 
 
449 aa  262  8e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3669  serine endoprotease  45.54 
 
 
455 aa  262  8e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0364754  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  47.34 
 
 
497 aa  261  1e-68  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  46.18 
 
 
479 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  46.95 
 
 
476 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  46.67 
 
 
450 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  46.67 
 
 
450 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  46.67 
 
 
450 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  44.96 
 
 
500 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  46.77 
 
 
463 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  45.17 
 
 
505 aa  261  2e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  42.65 
 
 
479 aa  261  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  45.17 
 
 
504 aa  260  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  45.88 
 
 
477 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>