More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2338 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2338  protease Do  100 
 
 
471 aa  926    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  45.59 
 
 
513 aa  334  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  40.58 
 
 
472 aa  318  1e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.8 
 
 
417 aa  312  7.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  41.82 
 
 
472 aa  309  8e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  51.98 
 
 
403 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  49.45 
 
 
404 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  52.42 
 
 
404 aa  306  6e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  51.47 
 
 
398 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  48.56 
 
 
402 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.2 
 
 
398 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  50.32 
 
 
386 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.97 
 
 
385 aa  302  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.08 
 
 
412 aa  301  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  42.99 
 
 
455 aa  301  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  41.86 
 
 
472 aa  301  2e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  48.98 
 
 
401 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.98 
 
 
401 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  50 
 
 
386 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  39.62 
 
 
472 aa  299  6e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  50.46 
 
 
380 aa  298  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  49.37 
 
 
386 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  48.69 
 
 
401 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.69 
 
 
401 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.69 
 
 
401 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  49.37 
 
 
402 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1242  protease DO  39.41 
 
 
472 aa  298  2e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000225025  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.4 
 
 
401 aa  297  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.81 
 
 
408 aa  297  3e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  39.67 
 
 
465 aa  296  5e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  51.23 
 
 
386 aa  296  6e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  50.92 
 
 
386 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  45.58 
 
 
383 aa  293  4e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  45.14 
 
 
403 aa  293  6e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.63 
 
 
390 aa  292  1e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  41.08 
 
 
455 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  48.37 
 
 
388 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  48.37 
 
 
387 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  48.2 
 
 
407 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3646  serine endoprotease  41.08 
 
 
455 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  48.37 
 
 
402 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  48.66 
 
 
407 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3669  serine endoprotease  42.14 
 
 
455 aa  290  5.0000000000000004e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0364754  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  41.82 
 
 
455 aa  289  7e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  40.86 
 
 
455 aa  289  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  40.86 
 
 
455 aa  289  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  43.39 
 
 
450 aa  289  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  48.07 
 
 
402 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  48.07 
 
 
402 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  46.84 
 
 
511 aa  288  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  43.32 
 
 
463 aa  288  1e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  48.07 
 
 
402 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  40.63 
 
 
451 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  43.32 
 
 
457 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  43.32 
 
 
457 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  48.07 
 
 
402 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  45.95 
 
 
460 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  47.75 
 
 
392 aa  286  5e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  47.77 
 
 
388 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  49.37 
 
 
389 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  41.61 
 
 
483 aa  286  7e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  41.61 
 
 
483 aa  286  7e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  43.89 
 
 
483 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  49.05 
 
 
389 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  40.13 
 
 
456 aa  284  3.0000000000000004e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  43.36 
 
 
449 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  41.83 
 
 
456 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  38.57 
 
 
461 aa  283  5.000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  42.18 
 
 
453 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.67 
 
 
396 aa  282  9e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  44.26 
 
 
473 aa  282  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  48.9 
 
 
385 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  41.5 
 
 
456 aa  281  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  42.62 
 
 
449 aa  281  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12950  Htr-like protease  47.38 
 
 
383 aa  280  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  42.18 
 
 
511 aa  280  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  40.77 
 
 
485 aa  280  5e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  42 
 
 
451 aa  279  6e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  43.41 
 
 
396 aa  279  7e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  38.68 
 
 
467 aa  279  9e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  39.63 
 
 
511 aa  278  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  41.08 
 
 
471 aa  279  1e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0806  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  41.84 
 
 
468 aa  278  1e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00374438  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  42.36 
 
 
451 aa  278  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03094  serine endoprotease, periplasmic  42.14 
 
 
455 aa  277  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0472  protease Do  42.14 
 
 
455 aa  277  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00978488  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.15 
 
 
385 aa  278  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0472  serine endoprotease  42.14 
 
 
455 aa  277  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0649674  normal  0.0819783 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4551  serine endoprotease  42.14 
 
 
455 aa  278  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00837947  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3530  serine endoprotease  42.14 
 
 
455 aa  278  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00269541  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3542  serine endoprotease  42.14 
 
 
455 aa  277  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03045  hypothetical protein  42.14 
 
 
455 aa  277  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.471822  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.46 
 
 
379 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3423  serine endoprotease  42.14 
 
 
455 aa  277  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  42.16 
 
 
446 aa  278  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3717  serine endoprotease  42.14 
 
 
455 aa  277  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000159943  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.84 
 
 
388 aa  278  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  40.44 
 
 
464 aa  276  4e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  40.65 
 
 
459 aa  276  5e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0764  peptidase S1C, Do  37.95 
 
 
471 aa  276  6e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000251476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>