More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0806 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0806  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  100 
 
 
468 aa  928    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00374438  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1064  protease DO  80.77 
 
 
467 aa  743    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0185007  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0764  peptidase S1C, Do  64.41 
 
 
471 aa  576  1.0000000000000001e-163  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000251476  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  59.96 
 
 
471 aa  541  9.999999999999999e-153  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  59.24 
 
 
472 aa  512  1e-144  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  56.96 
 
 
472 aa  512  1e-144  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1242  protease DO  59.03 
 
 
472 aa  510  1e-143  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000225025  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  58.19 
 
 
472 aa  510  1e-143  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  54.55 
 
 
472 aa  487  1e-136  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  46.24 
 
 
461 aa  373  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  42.76 
 
 
513 aa  332  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  40.79 
 
 
460 aa  299  8e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  41.65 
 
 
465 aa  298  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  41.11 
 
 
471 aa  296  4e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  43.01 
 
 
442 aa  295  1e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  48.34 
 
 
404 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  47.58 
 
 
403 aa  294  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  49.04 
 
 
398 aa  293  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  48.34 
 
 
404 aa  292  8e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  46.27 
 
 
383 aa  291  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  42.02 
 
 
511 aa  290  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.52 
 
 
398 aa  290  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  45.43 
 
 
396 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  38.83 
 
 
479 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.45 
 
 
442 aa  289  7e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  40.32 
 
 
476 aa  289  8e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  45.74 
 
 
385 aa  289  9e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  40.37 
 
 
476 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.33 
 
 
390 aa  288  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  39.91 
 
 
476 aa  288  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.82 
 
 
417 aa  287  2.9999999999999996e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  43.58 
 
 
386 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  44.06 
 
 
386 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.9 
 
 
385 aa  286  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  45.71 
 
 
380 aa  286  7e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.42 
 
 
396 aa  286  7e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  38.32 
 
 
476 aa  285  9e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  38.12 
 
 
476 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  41.64 
 
 
402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  43.48 
 
 
386 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  45.58 
 
 
392 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  43.67 
 
 
383 aa  283  6.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  45.65 
 
 
386 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.27 
 
 
412 aa  282  8.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  42.62 
 
 
459 aa  282  9e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  46.52 
 
 
386 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  46.84 
 
 
386 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  37.92 
 
 
476 aa  280  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  38.6 
 
 
474 aa  280  3e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  40 
 
 
502 aa  280  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  40.85 
 
 
463 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.87 
 
 
398 aa  279  7e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  46.82 
 
 
387 aa  279  7e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  40.1 
 
 
497 aa  279  9e-74  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  46.82 
 
 
402 aa  278  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  37.45 
 
 
471 aa  278  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  47.13 
 
 
401 aa  277  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.13 
 
 
401 aa  277  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  39.79 
 
 
443 aa  277  4e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.82 
 
 
401 aa  276  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  39.77 
 
 
474 aa  276  8e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  39.77 
 
 
474 aa  276  8e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.45 
 
 
408 aa  276  8e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  46.82 
 
 
401 aa  275  9e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.82 
 
 
401 aa  275  9e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  46.5 
 
 
402 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.82 
 
 
401 aa  275  9e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  46.5 
 
 
388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  48.28 
 
 
393 aa  275  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  38.32 
 
 
457 aa  275  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  41.01 
 
 
464 aa  274  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.62 
 
 
379 aa  273  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  46.18 
 
 
402 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  46.18 
 
 
402 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  46.18 
 
 
402 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  42.66 
 
 
469 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  37.22 
 
 
473 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  36.03 
 
 
463 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  46.18 
 
 
402 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  40.14 
 
 
458 aa  273  7e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  38.58 
 
 
504 aa  271  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  39.26 
 
 
506 aa  271  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  38.37 
 
 
458 aa  270  4e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  45.86 
 
 
388 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  44.24 
 
 
403 aa  270  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  40.09 
 
 
502 aa  270  5e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  38.72 
 
 
498 aa  270  5e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  42.77 
 
 
389 aa  270  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  38.26 
 
 
505 aa  269  7e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  38.92 
 
 
468 aa  269  7e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  36.72 
 
 
496 aa  268  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  43.41 
 
 
407 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  43.11 
 
 
407 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3156  peptidase S1C, Do  36.84 
 
 
464 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  0.845897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  42.45 
 
 
389 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  49.64 
 
 
379 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  38.32 
 
 
472 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  39.6 
 
 
467 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  41.85 
 
 
383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1605  2-alkenal reductase  46.96 
 
 
385 aa  267  4e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>