More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0412 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  86.57 
 
 
402 aa  713    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  86.32 
 
 
402 aa  714    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  86.57 
 
 
402 aa  715    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  86.67 
 
 
401 aa  711    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  85.31 
 
 
388 aa  679    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  86.67 
 
 
401 aa  710    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  85.82 
 
 
388 aa  683    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  86.67 
 
 
401 aa  710    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  92.65 
 
 
403 aa  747    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  87.88 
 
 
402 aa  705    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  86.32 
 
 
402 aa  714    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  86.3 
 
 
387 aa  680    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  98.98 
 
 
407 aa  776    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  86.32 
 
 
402 aa  714    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  100 
 
 
407 aa  813    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  86.67 
 
 
401 aa  710    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  86.67 
 
 
401 aa  711    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  86.67 
 
 
401 aa  710    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  71.22 
 
 
403 aa  570  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  72.21 
 
 
398 aa  567  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  72.15 
 
 
404 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  72.04 
 
 
404 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  71.24 
 
 
398 aa  560  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  58.9 
 
 
396 aa  461  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  58.99 
 
 
392 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  58.61 
 
 
383 aa  449  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  58.25 
 
 
383 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  58.48 
 
 
390 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  59.55 
 
 
398 aa  443  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  58.06 
 
 
396 aa  444  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  59.07 
 
 
380 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  56.88 
 
 
379 aa  431  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  57.32 
 
 
386 aa  427  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1183  HtrA2 peptidase  59.03 
 
 
386 aa  428  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  58.31 
 
 
385 aa  418  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  56.09 
 
 
384 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  56.96 
 
 
388 aa  414  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  56.88 
 
 
379 aa  414  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  56.93 
 
 
383 aa  411  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  54.72 
 
 
380 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.87 
 
 
385 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  57.89 
 
 
389 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  51.55 
 
 
386 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  51.55 
 
 
402 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  57.59 
 
 
389 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  51.55 
 
 
386 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1605  2-alkenal reductase  52.99 
 
 
385 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  56.19 
 
 
386 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  56.62 
 
 
412 aa  366  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  53.01 
 
 
385 aa  362  6e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  53.25 
 
 
386 aa  362  8e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  52.12 
 
 
386 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12950  Htr-like protease  53.17 
 
 
383 aa  358  7e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.88 
 
 
408 aa  355  5.999999999999999e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  54.91 
 
 
417 aa  351  1e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  52.29 
 
 
372 aa  325  9e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2688  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  55.45 
 
 
391 aa  319  5e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1505  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.78 
 
 
387 aa  318  9e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.98947  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  47.2 
 
 
443 aa  311  1e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  48.38 
 
 
513 aa  310  2.9999999999999997e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  48.6 
 
 
465 aa  307  3e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  43.64 
 
 
442 aa  305  8.000000000000001e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.15 
 
 
442 aa  304  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  48.72 
 
 
463 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  46.79 
 
 
478 aa  290  3e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  48.2 
 
 
471 aa  290  4e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  50.15 
 
 
463 aa  289  6e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  45.71 
 
 
457 aa  288  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  48.52 
 
 
464 aa  288  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  48.93 
 
 
468 aa  287  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  48.62 
 
 
496 aa  286  4e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  48.46 
 
 
450 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3156  peptidase S1C, Do  48.14 
 
 
464 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  0.845897 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  47.58 
 
 
450 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  45.72 
 
 
479 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  47.84 
 
 
450 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  47.84 
 
 
450 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  47.84 
 
 
450 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  44.84 
 
 
473 aa  282  7.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  48.46 
 
 
451 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2404  2-alkenal reductase  44.95 
 
 
350 aa  282  8.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.993946  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  48.18 
 
 
450 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  46.65 
 
 
458 aa  281  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  43.94 
 
 
505 aa  280  2e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  48.21 
 
 
467 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  45.22 
 
 
474 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  47.53 
 
 
450 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  47.22 
 
 
453 aa  280  3e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  47.72 
 
 
449 aa  280  3e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  48.46 
 
 
460 aa  280  4e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  41.64 
 
 
469 aa  280  4e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  47.17 
 
 
506 aa  280  4e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  47.53 
 
 
450 aa  280  4e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  44.54 
 
 
477 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  47.53 
 
 
450 aa  280  4e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  47.53 
 
 
450 aa  280  4e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  44.84 
 
 
492 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  47.53 
 
 
450 aa  280  5e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  46.25 
 
 
484 aa  279  5e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  44.99 
 
 
474 aa  279  7e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>