More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1270 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  100 
 
 		 442 aa  896    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  96.38 
 
 		 442 aa  815    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  64.93 
 
 		 443 aa  565  1e-160  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.14 
 
 		 385 aa  318  9e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.55 
 
 		 412 aa  317  2e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  44.16 
 
 		 407 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.46 
 
 		 396 aa  311  2e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  51.11 
 
 		 389 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  44.78 
 
 		 386 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  43.9 
 
 		 402 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  45.74 
 
 		 386 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  50.79 
 
 		 389 aa  309  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  45.48 
 
 		 402 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  48.92 
 
 		 388 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  43.9 
 
 		 402 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.85 
 
 		 398 aa  308  9e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  43.64 
 
 		 402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  43.64 
 
 		 402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  43.78 
 
 		 407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  43.64 
 
 		 402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  49.24 
 
 		 385 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  45.21 
 
 		 386 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  48.77 
 
 		 401 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.77 
 
 		 401 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  49.22 
 
 		 398 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  48.92 
 
 		 387 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  48.46 
 
 		 402 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  42.89 
 
 		 403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  48.46 
 
 		 401 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.46 
 
 		 401 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.46 
 
 		 401 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  48.31 
 
 		 388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.46 
 
 		 401 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  49.23 
 
 		 380 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  45.14 
 
 		 383 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  47.9 
 
 		 403 aa  302  7.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.73 
 
 		 398 aa  301  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.62 
 
 		 417 aa  299  5e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12950  Htr-like protease  47.03 
 
 		 383 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  47.58 
 
 		 472 aa  298  1e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  45.85 
 
 		 404 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  46.63 
 
 		 386 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  45.85 
 
 		 404 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  46.13 
 
 		 396 aa  297  3e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  46.63 
 
 		 386 aa  296  7e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.59 
 
 		 380 aa  295  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  43.31 
 
 		 383 aa  293  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  47.54 
 
 		 392 aa  293  4e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.59 
 
 		 379 aa  292  8e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.22 
 
 		 388 aa  290  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  45.93 
 
 		 372 aa  288  9e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.37 
 
 		 408 aa  288  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.5 
 
 		 390 aa  288  1e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  47.42 
 
 		 386 aa  286  4e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  44.25 
 
 		 511 aa  286  5e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.95 
 
 		 385 aa  286  7e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1605  2-alkenal reductase  51 
 
 		 385 aa  285  8e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436797 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1183  HtrA2 peptidase  48.87 
 
 		 386 aa  285  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  46.83 
 
 		 379 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2688  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.68 
 
 		 391 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0806  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  43.01 
 
 		 468 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00374438  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.18 
 
 		 384 aa  283  6.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1064  protease DO  42.74 
 
 		 467 aa  280  3e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0185007  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  47.93 
 
 		 513 aa  280  4e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  45.57 
 
 		 461 aa  277  2e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1505  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.69 
 
 		 387 aa  277  3e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.98947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  48.12 
 
 		 393 aa  276  7e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  44.44 
 
 		 471 aa  274  3e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3167  DEAD/DEAH box helicase-like  43.72 
 
 		 384 aa  272  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  46.69 
 
 		 464 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  47.25 
 
 		 383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  47.63 
 
 		 491 aa  269  8e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2404  2-alkenal reductase  46.5 
 
 		 350 aa  268  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.993946  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  44.89 
 
 		 465 aa  268  2e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0764  peptidase S1C, Do  42.54 
 
 		 471 aa  267  2e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000251476  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  40.55 
 
 		 472 aa  266  4e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  39.37 
 
 		 504 aa  266  5.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1242  protease DO  41.1 
 
 		 472 aa  265  1e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000225025  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  41.62 
 
 		 502 aa  265  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  41.1 
 
 		 472 aa  264  2e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  41.1 
 
 		 472 aa  264  2e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  44.87 
 
 		 505 aa  264  3e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  42.36 
 
 		 476 aa  262  8e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  44.84 
 
 		 457 aa  259  6e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  44.48 
 
 		 496 aa  258  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  40.97 
 
 		 474 aa  257  3e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  40.97 
 
 		 474 aa  257  3e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1518  protease Do  45.56 
 
 		 504 aa  256  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  44.07 
 
 		 468 aa  256  6e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  41.6 
 
 		 471 aa  256  7e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  39.75 
 
 		 506 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  44.8 
 
 		 463 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  43.52 
 
 		 463 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  39.63 
 
 		 467 aa  252  9.000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  44.62 
 
 		 502 aa  252  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  44.61 
 
 		 460 aa  250  3e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2762  protease Do  40.1 
 
 		 485 aa  250  4e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280827 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  43.27 
 
 		 467 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  43.2 
 
 		 458 aa  249  7e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  43.47 
 
 		 477 aa  248  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>