More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2745 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  88.56 
 
 
402 aa  719    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  87.5 
 
 
401 aa  711    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  87.63 
 
 
388 aa  684    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  87.5 
 
 
401 aa  709    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  94.43 
 
 
407 aa  743    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  87.5 
 
 
401 aa  711    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  87.5 
 
 
402 aa  713    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  88.14 
 
 
388 aa  689    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  87.5 
 
 
401 aa  709    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  88.56 
 
 
402 aa  719    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  88.56 
 
 
402 aa  718    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  100 
 
 
403 aa  807    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  87.63 
 
 
387 aa  682    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  94.18 
 
 
407 aa  745    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  88.81 
 
 
402 aa  720    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  88.56 
 
 
402 aa  719    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  87.5 
 
 
401 aa  709    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  87.5 
 
 
401 aa  709    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  71.96 
 
 
403 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  72.59 
 
 
404 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  72.48 
 
 
404 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  72.28 
 
 
398 aa  568  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  71.32 
 
 
398 aa  560  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  58.21 
 
 
396 aa  461  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  58.59 
 
 
392 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  58.51 
 
 
383 aa  449  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  58.99 
 
 
390 aa  449  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  57.54 
 
 
396 aa  449  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  57.69 
 
 
383 aa  441  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  57.79 
 
 
398 aa  437  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  58.03 
 
 
380 aa  434  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  56.99 
 
 
379 aa  428  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  57.25 
 
 
386 aa  422  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1183  HtrA2 peptidase  57.91 
 
 
386 aa  415  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  57.14 
 
 
385 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  56.99 
 
 
379 aa  411  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  54.68 
 
 
384 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  56.2 
 
 
388 aa  410  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  56.71 
 
 
383 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  55.01 
 
 
385 aa  391  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  55.12 
 
 
380 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  49.63 
 
 
402 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  55.86 
 
 
386 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  50 
 
 
386 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  56.66 
 
 
389 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1605  2-alkenal reductase  53.47 
 
 
385 aa  373  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436797 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  56.35 
 
 
389 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  56.66 
 
 
386 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  56.38 
 
 
412 aa  368  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  53.63 
 
 
386 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  58.33 
 
 
386 aa  359  4e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  52.42 
 
 
385 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  54.76 
 
 
408 aa  355  1e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12950  Htr-like protease  52.47 
 
 
383 aa  352  8e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  54.6 
 
 
417 aa  348  1e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  52.47 
 
 
372 aa  324  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1505  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.9 
 
 
387 aa  319  6e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.98947  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2688  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  54.17 
 
 
391 aa  318  9e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  47.62 
 
 
465 aa  308  8e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  47.08 
 
 
443 aa  308  8e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  48.66 
 
 
513 aa  304  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  42.75 
 
 
442 aa  302  7.000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.99 
 
 
442 aa  301  1e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3156  peptidase S1C, Do  48.76 
 
 
464 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  0.845897 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  45.14 
 
 
471 aa  293  5e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  48.99 
 
 
463 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  47.66 
 
 
463 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  48.77 
 
 
453 aa  289  6e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  47.8 
 
 
450 aa  289  7e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  47.41 
 
 
468 aa  289  7e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  49.85 
 
 
464 aa  288  8e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  48.36 
 
 
496 aa  288  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  48.61 
 
 
460 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  45.95 
 
 
476 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  46.45 
 
 
457 aa  285  7e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  48.77 
 
 
451 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  46.63 
 
 
450 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  47.13 
 
 
467 aa  282  9e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  48.77 
 
 
450 aa  282  9e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  47.84 
 
 
450 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  45.29 
 
 
478 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  47.84 
 
 
450 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  47.84 
 
 
450 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  46.02 
 
 
479 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  47.84 
 
 
450 aa  281  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  47.84 
 
 
450 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  47.84 
 
 
450 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  47.84 
 
 
450 aa  281  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2404  2-alkenal reductase  45.26 
 
 
350 aa  280  4e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.993946  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  47.84 
 
 
449 aa  280  4e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  43.9 
 
 
505 aa  279  6e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  45.56 
 
 
474 aa  279  6e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  45.56 
 
 
474 aa  279  6e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  47.53 
 
 
450 aa  279  6e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  47.58 
 
 
458 aa  279  6e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2179  protease Do  45.09 
 
 
494 aa  279  7e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  43.6 
 
 
484 aa  278  1e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  43.69 
 
 
474 aa  278  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  47.22 
 
 
451 aa  278  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  43.47 
 
 
473 aa  277  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>