More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3298 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  100 
 
 
511 aa  1025    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  40.44 
 
 
513 aa  320  5e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  43.22 
 
 
500 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  42.25 
 
 
475 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  42.13 
 
 
501 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  38.88 
 
 
472 aa  300  6e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  39.13 
 
 
476 aa  299  7e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  41.51 
 
 
487 aa  294  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  42.42 
 
 
469 aa  294  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  40.27 
 
 
464 aa  293  5e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  38.98 
 
 
511 aa  292  8e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  42.82 
 
 
495 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  42.82 
 
 
495 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  42.82 
 
 
495 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  42.82 
 
 
483 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  42.82 
 
 
483 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  42.82 
 
 
495 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  42.82 
 
 
483 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  40.7 
 
 
479 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  40.13 
 
 
474 aa  289  7e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  36.69 
 
 
504 aa  289  9e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  38.76 
 
 
484 aa  288  1e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  39.19 
 
 
502 aa  288  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  38.24 
 
 
506 aa  286  5e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  42.14 
 
 
495 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  39.48 
 
 
474 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  37.93 
 
 
471 aa  285  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  41.07 
 
 
494 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  41.53 
 
 
494 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  41.53 
 
 
494 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  39.51 
 
 
471 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  40.41 
 
 
457 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  41.4 
 
 
488 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  44.3 
 
 
493 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  44.3 
 
 
493 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  39 
 
 
481 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  41.45 
 
 
492 aa  283  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  42.61 
 
 
525 aa  283  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  41.45 
 
 
492 aa  283  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  44.03 
 
 
493 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  39.46 
 
 
479 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  38.22 
 
 
473 aa  281  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  39.33 
 
 
477 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  39.19 
 
 
492 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  39.1 
 
 
482 aa  279  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  40.27 
 
 
471 aa  277  3e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  36.47 
 
 
473 aa  276  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  42.45 
 
 
494 aa  277  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  38.74 
 
 
477 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  41.89 
 
 
478 aa  276  9e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  40.92 
 
 
490 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  37.55 
 
 
502 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  36.99 
 
 
505 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  46.57 
 
 
508 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  36.72 
 
 
476 aa  274  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  39.78 
 
 
514 aa  273  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  36.62 
 
 
479 aa  273  7e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  38.06 
 
 
491 aa  272  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01713  periplasmic protease  37.48 
 
 
528 aa  272  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0157  peptidase S1C, Do  37.61 
 
 
485 aa  272  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  38.32 
 
 
471 aa  271  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  39.75 
 
 
499 aa  271  2e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  38.95 
 
 
472 aa  271  2e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  36.15 
 
 
476 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  40.56 
 
 
475 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  36.33 
 
 
476 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  38.74 
 
 
489 aa  270  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  39.03 
 
 
474 aa  270  4e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  39.61 
 
 
505 aa  270  7e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0147  serine protease  37.39 
 
 
485 aa  270  7e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000224788 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  39.25 
 
 
483 aa  270  7e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  36.06 
 
 
503 aa  270  7e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  38.94 
 
 
473 aa  269  8e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  39.25 
 
 
483 aa  269  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  37.74 
 
 
535 aa  268  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  38.94 
 
 
474 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  39.14 
 
 
524 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  36.48 
 
 
472 aa  268  2e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  41.86 
 
 
511 aa  268  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1396  serine protease, DO/DeqQ family  38.48 
 
 
479 aa  268  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.333333  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1117  protease Do  38.48 
 
 
491 aa  268  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0590546  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1097  peptidase S1C, Do  38.02 
 
 
479 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.676957  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  36.65 
 
 
477 aa  267  4e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  38.44 
 
 
503 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  38.68 
 
 
506 aa  266  7e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  41.99 
 
 
504 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  36.55 
 
 
472 aa  265  1e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  39.26 
 
 
473 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  38.68 
 
 
493 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1242  protease DO  36.55 
 
 
472 aa  265  1e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000225025  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  41.54 
 
 
514 aa  266  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  38.12 
 
 
511 aa  264  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  37.35 
 
 
503 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  38.86 
 
 
504 aa  265  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  39.91 
 
 
461 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  39.91 
 
 
485 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  39.78 
 
 
502 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  39.78 
 
 
502 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  39.78 
 
 
502 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  39.78 
 
 
502 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>