More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2247 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2247  peptidase S1C, Do  100 
 
 		 497 aa  977    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3331  peptidase S1C, Do  58.01 
 
 		 510 aa  545  1e-154  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107916  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  53 
 
 		 518 aa  504  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  53.96 
 
 		 501 aa  473  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  38.58 
 
 		 506 aa  310  4e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  41.05 
 
 		 501 aa  306  7e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  40.81 
 
 		 493 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  39.24 
 
 		 491 aa  302  8.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  40 
 
 		 487 aa  301  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3889  protease Do  39.91 
 
 		 524 aa  300  4e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42007  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  40.17 
 
 		 506 aa  297  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  40.34 
 
 		 493 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  43.89 
 
 		 517 aa  292  8e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  42.79 
 
 		 527 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  40.55 
 
 		 508 aa  290  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  38.87 
 
 		 514 aa  290  4e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  41.93 
 
 		 527 aa  289  9e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  40.51 
 
 		 489 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  39.87 
 
 		 491 aa  287  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  37.24 
 
 		 513 aa  286  5e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  38.97 
 
 		 464 aa  286  5e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  37.24 
 
 		 513 aa  286  5e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  37.04 
 
 		 537 aa  286  7e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  40.9 
 
 		 500 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  37.4 
 
 		 498 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  40.41 
 
 		 496 aa  283  6.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  37.4 
 
 		 498 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  37.4 
 
 		 498 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  38.99 
 
 		 502 aa  283  7.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  37.55 
 
 		 469 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  39.46 
 
 		 505 aa  282  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  37.63 
 
 		 490 aa  282  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  39.03 
 
 		 504 aa  282  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  40.79 
 
 		 494 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  39.29 
 
 		 508 aa  280  4e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  38.72 
 
 		 502 aa  280  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  38.72 
 
 		 502 aa  280  6e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  38.72 
 
 		 502 aa  280  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  38.72 
 
 		 461 aa  279  7e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  37.3 
 
 		 499 aa  279  7e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  40.17 
 
 		 494 aa  279  7e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  40.3 
 
 		 482 aa  279  8e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  39.16 
 
 		 501 aa  279  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  40.12 
 
 		 483 aa  279  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  37.3 
 
 		 499 aa  279  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  39.92 
 
 		 477 aa  279  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  39.92 
 
 		 477 aa  279  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  37.93 
 
 		 524 aa  278  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  37.93 
 
 		 524 aa  278  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  38.26 
 
 		 503 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  39.28 
 
 		 496 aa  278  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  39.96 
 
 		 494 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  36.65 
 
 		 500 aa  277  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  40.38 
 
 		 494 aa  277  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  40 
 
 		 457 aa  276  5e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  38.3 
 
 		 485 aa  276  5e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  40.9 
 
 		 481 aa  276  6e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  38.73 
 
 		 483 aa  276  8e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  35.17 
 
 		 527 aa  276  8e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  38.19 
 
 		 515 aa  276  8e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  38.16 
 
 		 503 aa  276  9e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  39.75 
 
 		 493 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  38.73 
 
 		 483 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  38.16 
 
 		 503 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  36.59 
 
 		 524 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  39.11 
 
 		 496 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  39.75 
 
 		 493 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  38.41 
 
 		 485 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  38.41 
 
 		 502 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  37.66 
 
 		 520 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  38.49 
 
 		 503 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  38.41 
 
 		 502 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  38.9 
 
 		 473 aa  274  3e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5265  protease Do  38.58 
 
 		 498 aa  273  5.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  39.54 
 
 		 493 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  36.71 
 
 		 509 aa  273  7e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  37.21 
 
 		 498 aa  272  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  39.49 
 
 		 493 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  39.71 
 
 		 483 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  39.71 
 
 		 483 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  39.51 
 
 		 475 aa  272  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  39.71 
 
 		 483 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  37.27 
 
 		 520 aa  271  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  39.71 
 
 		 495 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  39.71 
 
 		 495 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  36.97 
 
 		 475 aa  271  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  39.71 
 
 		 495 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  39.71 
 
 		 495 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  35.61 
 
 		 520 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  37.45 
 
 		 496 aa  270  4e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  38 
 
 		 497 aa  270  4e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  37.24 
 
 		 501 aa  270  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  38.81 
 
 		 501 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  37.31 
 
 		 485 aa  270  5e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  38.19 
 
 		 528 aa  270  5e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  38.48 
 
 		 496 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  39.5 
 
 		 495 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  42.6 
 
 		 509 aa  269  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  36.29 
 
 		 588 aa  269  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  38.91 
 
 		 459 aa  268  1e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.303504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>