More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0929 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0929  protease Do  100 
 
 
473 aa  952    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572701  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1164  protease Do  53.62 
 
 
464 aa  461  9.999999999999999e-129  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0251777  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1160  protease Do  44.14 
 
 
498 aa  345  1e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336016  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  41.63 
 
 
476 aa  317  4e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  39.17 
 
 
471 aa  299  9e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  37.78 
 
 
476 aa  297  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  38.48 
 
 
472 aa  297  4e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  38.66 
 
 
476 aa  292  7e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  40.97 
 
 
485 aa  291  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  38.77 
 
 
502 aa  288  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  38.06 
 
 
476 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  37.67 
 
 
464 aa  286  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  38.99 
 
 
457 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  39.21 
 
 
502 aa  285  2.0000000000000002e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  41.5 
 
 
480 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  40.35 
 
 
481 aa  280  3e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  40.6 
 
 
482 aa  280  3e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  36.7 
 
 
474 aa  280  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  36.48 
 
 
474 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  37.42 
 
 
479 aa  277  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  38.76 
 
 
458 aa  277  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  38.05 
 
 
478 aa  277  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  38.56 
 
 
464 aa  277  4e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  41.79 
 
 
475 aa  276  5e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  36.51 
 
 
466 aa  276  7e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  36.5 
 
 
477 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  36.54 
 
 
492 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  36.87 
 
 
474 aa  274  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  39.19 
 
 
484 aa  273  6e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  37.31 
 
 
504 aa  273  6e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  37.75 
 
 
498 aa  272  8.000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  36.78 
 
 
479 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  36.28 
 
 
477 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  38.16 
 
 
475 aa  271  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  37.69 
 
 
473 aa  271  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  37.84 
 
 
474 aa  271  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  36.93 
 
 
473 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  38.92 
 
 
476 aa  270  5e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  36.03 
 
 
462 aa  269  7e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  35.14 
 
 
482 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  39.59 
 
 
487 aa  266  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  38.3 
 
 
461 aa  266  8e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  42.75 
 
 
488 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  35.85 
 
 
467 aa  263  4.999999999999999e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  39.47 
 
 
499 aa  263  6e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  37.85 
 
 
458 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  35.33 
 
 
513 aa  261  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  38.97 
 
 
479 aa  259  6e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  36.73 
 
 
506 aa  258  1e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  38.61 
 
 
511 aa  258  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  34.48 
 
 
473 aa  256  7e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  35.33 
 
 
478 aa  256  7e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.68 
 
 
398 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  37.47 
 
 
481 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  38.24 
 
 
473 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  42.21 
 
 
387 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  37.74 
 
 
505 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  38.51 
 
 
458 aa  252  9.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  41.93 
 
 
388 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  41.93 
 
 
402 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  34.69 
 
 
477 aa  252  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  34.69 
 
 
477 aa  252  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  42.57 
 
 
407 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  41.93 
 
 
402 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  40.73 
 
 
398 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  41.93 
 
 
402 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  41.93 
 
 
402 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  39.23 
 
 
492 aa  251  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  36.43 
 
 
455 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  39.23 
 
 
492 aa  251  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  36.43 
 
 
451 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  35.68 
 
 
451 aa  250  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  36.43 
 
 
455 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  41.93 
 
 
402 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  36.43 
 
 
455 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  37.38 
 
 
449 aa  250  5e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3646  serine endoprotease  36.43 
 
 
455 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  41.41 
 
 
396 aa  249  7e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  38.38 
 
 
485 aa  249  8e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  43.53 
 
 
402 aa  249  9e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  38.91 
 
 
490 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  36.89 
 
 
463 aa  249  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  36.89 
 
 
457 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  36.89 
 
 
457 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  34.95 
 
 
462 aa  249  1e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  36.87 
 
 
449 aa  248  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  36.14 
 
 
471 aa  249  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  38.42 
 
 
388 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  42.86 
 
 
401 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  41.64 
 
 
388 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  36.28 
 
 
472 aa  248  2e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  42.48 
 
 
407 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  41.88 
 
 
511 aa  248  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.86 
 
 
401 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  43.11 
 
 
401 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  35.81 
 
 
483 aa  247  4e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.11 
 
 
401 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.11 
 
 
401 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  37.73 
 
 
450 aa  247  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.86 
 
 
401 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>