More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1164 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1164  protease Do  100 
 
 
464 aa  934    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0251777  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0929  protease Do  53.17 
 
 
473 aa  449  1e-125  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572701  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1160  protease Do  43.17 
 
 
498 aa  340  4e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  40.22 
 
 
476 aa  301  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  40.84 
 
 
457 aa  300  4e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  42.08 
 
 
478 aa  291  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  41.82 
 
 
476 aa  290  4e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  38.24 
 
 
476 aa  290  4e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  37.15 
 
 
485 aa  287  4e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  39.92 
 
 
458 aa  286  5e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  41.04 
 
 
476 aa  286  7e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  41.53 
 
 
472 aa  286  8e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  42.24 
 
 
464 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  38.66 
 
 
464 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  40.98 
 
 
476 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  39.64 
 
 
471 aa  282  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  39.55 
 
 
466 aa  280  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  43.04 
 
 
461 aa  277  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  39.39 
 
 
473 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  38.21 
 
 
502 aa  274  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  37.92 
 
 
464 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  40.3 
 
 
487 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  37.91 
 
 
479 aa  269  8.999999999999999e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1599  serine protease, MucD, putative  40.17 
 
 
504 aa  268  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.210077  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  39.81 
 
 
475 aa  268  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  39.1 
 
 
462 aa  269  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  37.97 
 
 
504 aa  268  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  38.37 
 
 
474 aa  268  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  37.13 
 
 
524 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  41.04 
 
 
488 aa  266  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  36.63 
 
 
477 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  36.68 
 
 
479 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  37.03 
 
 
502 aa  265  2e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  36.63 
 
 
492 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  35.98 
 
 
474 aa  262  8e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  35.98 
 
 
474 aa  262  8e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  36.42 
 
 
477 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  36.66 
 
 
481 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  36.61 
 
 
479 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2069  protease Do  37.13 
 
 
523 aa  260  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719287  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  40.58 
 
 
511 aa  259  6e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  38.26 
 
 
492 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  35.93 
 
 
482 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  38.26 
 
 
492 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  36.52 
 
 
481 aa  257  3e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  38.19 
 
 
483 aa  257  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  38.19 
 
 
483 aa  257  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  38.19 
 
 
483 aa  257  4e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  38.19 
 
 
495 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  38.19 
 
 
495 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  38.19 
 
 
495 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  38.19 
 
 
495 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  36.87 
 
 
474 aa  256  5e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  37.2 
 
 
473 aa  256  6e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1771  peptidase S1C, Do  36.92 
 
 
524 aa  256  8e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0217208  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  39.33 
 
 
494 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  39.33 
 
 
494 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  35.68 
 
 
477 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  35.68 
 
 
477 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  37.89 
 
 
491 aa  254  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  38.89 
 
 
494 aa  254  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  38 
 
 
482 aa  254  3e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  38.41 
 
 
495 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  38.89 
 
 
493 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  38.89 
 
 
493 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  39.1 
 
 
489 aa  252  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  35.39 
 
 
506 aa  251  2e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  36.48 
 
 
505 aa  251  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  41.21 
 
 
514 aa  251  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  38.67 
 
 
493 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  38.89 
 
 
494 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  36.32 
 
 
478 aa  250  3e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  34.86 
 
 
475 aa  249  7e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  40.05 
 
 
469 aa  248  1e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  37.89 
 
 
490 aa  248  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  36.01 
 
 
473 aa  248  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  38.08 
 
 
492 aa  248  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  38.83 
 
 
451 aa  248  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  36.18 
 
 
453 aa  248  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  40.29 
 
 
504 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  36.46 
 
 
499 aa  247  3e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  36.28 
 
 
473 aa  247  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  36.19 
 
 
525 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  41.62 
 
 
380 aa  247  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  35.1 
 
 
498 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  39.81 
 
 
503 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  38.28 
 
 
472 aa  246  6.999999999999999e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.22 
 
 
412 aa  245  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  35.4 
 
 
491 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  38.24 
 
 
471 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  40.77 
 
 
485 aa  244  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  37.5 
 
 
504 aa  244  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  37.5 
 
 
513 aa  243  5e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  37.25 
 
 
508 aa  243  7e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  34.42 
 
 
508 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  35.43 
 
 
497 aa  241  1e-62  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  34.07 
 
 
487 aa  242  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  35.7 
 
 
456 aa  242  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3822  peptidase S1C, Do  39.62 
 
 
501 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  36.3 
 
 
468 aa  242  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>