More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5152 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5152  protease Do  100 
 
 
506 aa  1017    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000102653  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3918  protease Do  54.56 
 
 
508 aa  526  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0052  serine protease  46.5 
 
 
483 aa  385  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5949  HtrA2 peptidase  45.44 
 
 
512 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510006  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0618  hypothetical protein  42.09 
 
 
503 aa  381  1e-104  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0209  protease Do  47.49 
 
 
517 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0976741 
 
 
-
 
NC_002950  PG0593  htrA protein  45.84 
 
 
498 aa  360  4e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3006  periplasmic serine protease  42.47 
 
 
472 aa  338  9.999999999999999e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.337572  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0019  protease Do  39.76 
 
 
466 aa  318  2e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.822523  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  40.89 
 
 
535 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  40.47 
 
 
474 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  40.47 
 
 
474 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2092  protease Do  38.62 
 
 
471 aa  298  2e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  38.93 
 
 
492 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  38.93 
 
 
477 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  38.93 
 
 
477 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  38.99 
 
 
479 aa  289  8e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  40.41 
 
 
509 aa  289  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  39.39 
 
 
474 aa  288  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  38.44 
 
 
482 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  37.9 
 
 
511 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  41.88 
 
 
506 aa  281  3e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  37.67 
 
 
479 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  37.44 
 
 
481 aa  280  5e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  38.58 
 
 
502 aa  278  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  39.56 
 
 
516 aa  279  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  40.05 
 
 
474 aa  278  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  36.62 
 
 
502 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  36.48 
 
 
461 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12778  serine protease precursor  35.86 
 
 
467 aa  276  6e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  35.17 
 
 
473 aa  276  6e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  36.62 
 
 
502 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  36.62 
 
 
502 aa  276  7e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  36.62 
 
 
502 aa  276  7e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  36.62 
 
 
502 aa  276  7e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  36.62 
 
 
485 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  36.9 
 
 
505 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  39.53 
 
 
525 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  38.2 
 
 
476 aa  272  9e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  36.02 
 
 
473 aa  271  1e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  36.4 
 
 
485 aa  272  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  36.95 
 
 
469 aa  272  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  37.89 
 
 
491 aa  271  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  36.73 
 
 
503 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  38.26 
 
 
473 aa  270  5e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  36.52 
 
 
503 aa  269  8.999999999999999e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  41.33 
 
 
498 aa  268  1e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  39.78 
 
 
502 aa  268  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  40.96 
 
 
499 aa  268  2e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  36.71 
 
 
487 aa  268  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01713  periplasmic protease  37.5 
 
 
528 aa  268  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  34.92 
 
 
502 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  38.46 
 
 
498 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  36.09 
 
 
514 aa  268  2.9999999999999995e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  35 
 
 
498 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  35 
 
 
498 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  35 
 
 
498 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  38.58 
 
 
504 aa  266  4e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  36.79 
 
 
490 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  38.89 
 
 
490 aa  266  7e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  38.57 
 
 
476 aa  266  7e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  37.75 
 
 
511 aa  266  8e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  37.84 
 
 
457 aa  266  8.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  35.33 
 
 
507 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3822  peptidase S1C, Do  39.45 
 
 
501 aa  265  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0403  protease Do  38.22 
 
 
483 aa  265  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  36.57 
 
 
478 aa  265  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  39.86 
 
 
500 aa  265  1e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  34.76 
 
 
477 aa  265  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  35.51 
 
 
514 aa  264  3e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  38.46 
 
 
464 aa  264  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  35.12 
 
 
505 aa  264  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  38.01 
 
 
473 aa  264  3e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  34.44 
 
 
500 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  34.31 
 
 
499 aa  263  6e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  37.97 
 
 
487 aa  263  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  43.75 
 
 
393 aa  263  6.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  35.28 
 
 
473 aa  263  8e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  36.44 
 
 
459 aa  263  8e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  33.75 
 
 
499 aa  262  8e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  38.16 
 
 
493 aa  261  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  37.53 
 
 
494 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  36.96 
 
 
467 aa  261  2e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.82 
 
 
380 aa  261  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  36.32 
 
 
491 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  37.53 
 
 
494 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  36.5 
 
 
496 aa  260  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  37.53 
 
 
494 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.87 
 
 
398 aa  260  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  39.78 
 
 
451 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  37.3 
 
 
493 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  39.64 
 
 
503 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  37.3 
 
 
493 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  38.51 
 
 
513 aa  258  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  33.26 
 
 
471 aa  258  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.67 
 
 
379 aa  258  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  39.11 
 
 
450 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  38.89 
 
 
450 aa  258  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  39.11 
 
 
450 aa  257  4e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  38.1 
 
 
488 aa  257  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>