More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12778 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_12778  serine protease precursor  100 
 
 		 467 aa  930    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2092  protease Do  49.27 
 
 		 471 aa  436  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0019  protease Do  50.64 
 
 		 466 aa  426  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.822523  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0052  serine protease  40.33 
 
 		 483 aa  324  2e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292411 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3006  periplasmic serine protease  38.87 
 
 		 472 aa  309  8e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.337572  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_002950  PG0593  htrA protein  41.43 
 
 		 498 aa  305  1.0000000000000001e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0618  hypothetical protein  40.73 
 
 		 503 aa  303  6.000000000000001e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3918  protease Do  42.64 
 
 		 508 aa  288  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  38.9 
 
 		 484 aa  280  3e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5152  protease Do  37.56 
 
 		 506 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000102653  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5949  HtrA2 peptidase  36.73 
 
 		 512 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510006  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  43.04 
 
 		 535 aa  263  4e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  46.03 
 
 		 456 aa  259  6e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0209  protease Do  36.96 
 
 		 517 aa  259  8e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0976741 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  42.52 
 
 		 450 aa  256  7e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  40.79 
 
 		 462 aa  254  3e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  42.26 
 
 		 450 aa  254  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  42.26 
 
 		 450 aa  254  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  42.26 
 
 		 450 aa  254  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  38.61 
 
 		 511 aa  253  6e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  39.3 
 
 		 489 aa  252  8.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  41.32 
 
 		 455 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  41.42 
 
 		 456 aa  251  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  48.26 
 
 		 451 aa  250  4e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  38.79 
 
 		 514 aa  250  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  36.46 
 
 		 490 aa  248  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  36.56 
 
 		 489 aa  247  4e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  36.2 
 
 		 476 aa  247  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  45.42 
 
 		 501 aa  246  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  46.44 
 
 		 502 aa  245  9e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  36.22 
 
 		 493 aa  246  9e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  38.33 
 
 		 514 aa  245  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  35.99 
 
 		 491 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  40.58 
 
 		 449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  38.44 
 
 		 463 aa  244  3e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  38.44 
 
 		 457 aa  244  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  38.44 
 
 		 457 aa  244  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  47.06 
 
 		 450 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  47.06 
 
 		 450 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  47.06 
 
 		 450 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  44.8 
 
 		 498 aa  243  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  44.22 
 
 		 446 aa  243  7.999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  37.83 
 
 		 497 aa  242  1e-62  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  38.68 
 
 		 485 aa  242  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  37.44 
 
 		 455 aa  241  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3530  serine endoprotease  36.96 
 
 		 455 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00269541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1739  peptidase S1C, Do  35.88 
 
 		 493 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0778272  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03094  serine endoprotease, periplasmic  36.96 
 
 		 455 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0472  protease Do  36.96 
 
 		 455 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00978488  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3423  serine endoprotease  36.96 
 
 		 455 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  47.22 
 
 		 450 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  33.82 
 
 		 473 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  36.44 
 
 		 487 aa  241  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0472  serine endoprotease  36.96 
 
 		 455 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0649674  normal  0.0819783 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3717  serine endoprotease  36.96 
 
 		 455 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000159943  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3542  serine endoprotease  36.96 
 
 		 455 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03045  hypothetical protein  36.96 
 
 		 455 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.471822  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4551  serine endoprotease  36.96 
 
 		 455 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00837947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  40.22 
 
 		 496 aa  240  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  38.99 
 
 		 502 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  38.99 
 
 		 502 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  38.99 
 
 		 502 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  38.99 
 
 		 502 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  38.99 
 
 		 502 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  35.08 
 
 		 509 aa  239  5e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  38.99 
 
 		 485 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  44.44 
 
 		 503 aa  240  5e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  37.77 
 
 		 503 aa  240  5e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  38.99 
 
 		 461 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3243  protease Do  35.31 
 
 		 488 aa  239  8e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0128556 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  41.39 
 
 		 455 aa  239  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  37.17 
 
 		 491 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  37.41 
 
 		 456 aa  238  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  43.11 
 
 		 505 aa  238  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  38.74 
 
 		 459 aa  238  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  36.36 
 
 		 500 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3669  serine endoprotease  36.32 
 
 		 455 aa  238  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0364754  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  45.25 
 
 		 453 aa  238  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  37.84 
 
 		 514 aa  238  2e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  36.04 
 
 		 480 aa  237  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  34.46 
 
 		 502 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  38.06 
 
 		 488 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  40.9 
 
 		 449 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  45.42 
 
 		 450 aa  236  7e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3822  peptidase S1C, Do  35.45 
 
 		 501 aa  236  8e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  37.89 
 
 		 477 aa  236  8e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  37.89 
 
 		 477 aa  236  8e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1594  protease Do  35.58 
 
 		 520 aa  236  8e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  34 
 
 		 516 aa  236  9e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  34.26 
 
 		 467 aa  236  9e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  34.22 
 
 		 481 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  37.04 
 
 		 511 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  42.81 
 
 		 498 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  34.2 
 
 		 492 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  34.2 
 
 		 492 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2479  protease Do  37.26 
 
 		 450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  39.89 
 
 		 469 aa  235  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  40.79 
 
 		 469 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  45.42 
 
 		 450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  39.47 
 
 		 471 aa  234  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>