More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0209 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0209  protease Do  100 
 
 
517 aa  1031    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0976741 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3918  protease Do  43.44 
 
 
508 aa  375  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5152  protease Do  46.09 
 
 
506 aa  364  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000102653  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0052  serine protease  42.13 
 
 
483 aa  355  8.999999999999999e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5949  HtrA2 peptidase  43.72 
 
 
512 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510006  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2092  protease Do  40.23 
 
 
471 aa  343  5e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0618  hypothetical protein  40.39 
 
 
503 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0593  htrA protein  42.27 
 
 
498 aa  312  1e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3006  periplasmic serine protease  39.22 
 
 
472 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.337572  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  38.67 
 
 
535 aa  291  3e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12778  serine protease precursor  35.52 
 
 
467 aa  278  2e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  37.55 
 
 
502 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  39.14 
 
 
484 aa  272  1e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0019  protease Do  36.38 
 
 
466 aa  270  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.822523  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  41.39 
 
 
511 aa  267  4e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  38.27 
 
 
504 aa  267  4e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  41.06 
 
 
506 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  39.87 
 
 
499 aa  259  7e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  44.41 
 
 
505 aa  258  1e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  39.42 
 
 
481 aa  259  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  40.36 
 
 
502 aa  258  2e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  36.22 
 
 
476 aa  257  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  35.57 
 
 
491 aa  256  9e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  36.88 
 
 
494 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  37.36 
 
 
482 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  36.21 
 
 
495 aa  253  6e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  36.21 
 
 
495 aa  253  6e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  36.21 
 
 
495 aa  253  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  36.7 
 
 
476 aa  253  6e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  36.21 
 
 
495 aa  253  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  36.21 
 
 
483 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  36.21 
 
 
483 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  36.21 
 
 
483 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  38.93 
 
 
396 aa  253  8.000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  33.33 
 
 
497 aa  251  2e-65  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  36.02 
 
 
476 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  36.44 
 
 
494 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  36.23 
 
 
494 aa  250  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  41.6 
 
 
513 aa  249  6e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  36.44 
 
 
493 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  36.44 
 
 
493 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  37.11 
 
 
500 aa  249  8e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  36.23 
 
 
494 aa  249  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  35.99 
 
 
495 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  35.97 
 
 
503 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  36.23 
 
 
493 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  37.32 
 
 
479 aa  246  6e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0471  protease Do  37.04 
 
 
500 aa  246  6e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0438945 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  36.47 
 
 
473 aa  246  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  36.09 
 
 
466 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3822  peptidase S1C, Do  35.38 
 
 
501 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.59 
 
 
412 aa  245  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  37.53 
 
 
504 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  33.4 
 
 
474 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  33.62 
 
 
479 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  35.51 
 
 
477 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  34.04 
 
 
477 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  37.28 
 
 
472 aa  244  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  34.68 
 
 
476 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  33.19 
 
 
474 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  33.26 
 
 
492 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  33.82 
 
 
482 aa  243  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  36.77 
 
 
457 aa  243  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  33.26 
 
 
477 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  34.14 
 
 
473 aa  241  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  35.98 
 
 
490 aa  241  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  34.97 
 
 
467 aa  241  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  36.79 
 
 
476 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  36 
 
 
464 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  35.16 
 
 
469 aa  241  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  35.17 
 
 
481 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  33.9 
 
 
474 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  37.04 
 
 
473 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  36.23 
 
 
478 aa  240  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.71 
 
 
380 aa  240  4e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  36.79 
 
 
458 aa  240  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  35.79 
 
 
481 aa  239  8e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  35.63 
 
 
526 aa  239  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.67 
 
 
401 aa  239  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  39.9 
 
 
498 aa  239  1e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  37.9 
 
 
496 aa  239  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  32.63 
 
 
514 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  40.67 
 
 
401 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.67 
 
 
401 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  40.67 
 
 
401 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.67 
 
 
401 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.67 
 
 
401 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  34.76 
 
 
511 aa  238  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  34.56 
 
 
528 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  34.02 
 
 
478 aa  238  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  39.9 
 
 
474 aa  237  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  31.5 
 
 
473 aa  237  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  35.45 
 
 
479 aa  237  3e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  39.11 
 
 
503 aa  238  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  39.83 
 
 
402 aa  237  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  37.44 
 
 
503 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  33.73 
 
 
492 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  33.73 
 
 
492 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  38.78 
 
 
456 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  36.18 
 
 
489 aa  236  6e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>