More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0593 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0593  htrA protein  100 
 
 
498 aa  999    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0618  hypothetical protein  46.36 
 
 
503 aa  393  1e-108  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3918  protease Do  44.2 
 
 
508 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0052  serine protease  46.19 
 
 
483 aa  377  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5152  protease Do  45.39 
 
 
506 aa  351  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000102653  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3006  periplasmic serine protease  45.27 
 
 
472 aa  327  3e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.337572  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5949  HtrA2 peptidase  41.65 
 
 
512 aa  325  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510006  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2092  protease Do  45.73 
 
 
471 aa  320  3.9999999999999996e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0019  protease Do  40.25 
 
 
466 aa  316  5e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.822523  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12778  serine protease precursor  40.73 
 
 
467 aa  308  2.0000000000000002e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0209  protease Do  41.81 
 
 
517 aa  307  3e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0976741 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  41.11 
 
 
535 aa  298  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  39.91 
 
 
505 aa  297  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  42.58 
 
 
511 aa  289  6e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  39.78 
 
 
503 aa  289  9e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  41.36 
 
 
459 aa  287  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  42.12 
 
 
450 aa  288  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  39.74 
 
 
498 aa  286  7e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  39.35 
 
 
503 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  37.89 
 
 
502 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  37.89 
 
 
502 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  37.89 
 
 
502 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  41.88 
 
 
450 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  41.88 
 
 
450 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  37.89 
 
 
461 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  38.05 
 
 
485 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  41.88 
 
 
450 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  37.78 
 
 
502 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  37.78 
 
 
485 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  37.78 
 
 
502 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  42.2 
 
 
514 aa  281  2e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  37.69 
 
 
474 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  42.44 
 
 
514 aa  281  2e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  43.57 
 
 
501 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  37.47 
 
 
474 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  38.17 
 
 
492 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  38.43 
 
 
493 aa  280  4e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  39.33 
 
 
473 aa  280  5e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  36.84 
 
 
502 aa  280  6e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  38.33 
 
 
513 aa  280  6e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  38.14 
 
 
477 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  38.22 
 
 
479 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  37.69 
 
 
477 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  37.98 
 
 
474 aa  277  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  40.71 
 
 
491 aa  277  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  41.45 
 
 
462 aa  276  5e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  42.3 
 
 
487 aa  276  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  42.76 
 
 
506 aa  276  8e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  41.85 
 
 
450 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  39.31 
 
 
489 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  42.11 
 
 
450 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  43.5 
 
 
504 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  42.11 
 
 
450 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  41.57 
 
 
456 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  38.84 
 
 
467 aa  274  3e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  40.72 
 
 
449 aa  274  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  40.45 
 
 
484 aa  273  7e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  41.36 
 
 
446 aa  272  8.000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  40.49 
 
 
489 aa  272  8.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  41.53 
 
 
488 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  42.61 
 
 
453 aa  272  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  41.6 
 
 
450 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  39.6 
 
 
457 aa  271  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  40.6 
 
 
450 aa  271  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  36.03 
 
 
516 aa  271  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  40.14 
 
 
473 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  37.61 
 
 
490 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  40.65 
 
 
463 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  41.07 
 
 
507 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0403  protease Do  39.47 
 
 
483 aa  270  4e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1599  serine protease, MucD, putative  38.36 
 
 
504 aa  270  5e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.210077  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  40.65 
 
 
457 aa  270  5e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  42.17 
 
 
450 aa  270  5e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  42.11 
 
 
451 aa  270  5e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  40.65 
 
 
457 aa  270  5e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  42 
 
 
499 aa  269  7e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3822  peptidase S1C, Do  41.15 
 
 
501 aa  269  7e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  39.53 
 
 
500 aa  269  8e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  39.53 
 
 
499 aa  269  8e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  35.59 
 
 
498 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  35.59 
 
 
498 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  35.59 
 
 
498 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  41.31 
 
 
449 aa  268  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  38.01 
 
 
495 aa  268  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  41.8 
 
 
503 aa  268  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  40.83 
 
 
502 aa  268  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  35.46 
 
 
481 aa  268  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  36.12 
 
 
479 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  37.5 
 
 
494 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  38.01 
 
 
483 aa  267  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  41.25 
 
 
451 aa  267  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  38.01 
 
 
483 aa  267  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  38.01 
 
 
483 aa  267  4e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  43.67 
 
 
490 aa  266  5e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  38.01 
 
 
495 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  40.55 
 
 
492 aa  266  5e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  38.01 
 
 
495 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  38.01 
 
 
495 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  38.01 
 
 
495 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  40.55 
 
 
492 aa  266  5e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>