More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2092 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2092  protease Do  100 
 
 		 471 aa  947    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12778  serine protease precursor  49.27 
 
 		 467 aa  436  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0019  protease Do  49.58 
 
 		 466 aa  424  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.822523  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3918  protease Do  42.51 
 
 		 508 aa  341  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0052  serine protease  44.66 
 
 		 483 aa  332  9e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292411 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0618  hypothetical protein  41.72 
 
 		 503 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0593  htrA protein  45.73 
 
 		 498 aa  320  5e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0209  protease Do  39.32 
 
 		 517 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0976741 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3006  periplasmic serine protease  44.85 
 
 		 472 aa  296  4e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.337572  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5949  HtrA2 peptidase  41.13 
 
 		 512 aa  293  5e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510006  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5152  protease Do  40.27 
 
 		 506 aa  288  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000102653  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  37.73 
 
 		 535 aa  263  6e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  38.08 
 
 		 473 aa  258  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  39.28 
 
 		 457 aa  256  6e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  39.28 
 
 		 457 aa  256  6e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  39.28 
 
 		 463 aa  256  7e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  39.7 
 
 		 456 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  37.44 
 
 		 467 aa  253  5.000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  38.1 
 
 		 471 aa  252  9.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  37.33 
 
 		 449 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  41.93 
 
 		 450 aa  250  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  37.09 
 
 		 483 aa  250  5e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  37.09 
 
 		 483 aa  250  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  37.09 
 
 		 483 aa  250  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  37.09 
 
 		 495 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  37.09 
 
 		 495 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  37.09 
 
 		 495 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  37.09 
 
 		 495 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  38.27 
 
 		 456 aa  249  7e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  38.69 
 
 		 451 aa  249  8e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  46.08 
 
 		 481 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  38.82 
 
 		 450 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  37.09 
 
 		 495 aa  248  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  40.96 
 
 		 450 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  37.28 
 
 		 451 aa  248  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  40.96 
 
 		 450 aa  248  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  38.73 
 
 		 450 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  40.26 
 
 		 450 aa  247  4e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  37.53 
 
 		 455 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3646  serine endoprotease  37.53 
 
 		 455 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  37.53 
 
 		 482 aa  246  6e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  36.67 
 
 		 459 aa  246  6.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  37.53 
 
 		 455 aa  246  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  37.53 
 
 		 455 aa  246  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3669  serine endoprotease  36.79 
 
 		 455 aa  246  8e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0364754  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  36.67 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  41.76 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  36.67 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  38.58 
 
 		 451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  40.17 
 
 		 462 aa  244  3e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  39.43 
 
 		 474 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  39.43 
 
 		 474 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  37.81 
 
 		 484 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  37.92 
 
 		 456 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  39.43 
 
 		 474 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  39.43 
 
 		 474 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  39.43 
 
 		 474 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  39.43 
 
 		 474 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  40.9 
 
 		 450 aa  243  5e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  36.44 
 
 		 450 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  43.52 
 
 		 446 aa  243  6e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  43.48 
 
 		 485 aa  243  7e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  39.43 
 
 		 474 aa  242  9e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  33.05 
 
 		 514 aa  242  1e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  40.05 
 
 		 480 aa  242  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  40 
 
 		 511 aa  242  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  39.14 
 
 		 474 aa  242  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  33.6 
 
 		 523 aa  241  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  35.96 
 
 		 476 aa  240  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  35.66 
 
 		 488 aa  240  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  34.06 
 
 		 502 aa  240  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  34.06 
 
 		 502 aa  240  5e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3530  serine endoprotease  42.17 
 
 		 455 aa  240  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00269541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  34.06 
 
 		 502 aa  240  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03094  serine endoprotease, periplasmic  42.17 
 
 		 455 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0472  protease Do  42.17 
 
 		 455 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00978488  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3542  serine endoprotease  42.17 
 
 		 455 aa  239  5.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03045  hypothetical protein  42.17 
 
 		 455 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.471822  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0472  serine endoprotease  42.17 
 
 		 455 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0649674  normal  0.0819783 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3423  serine endoprotease  42.17 
 
 		 455 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3717  serine endoprotease  42.17 
 
 		 455 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000159943  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  38.7 
 
 		 502 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  34.06 
 
 		 461 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4551  serine endoprotease  42.17 
 
 		 455 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00837947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  35.78 
 
 		 498 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  41.04 
 
 		 453 aa  239  8e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  37.27 
 
 		 479 aa  239  9e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  37.63 
 
 		 502 aa  239  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  37.63 
 
 		 502 aa  239  9e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.68 
 
 		 379 aa  239  9e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  33.96 
 
 		 516 aa  238  1e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  37.63 
 
 		 485 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  37.8 
 
 		 506 aa  239  1e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.77 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  36.58 
 
 		 492 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  35.77 
 
 		 494 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  45.28 
 
 		 449 aa  238  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  36.58 
 
 		 492 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  36.76 
 
 		 523 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  45.32 
 
 		 537 aa  237  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>