More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2130 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 
368 aa  729    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0935  hypothetical protein  48.48 
 
 
363 aa  302  5.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  48.29 
 
 
469 aa  302  7.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0965  hypothetical protein  48.48 
 
 
363 aa  301  8.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  47.54 
 
 
375 aa  295  8e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.98 
 
 
372 aa  291  9e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  48.92 
 
 
368 aa  286  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2015  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.08 
 
 
383 aa  286  5e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  50.15 
 
 
365 aa  277  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  46.45 
 
 
384 aa  276  3e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  46.36 
 
 
383 aa  276  6e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  46.09 
 
 
383 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.47 
 
 
384 aa  270  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46875  predicted protein  43.7 
 
 
466 aa  270  4e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  48.47 
 
 
383 aa  269  7e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.38 
 
 
377 aa  266  4e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  43.82 
 
 
374 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  45.06 
 
 
374 aa  264  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3040  2-alkenal reductase  48.47 
 
 
375 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0397571 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  47.98 
 
 
344 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2249  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.55 
 
 
388 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3217  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.86 
 
 
387 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.557937  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3562  predicted protein  46.33 
 
 
329 aa  241  1e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.04 
 
 
399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0793  2-alkenal reductase  46.18 
 
 
376 aa  233  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1966  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  40.36 
 
 
425 aa  232  6e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000431561  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1127  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.45 
 
 
366 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0664983  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.14 
 
 
394 aa  232  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4575  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.31 
 
 
375 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3736  2-alkenal reductase  43.08 
 
 
399 aa  226  7e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.64 
 
 
366 aa  225  9e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0324  HtrA2 peptidase  38.36 
 
 
413 aa  217  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  39.64 
 
 
396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2947  2-alkenal reductase  45.17 
 
 
374 aa  213  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5341  2-alkenal reductase  46.32 
 
 
381 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5265  2-alkenal reductase  44.88 
 
 
381 aa  210  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4798  2-alkenal reductase  44.88 
 
 
381 aa  209  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  40.83 
 
 
374 aa  206  6e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.39 
 
 
387 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  38.23 
 
 
379 aa  204  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  34.79 
 
 
389 aa  202  9e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31732  predicted protein  40.51 
 
 
368 aa  199  7e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  35.33 
 
 
471 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.91 
 
 
426 aa  197  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.146995  normal  0.128944 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  35.9 
 
 
409 aa  196  7e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  40.34 
 
 
476 aa  196  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  38.11 
 
 
472 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.64 
 
 
396 aa  193  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.18 
 
 
486 aa  192  5e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0718  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.56 
 
 
424 aa  191  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  40.74 
 
 
385 aa  191  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  38.11 
 
 
392 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  37.72 
 
 
505 aa  190  4e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1523  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.24 
 
 
421 aa  189  7e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.415135  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  35.73 
 
 
369 aa  189  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  40.7 
 
 
511 aa  189  9e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  38.37 
 
 
383 aa  189  9e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4771  protease Do  41.64 
 
 
496 aa  188  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.411686  hitchhiker  0.000180606 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0552  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.5 
 
 
423 aa  188  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  38.7 
 
 
502 aa  188  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1673  2-alkenal reductase  34.35 
 
 
381 aa  187  2e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  34.61 
 
 
403 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.05 
 
 
384 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  38.68 
 
 
511 aa  186  5e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.54 
 
 
380 aa  186  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.94 
 
 
381 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  38.52 
 
 
511 aa  186  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  36.73 
 
 
478 aa  186  7e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0935  2-alkenal reductase  37.71 
 
 
400 aa  186  8e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000784268  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  37.13 
 
 
504 aa  186  8e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  33.95 
 
 
476 aa  185  9e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  39.46 
 
 
491 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.79 
 
 
398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  40.14 
 
 
516 aa  185  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  36.31 
 
 
476 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  38.02 
 
 
395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  39.3 
 
 
396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2119  2-alkenal reductase  39.29 
 
 
418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  35.83 
 
 
506 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  38.05 
 
 
387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  41.98 
 
 
418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12778  serine protease precursor  35.87 
 
 
467 aa  183  3e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  35.18 
 
 
535 aa  183  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  39.5 
 
 
404 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  37.63 
 
 
403 aa  182  6e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  38.83 
 
 
401 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  38.83 
 
 
401 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.83 
 
 
401 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.83 
 
 
401 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.83 
 
 
401 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  37.71 
 
 
402 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  37.71 
 
 
388 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  41.52 
 
 
469 aa  182  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  36.45 
 
 
452 aa  182  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  35.89 
 
 
513 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  37.71 
 
 
402 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  37.71 
 
 
402 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  37.71 
 
 
402 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  39.15 
 
 
404 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  38.49 
 
 
402 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>