More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5265 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4798  2-alkenal reductase  99.74 
 
 		 381 aa  739    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5265  2-alkenal reductase  100 
 
 		 381 aa  741    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5341  2-alkenal reductase  97.64 
 
 		 381 aa  666    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0793  2-alkenal reductase  75 
 
 		 376 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3040  2-alkenal reductase  70.71 
 
 		 375 aa  502  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0397571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4575  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  70.79 
 
 		 375 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1127  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  59.79 
 
 		 366 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0664983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2249  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  60.05 
 
 		 388 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3736  2-alkenal reductase  61.64 
 
 		 399 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3217  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  58.73 
 
 		 387 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.557937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  49.35 
 
 		 383 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  49.35 
 
 		 383 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  48.95 
 
 		 383 aa  298  7e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  49.08 
 
 		 384 aa  299  7e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  51.22 
 
 		 374 aa  298  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  47.18 
 
 		 375 aa  296  4e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.29 
 
 		 384 aa  294  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  49.57 
 
 		 469 aa  288  8e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  47.41 
 
 		 368 aa  288  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.28 
 
 		 377 aa  285  9e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.76 
 
 		 372 aa  282  5.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2947  2-alkenal reductase  53.56 
 
 		 374 aa  280  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  49.1 
 
 		 374 aa  279  7e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  50.74 
 
 		 344 aa  266  5e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2015  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.76 
 
 		 383 aa  263  3e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  46.68 
 
 		 365 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.51 
 
 		 368 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46875  predicted protein  41.94 
 
 		 466 aa  231  1e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0935  hypothetical protein  40.27 
 
 		 363 aa  229  6e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0965  hypothetical protein  40.27 
 
 		 363 aa  229  7e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.72 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  42.23 
 
 		 396 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  37.43 
 
 		 374 aa  209  6e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3562  predicted protein  41.11 
 
 		 329 aa  206  7e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.31 
 
 		 366 aa  203  5e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31732  predicted protein  39.61 
 
 		 368 aa  202  7e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.42 
 
 		 426 aa  202  7e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.146995  normal  0.128944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  46.13 
 
 		 418 aa  202  9e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.25 
 
 		 394 aa  195  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1966  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  38.77 
 
 		 425 aa  194  2e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000431561  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2119  2-alkenal reductase  44.11 
 
 		 418 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  36.18 
 
 		 389 aa  192  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  38.37 
 
 		 476 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  35.12 
 
 		 452 aa  189  8e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  34.18 
 
 		 379 aa  189  8e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  37.57 
 
 		 477 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  36.83 
 
 		 369 aa  187  4e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2342  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.63 
 
 		 367 aa  182  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  34.02 
 
 		 503 aa  182  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1673  2-alkenal reductase  38.87 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  39.12 
 
 		 453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0552  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.92 
 
 		 423 aa  180  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0324  HtrA2 peptidase  37.19 
 
 		 413 aa  180  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  37.95 
 
 		 393 aa  180  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  36.59 
 
 		 476 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0091  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.05 
 
 		 474 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000577253  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0079  2-alkenal reductase  45.05 
 
 		 474 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  39.4 
 
 		 385 aa  179  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  36.75 
 
 		 476 aa  178  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.35 
 
 		 423 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  38.33 
 
 		 483 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  38.33 
 
 		 483 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3659  2-alkenal reductase  41.34 
 
 		 341 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149627  normal  0.297116 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  40.69 
 
 		 508 aa  177  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.21 
 
 		 386 aa  176  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  37.14 
 
 		 459 aa  176  5e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  37.14 
 
 		 459 aa  176  6e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1523  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.74 
 
 		 421 aa  176  6e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.415135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0073  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.74 
 
 		 474 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.79 
 
 		 387 aa  176  8e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.31 
 
 		 384 aa  176  8e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  37.13 
 
 		 478 aa  176  9e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0789  serine endoprotease  38.94 
 
 		 476 aa  175  9e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.290182 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  38.36 
 
 		 481 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3006  periplasmic serine protease  34.67 
 
 		 472 aa  175  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.337572  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  37.59 
 
 		 484 aa  175  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0073  2-alkenal reductase  42.29 
 
 		 459 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0754695 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  38.36 
 
 		 479 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3032  Serine protease do-like precursor  37.31 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.722688 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  37.92 
 
 		 467 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  36.57 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  34.92 
 
 		 476 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  36.75 
 
 		 471 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0935  2-alkenal reductase  38.42 
 
 		 400 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000784268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  39.31 
 
 		 496 aa  173  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  44.02 
 
 		 508 aa  173  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.18 
 
 		 387 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  40.6 
 
 		 473 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  39.46 
 
 		 474 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  36.34 
 
 		 469 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  41.79 
 
 		 451 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  40 
 
 		 462 aa  172  7.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  37.7 
 
 		 408 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.76 
 
 		 428 aa  172  9e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0094  PDZ/DHR/GLGF  37.38 
 
 		 373 aa  172  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0532593  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3234  2-alkenal reductase  45.14 
 
 		 575 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222667  normal  0.0363808 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  43.73 
 
 		 501 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  36.44 
 
 		 395 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  38.46 
 
 		 408 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0393  HtrA2 peptidase  34.96 
 
 		 397 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>