More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0094 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0094  PDZ/DHR/GLGF  100 
 
 
373 aa  741    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0532593  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01041  serine protease  82.84 
 
 
373 aa  601  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.741511  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01061  serine protease  83.99 
 
 
357 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.057763  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01021  serine protease  71.12 
 
 
383 aa  528  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.425044  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01011  serine protease  54.39 
 
 
380 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.336111  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02461  serine protease  51.78 
 
 
395 aa  361  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1456  PDZ/DHR/GLGF  54.25 
 
 
392 aa  355  7.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01581  serine protease  54.25 
 
 
392 aa  355  1e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2320  PDZ/DHR/GLGF  48.66 
 
 
351 aa  339  5e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0372  PDZ/DHR/GLGF  48.8 
 
 
377 aa  322  5e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.880544  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0600  PDZ/DHR/GLGF  43.19 
 
 
353 aa  281  1e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16701  trypsin-like serine protease  44.96 
 
 
376 aa  276  5e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  45.06 
 
 
396 aa  276  6e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2072  PDZ/DHR/GLGF  43.48 
 
 
366 aa  275  8e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  40.43 
 
 
406 aa  274  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04311  trypsin-like serine protease  42.24 
 
 
362 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16941  trypsin-like serine protease  44.57 
 
 
376 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16811  trypsin-like serine protease  45.01 
 
 
376 aa  270  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1021  trypsin-like serine protease  43.97 
 
 
381 aa  268  8.999999999999999e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.75122  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18911  trypsin-like serine protease  43.97 
 
 
381 aa  268  8.999999999999999e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.58243  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0619  2-alkenal reductase  45 
 
 
394 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0384  2-alkenal reductase  45 
 
 
383 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3517  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.13 
 
 
404 aa  266  2.9999999999999995e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0393  HtrA2 peptidase  45 
 
 
397 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1583  trypsin-like serine protease  45.98 
 
 
376 aa  266  5.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  43.33 
 
 
411 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  43.67 
 
 
415 aa  264  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16121  trypsin-like serine protease  43.9 
 
 
370 aa  262  6e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  40.1 
 
 
391 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  44.41 
 
 
411 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  44.28 
 
 
424 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.91 
 
 
405 aa  260  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  43.94 
 
 
408 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  43.64 
 
 
408 aa  258  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.31 
 
 
410 aa  258  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  44.28 
 
 
402 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  44.28 
 
 
402 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.82 
 
 
428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  39.85 
 
 
402 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.97 
 
 
415 aa  246  4e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  41.35 
 
 
385 aa  241  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.14 
 
 
387 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1624  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.01 
 
 
405 aa  240  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.94 
 
 
401 aa  238  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000241562  unclonable  0.000000145022 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0306  HtrA2 peptidase  42.42 
 
 
401 aa  233  4.0000000000000004e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00230132  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0885  PDZ/DHR/GLGF  39.22 
 
 
375 aa  231  2e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  41.88 
 
 
382 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0752  2-alkenal reductase  39.41 
 
 
372 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0327336 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  37.27 
 
 
397 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  37.09 
 
 
420 aa  223  4e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  39.31 
 
 
498 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  42.72 
 
 
461 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  42.28 
 
 
457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  41.36 
 
 
490 aa  219  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  40.44 
 
 
500 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5265  protease Do  43.62 
 
 
498 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  39.88 
 
 
501 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0972  PDZ/DHR/GLGF  39.94 
 
 
392 aa  218  2e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.160353  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3211  predicted protein  38.97 
 
 
331 aa  217  2e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.570521  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  40.85 
 
 
499 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  40.85 
 
 
499 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  39.27 
 
 
418 aa  215  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3243  protease Do  42.51 
 
 
488 aa  215  9e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0128556 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  38.92 
 
 
505 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  36.21 
 
 
502 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  38.83 
 
 
490 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  40.36 
 
 
478 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  39.6 
 
 
502 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  37.53 
 
 
509 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  39.6 
 
 
502 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  40.46 
 
 
498 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  39.6 
 
 
502 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  40.46 
 
 
498 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  40.46 
 
 
498 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  39.6 
 
 
502 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  39.6 
 
 
502 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  39.6 
 
 
461 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  39.6 
 
 
485 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.57 
 
 
386 aa  213  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  38.99 
 
 
500 aa  212  7e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  44.19 
 
 
487 aa  212  7.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.6 
 
 
381 aa  212  9e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  42.07 
 
 
476 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  39.36 
 
 
476 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  38.28 
 
 
516 aa  210  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  39.32 
 
 
485 aa  210  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1739  peptidase S1C, Do  40.74 
 
 
493 aa  210  4e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0778272  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00650  2-alkenal reductase  41.67 
 
 
400 aa  209  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  41.05 
 
 
496 aa  209  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  39.39 
 
 
453 aa  209  7e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  38.44 
 
 
479 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  39.07 
 
 
492 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  38.86 
 
 
503 aa  209  9e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  39.3 
 
 
476 aa  208  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08291  trypsin-like serine protease  41.37 
 
 
384 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  38.75 
 
 
505 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  38.73 
 
 
477 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  38.51 
 
 
503 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  38.89 
 
 
477 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.63 
 
 
384 aa  206  6e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>